Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G4UDP2

Protein Details
Accession G4UDP2    Localization Confidence High Confidence Score 25
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
99-120QASLGALKKKKKKKGGDEDASDHydrophilic
239-261LLSMESKKKARARKDKERELLSEHydrophilic
300-324QVDKAIERKRKKIAGKEKKALPLARBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
105-113LKKKKKKKG
138-152KAKVEKHHRTNKHAP
157-165SRKPVSRRR
244-274SKKKARARKDKERELLSEHKKKEKELIKQGK
303-325KAIERKRKKIAGKEKKALPLARR
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009292  RRP36  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0000469  P:cleavage involved in rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF06102  RRP36  
Amino Acid Sequences MPAVKRKAPPTLGAKLQRRVRPRFEAEPDSDVEGSSDEAPSEEEGGGFHTGSDTEEEEDGEIEEGSEPGSDDDSDAPSEHGGAGIDASQLSFGALARAQASLGALKKKKKKKGGDEDASDDEEKEEPNWKTEIEKGMKAKVEKHHRTNKHAPIEMTSRKPVSRRRDFLANEPVKPKSRDPRFAPPGIGGSSGKGVVDEIKARKAYSFLDDYQEDEMKQLRMAIKKTKDPNEKEELQRALLSMESKKKARARKDKERELLSEHKKKEKELIKQGKTPFYLKKSEQKKQLLVEQFASMKKSQVDKAIERKRKKIAGKEKKALPLARRTAEDR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.67
3 0.73
4 0.72
5 0.74
6 0.75
7 0.74
8 0.74
9 0.73
10 0.73
11 0.73
12 0.73
13 0.68
14 0.63
15 0.56
16 0.5
17 0.43
18 0.34
19 0.26
20 0.19
21 0.16
22 0.14
23 0.12
24 0.08
25 0.08
26 0.09
27 0.1
28 0.11
29 0.09
30 0.08
31 0.08
32 0.11
33 0.11
34 0.1
35 0.09
36 0.08
37 0.08
38 0.09
39 0.11
40 0.09
41 0.1
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.11
46 0.1
47 0.09
48 0.08
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.05
56 0.07
57 0.06
58 0.07
59 0.08
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.11
64 0.09
65 0.1
66 0.09
67 0.08
68 0.06
69 0.06
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.04
79 0.04
80 0.05
81 0.05
82 0.06
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.09
89 0.11
90 0.18
91 0.22
92 0.3
93 0.4
94 0.49
95 0.57
96 0.64
97 0.71
98 0.75
99 0.82
100 0.85
101 0.84
102 0.8
103 0.76
104 0.68
105 0.61
106 0.5
107 0.38
108 0.28
109 0.2
110 0.16
111 0.12
112 0.16
113 0.14
114 0.16
115 0.17
116 0.16
117 0.17
118 0.2
119 0.27
120 0.23
121 0.27
122 0.27
123 0.3
124 0.33
125 0.32
126 0.35
127 0.35
128 0.43
129 0.46
130 0.53
131 0.59
132 0.62
133 0.7
134 0.73
135 0.74
136 0.69
137 0.65
138 0.56
139 0.5
140 0.52
141 0.48
142 0.41
143 0.36
144 0.3
145 0.29
146 0.33
147 0.38
148 0.41
149 0.45
150 0.46
151 0.47
152 0.53
153 0.53
154 0.55
155 0.58
156 0.5
157 0.43
158 0.42
159 0.42
160 0.37
161 0.38
162 0.36
163 0.35
164 0.4
165 0.46
166 0.49
167 0.57
168 0.59
169 0.58
170 0.55
171 0.46
172 0.41
173 0.33
174 0.29
175 0.18
176 0.13
177 0.12
178 0.11
179 0.1
180 0.07
181 0.07
182 0.06
183 0.08
184 0.11
185 0.12
186 0.16
187 0.17
188 0.17
189 0.17
190 0.18
191 0.18
192 0.17
193 0.2
194 0.17
195 0.2
196 0.21
197 0.22
198 0.23
199 0.22
200 0.18
201 0.15
202 0.16
203 0.13
204 0.13
205 0.14
206 0.15
207 0.19
208 0.23
209 0.3
210 0.33
211 0.4
212 0.48
213 0.55
214 0.61
215 0.61
216 0.64
217 0.63
218 0.65
219 0.61
220 0.6
221 0.52
222 0.44
223 0.4
224 0.33
225 0.26
226 0.21
227 0.2
228 0.18
229 0.23
230 0.26
231 0.27
232 0.34
233 0.4
234 0.47
235 0.55
236 0.62
237 0.64
238 0.71
239 0.81
240 0.84
241 0.86
242 0.82
243 0.75
244 0.71
245 0.71
246 0.69
247 0.68
248 0.62
249 0.63
250 0.6
251 0.58
252 0.61
253 0.59
254 0.59
255 0.61
256 0.67
257 0.65
258 0.7
259 0.74
260 0.71
261 0.66
262 0.62
263 0.59
264 0.53
265 0.55
266 0.53
267 0.57
268 0.6
269 0.65
270 0.69
271 0.69
272 0.7
273 0.67
274 0.71
275 0.69
276 0.62
277 0.56
278 0.5
279 0.46
280 0.42
281 0.4
282 0.32
283 0.27
284 0.28
285 0.31
286 0.3
287 0.35
288 0.4
289 0.45
290 0.55
291 0.63
292 0.68
293 0.71
294 0.75
295 0.76
296 0.78
297 0.78
298 0.79
299 0.79
300 0.81
301 0.84
302 0.86
303 0.85
304 0.84
305 0.83
306 0.79
307 0.75
308 0.74
309 0.71
310 0.67