Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G4U5D1

Protein Details
Accession G4U5D1    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
193-223EEALRREKKREEKERHKSSRRHRHEHGDKDRBasic
261-288RSRDDRPRSRDRHPDRKRPRSEKEETSPBasic
311-342DRQSRRDFSRDKDRHRRDKERYRDRGRDLDKEBasic
361-395LTDDRERRRHRDLGHRSERKSSRSRSRSPWPTSRNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
189-241KKEVEEALRREKKREEKERHKSSRRHRHEHGDKDRDRERGGRHQHRSHRSPRR
253-296DRNHDDRIRSRDDRPRSRDRHPDRKRPRSEKEETSPAKEQRRRR
320-343RDKDRHRRDKERYRDRGRDLDKER
365-389RERRRHRDLGHRSERKSSRSRSRSP
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR045844  RRM_Ist3-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12411  RRM_ist3_like  
Amino Acid Sequences MNQIRAIQALNKREIEAGIPPEASWHVDYRDTAFVYFGGLPYDLSEGDVITIFSQFGEPVFLKLVRDKETGKSKGFGWLKYEDQRSTDLAVDNLGGAEIGGRLIRVDHARYKIRDDEDPEEGRIGWEDMVRKERREKGLVSEVDDTGDEEEDDTKPRRPLLKEEKELQLLLENHDDDDPMKEFSIEEKKKEVEEALRREKKREEKERHKSSRRHRHEHGDKDRDRERGGRHQHRSHRSPRRVEDVDSDIRGRDRNHDDRIRSRDDRPRSRDRHPDRKRPRSEKEETSPAKEQRRRRDDADDVEMKDANYDDRQSRRDFSRDKDRHRRDKERYRDRGRDLDKERATDRDRHNSERHDRERDLTDDRERRRHRDLGHRSERKSSRSRSRSPWPTSRN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.32
3 0.31
4 0.28
5 0.24
6 0.23
7 0.21
8 0.22
9 0.23
10 0.23
11 0.2
12 0.19
13 0.18
14 0.21
15 0.22
16 0.24
17 0.28
18 0.26
19 0.24
20 0.22
21 0.19
22 0.2
23 0.19
24 0.15
25 0.12
26 0.11
27 0.11
28 0.11
29 0.13
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.08
34 0.08
35 0.09
36 0.08
37 0.07
38 0.07
39 0.06
40 0.07
41 0.07
42 0.06
43 0.06
44 0.1
45 0.1
46 0.11
47 0.14
48 0.15
49 0.16
50 0.21
51 0.25
52 0.26
53 0.29
54 0.3
55 0.35
56 0.44
57 0.48
58 0.46
59 0.43
60 0.39
61 0.45
62 0.47
63 0.41
64 0.36
65 0.35
66 0.38
67 0.43
68 0.48
69 0.4
70 0.38
71 0.38
72 0.35
73 0.33
74 0.3
75 0.24
76 0.19
77 0.17
78 0.15
79 0.13
80 0.11
81 0.08
82 0.05
83 0.04
84 0.04
85 0.03
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.08
92 0.1
93 0.14
94 0.19
95 0.25
96 0.32
97 0.34
98 0.38
99 0.42
100 0.42
101 0.43
102 0.43
103 0.41
104 0.41
105 0.41
106 0.37
107 0.31
108 0.28
109 0.24
110 0.19
111 0.16
112 0.1
113 0.1
114 0.12
115 0.14
116 0.23
117 0.25
118 0.27
119 0.33
120 0.4
121 0.43
122 0.45
123 0.43
124 0.42
125 0.49
126 0.47
127 0.43
128 0.38
129 0.33
130 0.29
131 0.27
132 0.21
133 0.12
134 0.11
135 0.08
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.1
140 0.12
141 0.15
142 0.16
143 0.2
144 0.25
145 0.26
146 0.36
147 0.44
148 0.52
149 0.53
150 0.56
151 0.56
152 0.52
153 0.5
154 0.4
155 0.34
156 0.25
157 0.22
158 0.2
159 0.16
160 0.15
161 0.15
162 0.15
163 0.1
164 0.11
165 0.1
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.12
171 0.22
172 0.22
173 0.22
174 0.24
175 0.25
176 0.25
177 0.26
178 0.24
179 0.2
180 0.26
181 0.32
182 0.4
183 0.47
184 0.47
185 0.5
186 0.55
187 0.57
188 0.6
189 0.63
190 0.63
191 0.67
192 0.77
193 0.85
194 0.88
195 0.88
196 0.87
197 0.87
198 0.87
199 0.86
200 0.83
201 0.77
202 0.78
203 0.78
204 0.81
205 0.8
206 0.79
207 0.72
208 0.71
209 0.7
210 0.61
211 0.54
212 0.48
213 0.43
214 0.42
215 0.5
216 0.54
217 0.58
218 0.64
219 0.71
220 0.74
221 0.77
222 0.78
223 0.78
224 0.77
225 0.77
226 0.73
227 0.72
228 0.66
229 0.6
230 0.54
231 0.5
232 0.44
233 0.38
234 0.34
235 0.25
236 0.24
237 0.25
238 0.21
239 0.23
240 0.28
241 0.33
242 0.4
243 0.46
244 0.5
245 0.55
246 0.6
247 0.61
248 0.56
249 0.57
250 0.58
251 0.62
252 0.67
253 0.67
254 0.71
255 0.69
256 0.73
257 0.77
258 0.78
259 0.79
260 0.79
261 0.82
262 0.83
263 0.88
264 0.91
265 0.89
266 0.89
267 0.87
268 0.85
269 0.83
270 0.79
271 0.78
272 0.71
273 0.68
274 0.66
275 0.64
276 0.66
277 0.64
278 0.66
279 0.66
280 0.71
281 0.7
282 0.67
283 0.68
284 0.65
285 0.64
286 0.64
287 0.58
288 0.51
289 0.47
290 0.43
291 0.35
292 0.29
293 0.23
294 0.17
295 0.14
296 0.16
297 0.2
298 0.25
299 0.29
300 0.31
301 0.36
302 0.39
303 0.46
304 0.47
305 0.5
306 0.56
307 0.61
308 0.68
309 0.74
310 0.8
311 0.82
312 0.87
313 0.9
314 0.89
315 0.91
316 0.92
317 0.92
318 0.92
319 0.91
320 0.9
321 0.86
322 0.86
323 0.81
324 0.8
325 0.74
326 0.74
327 0.67
328 0.63
329 0.58
330 0.56
331 0.54
332 0.53
333 0.55
334 0.55
335 0.58
336 0.61
337 0.65
338 0.67
339 0.73
340 0.74
341 0.75
342 0.72
343 0.68
344 0.66
345 0.65
346 0.6
347 0.56
348 0.51
349 0.54
350 0.55
351 0.59
352 0.65
353 0.66
354 0.68
355 0.7
356 0.71
357 0.69
358 0.71
359 0.75
360 0.76
361 0.81
362 0.82
363 0.78
364 0.81
365 0.79
366 0.77
367 0.76
368 0.74
369 0.74
370 0.75
371 0.8
372 0.79
373 0.83
374 0.85
375 0.84