Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R0P0

Protein Details
Accession C4R0P0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
465-493RCGNLPKEIKRDRKPHHRSKDGKEPHEPKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
471-490KEIKRDRKPHHRSKDGKEPH
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 12, cyto 7, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039171  Cwc2/Slt11  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR018835  RNA-binding_domain_put  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG ppa:PAS_chr2-1_0436  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10378  RRM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MKNFSYTSQPGTPLDYNYGRSMLPSHLLTPFLATPVLPSQPSTPYIDQHMSNLDQKYLTEHYQLLHEVNHSRSLLFEKLPKELSLKEFLDAFKSSQFLENVKIKEDSGEGTSVLVQFVNDESALVFLQNFDWRDFVSSTGFDNLKISWCFNNSSDDYLVDGTYMDRILNLNATRSLAVRTLTQNKTGDQLYDLVISILKADLPEAIPLIVDYQYRYETIQINFSNISTSIEVFELLNDTHQKLLLLSSFCSDPCLFHHQMTTPQISSNAPPINSSYSNLQNRTIYLGGLHPDTTVESVCNVVKGGILQNVKLIPEKRICFVTFIDAFAAEQFYMNSQLRGLTIKQKRVRVGWGRPIGPVPNNIPLAVTAGASRNIYISESKTKKTQSLPSADILRHDFEYFGELEQINFFNGDKCVFLNFCNIAAAIELIDCLNLFKNKNLDPENPAFSLLSKYEEFKINFAKDRCGNLPKEIKRDRKPHHRSKDGKEPHEPKNHHNSQSDPPKASESASPEQIQDVQEIFASMGISTNGRPATAPISAQQKTDEEKSQSPPSGLSSISPTSSSTSKPTTASGGAVNFKDQQRPGRTYAMSGSQIMAQYLASVQHNNIYYANAVLNVESERNSEDDYN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.35
3 0.35
4 0.34
5 0.34
6 0.27
7 0.26
8 0.26
9 0.22
10 0.23
11 0.21
12 0.22
13 0.22
14 0.23
15 0.22
16 0.23
17 0.21
18 0.18
19 0.16
20 0.14
21 0.15
22 0.18
23 0.21
24 0.17
25 0.18
26 0.2
27 0.24
28 0.27
29 0.3
30 0.28
31 0.28
32 0.34
33 0.36
34 0.33
35 0.32
36 0.34
37 0.3
38 0.34
39 0.33
40 0.29
41 0.26
42 0.25
43 0.28
44 0.27
45 0.27
46 0.24
47 0.24
48 0.23
49 0.25
50 0.27
51 0.23
52 0.21
53 0.22
54 0.23
55 0.24
56 0.28
57 0.25
58 0.23
59 0.24
60 0.26
61 0.26
62 0.25
63 0.28
64 0.26
65 0.3
66 0.32
67 0.32
68 0.31
69 0.32
70 0.33
71 0.35
72 0.33
73 0.3
74 0.3
75 0.29
76 0.3
77 0.27
78 0.24
79 0.19
80 0.19
81 0.19
82 0.21
83 0.22
84 0.2
85 0.25
86 0.3
87 0.3
88 0.32
89 0.31
90 0.27
91 0.26
92 0.26
93 0.21
94 0.16
95 0.16
96 0.13
97 0.13
98 0.14
99 0.13
100 0.12
101 0.1
102 0.08
103 0.07
104 0.08
105 0.08
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.05
114 0.07
115 0.11
116 0.13
117 0.12
118 0.13
119 0.13
120 0.17
121 0.17
122 0.17
123 0.15
124 0.14
125 0.15
126 0.19
127 0.19
128 0.16
129 0.17
130 0.16
131 0.19
132 0.19
133 0.2
134 0.17
135 0.19
136 0.22
137 0.22
138 0.28
139 0.24
140 0.26
141 0.25
142 0.23
143 0.22
144 0.19
145 0.18
146 0.12
147 0.11
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.11
156 0.12
157 0.13
158 0.13
159 0.15
160 0.15
161 0.15
162 0.16
163 0.13
164 0.13
165 0.14
166 0.19
167 0.28
168 0.29
169 0.33
170 0.33
171 0.32
172 0.34
173 0.32
174 0.27
175 0.19
176 0.19
177 0.14
178 0.13
179 0.13
180 0.1
181 0.09
182 0.08
183 0.07
184 0.06
185 0.05
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.09
200 0.09
201 0.1
202 0.11
203 0.12
204 0.16
205 0.16
206 0.23
207 0.21
208 0.22
209 0.22
210 0.21
211 0.2
212 0.15
213 0.16
214 0.1
215 0.1
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.08
230 0.09
231 0.11
232 0.1
233 0.1
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.14
238 0.13
239 0.11
240 0.13
241 0.21
242 0.21
243 0.21
244 0.23
245 0.21
246 0.26
247 0.29
248 0.28
249 0.2
250 0.19
251 0.2
252 0.19
253 0.19
254 0.2
255 0.18
256 0.16
257 0.16
258 0.17
259 0.2
260 0.2
261 0.2
262 0.17
263 0.23
264 0.27
265 0.28
266 0.29
267 0.25
268 0.25
269 0.26
270 0.23
271 0.15
272 0.11
273 0.11
274 0.1
275 0.11
276 0.1
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.05
290 0.06
291 0.07
292 0.1
293 0.11
294 0.11
295 0.12
296 0.12
297 0.13
298 0.15
299 0.15
300 0.14
301 0.19
302 0.2
303 0.2
304 0.22
305 0.22
306 0.21
307 0.21
308 0.22
309 0.17
310 0.16
311 0.15
312 0.12
313 0.12
314 0.1
315 0.1
316 0.05
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.09
321 0.09
322 0.09
323 0.08
324 0.09
325 0.09
326 0.11
327 0.12
328 0.17
329 0.22
330 0.31
331 0.36
332 0.4
333 0.42
334 0.42
335 0.49
336 0.48
337 0.5
338 0.5
339 0.51
340 0.47
341 0.45
342 0.45
343 0.39
344 0.32
345 0.28
346 0.21
347 0.21
348 0.21
349 0.2
350 0.19
351 0.16
352 0.17
353 0.14
354 0.12
355 0.07
356 0.08
357 0.09
358 0.09
359 0.09
360 0.07
361 0.07
362 0.08
363 0.09
364 0.11
365 0.19
366 0.22
367 0.24
368 0.28
369 0.29
370 0.33
371 0.37
372 0.42
373 0.39
374 0.42
375 0.43
376 0.42
377 0.44
378 0.4
379 0.37
380 0.31
381 0.26
382 0.21
383 0.19
384 0.15
385 0.12
386 0.14
387 0.12
388 0.1
389 0.1
390 0.09
391 0.09
392 0.1
393 0.1
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.08
399 0.09
400 0.08
401 0.08
402 0.1
403 0.1
404 0.11
405 0.14
406 0.14
407 0.14
408 0.14
409 0.13
410 0.12
411 0.11
412 0.1
413 0.05
414 0.05
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.07
421 0.1
422 0.11
423 0.13
424 0.18
425 0.21
426 0.28
427 0.32
428 0.32
429 0.36
430 0.39
431 0.4
432 0.36
433 0.34
434 0.28
435 0.24
436 0.24
437 0.18
438 0.17
439 0.14
440 0.16
441 0.18
442 0.24
443 0.24
444 0.25
445 0.31
446 0.31
447 0.37
448 0.36
449 0.4
450 0.37
451 0.42
452 0.44
453 0.44
454 0.42
455 0.43
456 0.52
457 0.51
458 0.57
459 0.61
460 0.66
461 0.69
462 0.77
463 0.78
464 0.8
465 0.85
466 0.86
467 0.87
468 0.88
469 0.88
470 0.85
471 0.87
472 0.85
473 0.81
474 0.81
475 0.77
476 0.75
477 0.77
478 0.72
479 0.68
480 0.7
481 0.72
482 0.68
483 0.64
484 0.59
485 0.59
486 0.66
487 0.65
488 0.56
489 0.49
490 0.46
491 0.44
492 0.41
493 0.35
494 0.32
495 0.31
496 0.33
497 0.32
498 0.29
499 0.29
500 0.31
501 0.27
502 0.22
503 0.18
504 0.14
505 0.13
506 0.13
507 0.11
508 0.09
509 0.09
510 0.07
511 0.07
512 0.07
513 0.08
514 0.08
515 0.12
516 0.11
517 0.11
518 0.12
519 0.13
520 0.15
521 0.16
522 0.17
523 0.17
524 0.26
525 0.27
526 0.27
527 0.28
528 0.28
529 0.31
530 0.35
531 0.37
532 0.34
533 0.38
534 0.43
535 0.47
536 0.46
537 0.43
538 0.39
539 0.36
540 0.33
541 0.28
542 0.23
543 0.22
544 0.21
545 0.21
546 0.21
547 0.18
548 0.2
549 0.21
550 0.22
551 0.22
552 0.25
553 0.27
554 0.27
555 0.28
556 0.29
557 0.28
558 0.28
559 0.26
560 0.26
561 0.27
562 0.27
563 0.28
564 0.29
565 0.3
566 0.35
567 0.36
568 0.41
569 0.44
570 0.49
571 0.51
572 0.53
573 0.51
574 0.47
575 0.48
576 0.45
577 0.4
578 0.35
579 0.32
580 0.26
581 0.26
582 0.24
583 0.2
584 0.13
585 0.11
586 0.11
587 0.13
588 0.12
589 0.13
590 0.14
591 0.19
592 0.2
593 0.21
594 0.21
595 0.19
596 0.18
597 0.18
598 0.18
599 0.14
600 0.13
601 0.12
602 0.13
603 0.13
604 0.14
605 0.13
606 0.14
607 0.14
608 0.16