Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G4UP88

Protein Details
Accession G4UP88    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-69ALNPPRETTPPRRKREPSPPHEYVHydrophilic
298-319TEEKRRRREYRIMRKEQFKRPEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
299-318EEKRRRREYRIMRKEQFKRP
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 14, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028942  WHIM1_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF15612  WHIM1  
Amino Acid Sequences MADDDSSDLSSISSLSAPPTDDEADIQVERHQGILKFFHKVDKNPALNPPRETTPPRRKREPSPPHEYVLADNPDIAFIVMFRSRFTEAFPKSLANFGPQELERDVVETIPGERVENFLCALLGLLLNRKQDVKAGHYGRALEEAIQSHKSQWAKEWEGQNPLAGGATFTSMTPVQRLALLRTLIHWSLASSEVVKTMINKNYRTRHEDDLNVGVSVQPWGTDGDKRRYYLIEGNDDTHFRVYRESNPAGHTRTWWSVAGNIEELKLLAEKLEKNDGGPKARALAKRITNSIPRFEATEEKRRRREYRIMRKEQFKRPEPGLSLYEGRTRGKRMKYTFSDDEDDFYTDSTATRRSARNTRNHTPAEPAGPITTASGRQVRAPTRFETTASNPASAQGDDDVEMTGGVADAKNGDQVELTVGPTGRPRRSAAVHHSMNGWSSAATTTSKKKRSKDDEYDSEDEDEASDEPDFGDDEEDEHVPAADDEEEDEEDEEEYEEDADMADEDDLDDGGDAKDDDDHDNSLVFKFPIRVGFDENAKVTKIDGPTPSPTITHKHPRTAHRNIVVSEQAIPAQSRGQSVGDGKENDVPMVDADDEPAAKEEIVAIPLKKATAEPLVEKGGGGIKRPLSPPPGLGPPGGQQGLPIRSPEKPQPQQLVGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.1
3 0.11
4 0.13
5 0.14
6 0.17
7 0.18
8 0.18
9 0.18
10 0.18
11 0.2
12 0.19
13 0.19
14 0.18
15 0.18
16 0.18
17 0.19
18 0.21
19 0.2
20 0.23
21 0.31
22 0.3
23 0.34
24 0.35
25 0.42
26 0.43
27 0.45
28 0.51
29 0.54
30 0.56
31 0.54
32 0.63
33 0.62
34 0.62
35 0.62
36 0.56
37 0.51
38 0.53
39 0.57
40 0.58
41 0.62
42 0.67
43 0.71
44 0.77
45 0.78
46 0.81
47 0.85
48 0.85
49 0.83
50 0.82
51 0.78
52 0.71
53 0.68
54 0.59
55 0.5
56 0.47
57 0.42
58 0.32
59 0.28
60 0.25
61 0.22
62 0.21
63 0.17
64 0.09
65 0.05
66 0.09
67 0.11
68 0.12
69 0.12
70 0.15
71 0.18
72 0.18
73 0.22
74 0.28
75 0.28
76 0.32
77 0.33
78 0.32
79 0.31
80 0.34
81 0.31
82 0.25
83 0.24
84 0.21
85 0.25
86 0.23
87 0.26
88 0.23
89 0.23
90 0.18
91 0.19
92 0.18
93 0.13
94 0.13
95 0.1
96 0.1
97 0.11
98 0.12
99 0.11
100 0.11
101 0.13
102 0.14
103 0.14
104 0.14
105 0.11
106 0.1
107 0.09
108 0.09
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.11
113 0.14
114 0.15
115 0.17
116 0.18
117 0.17
118 0.21
119 0.24
120 0.25
121 0.31
122 0.33
123 0.36
124 0.37
125 0.38
126 0.34
127 0.33
128 0.28
129 0.2
130 0.19
131 0.16
132 0.18
133 0.19
134 0.19
135 0.17
136 0.22
137 0.23
138 0.21
139 0.26
140 0.31
141 0.34
142 0.4
143 0.45
144 0.43
145 0.47
146 0.47
147 0.41
148 0.32
149 0.27
150 0.22
151 0.15
152 0.12
153 0.06
154 0.07
155 0.07
156 0.06
157 0.08
158 0.09
159 0.1
160 0.1
161 0.11
162 0.1
163 0.13
164 0.14
165 0.14
166 0.18
167 0.19
168 0.17
169 0.18
170 0.22
171 0.19
172 0.19
173 0.16
174 0.12
175 0.13
176 0.14
177 0.13
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.11
184 0.16
185 0.22
186 0.26
187 0.3
188 0.37
189 0.45
190 0.5
191 0.55
192 0.53
193 0.54
194 0.53
195 0.52
196 0.47
197 0.43
198 0.38
199 0.31
200 0.26
201 0.19
202 0.15
203 0.13
204 0.09
205 0.05
206 0.05
207 0.07
208 0.08
209 0.13
210 0.18
211 0.26
212 0.3
213 0.3
214 0.31
215 0.31
216 0.33
217 0.34
218 0.32
219 0.31
220 0.29
221 0.31
222 0.3
223 0.3
224 0.27
225 0.24
226 0.2
227 0.13
228 0.16
229 0.16
230 0.21
231 0.27
232 0.29
233 0.29
234 0.31
235 0.34
236 0.34
237 0.32
238 0.28
239 0.25
240 0.24
241 0.24
242 0.22
243 0.19
244 0.19
245 0.2
246 0.19
247 0.16
248 0.14
249 0.12
250 0.12
251 0.11
252 0.08
253 0.07
254 0.06
255 0.05
256 0.08
257 0.09
258 0.11
259 0.15
260 0.15
261 0.15
262 0.22
263 0.24
264 0.25
265 0.24
266 0.22
267 0.22
268 0.28
269 0.29
270 0.26
271 0.3
272 0.32
273 0.34
274 0.37
275 0.37
276 0.39
277 0.39
278 0.38
279 0.33
280 0.28
281 0.26
282 0.25
283 0.29
284 0.26
285 0.35
286 0.4
287 0.47
288 0.53
289 0.59
290 0.62
291 0.61
292 0.67
293 0.67
294 0.7
295 0.73
296 0.77
297 0.76
298 0.81
299 0.82
300 0.81
301 0.78
302 0.72
303 0.65
304 0.58
305 0.56
306 0.48
307 0.44
308 0.36
309 0.3
310 0.26
311 0.23
312 0.24
313 0.22
314 0.21
315 0.19
316 0.22
317 0.26
318 0.29
319 0.35
320 0.35
321 0.42
322 0.45
323 0.51
324 0.51
325 0.47
326 0.46
327 0.39
328 0.37
329 0.3
330 0.26
331 0.18
332 0.15
333 0.11
334 0.08
335 0.08
336 0.07
337 0.08
338 0.09
339 0.13
340 0.15
341 0.2
342 0.29
343 0.36
344 0.45
345 0.51
346 0.56
347 0.6
348 0.6
349 0.56
350 0.51
351 0.45
352 0.38
353 0.3
354 0.24
355 0.17
356 0.15
357 0.14
358 0.11
359 0.1
360 0.08
361 0.1
362 0.12
363 0.12
364 0.15
365 0.19
366 0.23
367 0.26
368 0.28
369 0.28
370 0.3
371 0.3
372 0.29
373 0.29
374 0.28
375 0.32
376 0.31
377 0.29
378 0.24
379 0.25
380 0.25
381 0.2
382 0.17
383 0.09
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.07
388 0.06
389 0.06
390 0.05
391 0.04
392 0.04
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.04
397 0.04
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.09
409 0.14
410 0.2
411 0.19
412 0.21
413 0.23
414 0.26
415 0.29
416 0.35
417 0.38
418 0.42
419 0.41
420 0.39
421 0.39
422 0.35
423 0.32
424 0.26
425 0.19
426 0.09
427 0.09
428 0.08
429 0.08
430 0.1
431 0.12
432 0.2
433 0.29
434 0.38
435 0.44
436 0.49
437 0.59
438 0.66
439 0.73
440 0.75
441 0.76
442 0.75
443 0.77
444 0.74
445 0.64
446 0.56
447 0.46
448 0.35
449 0.26
450 0.19
451 0.11
452 0.09
453 0.08
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.05
461 0.06
462 0.08
463 0.09
464 0.08
465 0.08
466 0.08
467 0.07
468 0.07
469 0.07
470 0.06
471 0.05
472 0.06
473 0.08
474 0.08
475 0.08
476 0.09
477 0.08
478 0.08
479 0.08
480 0.08
481 0.06
482 0.06
483 0.06
484 0.06
485 0.05
486 0.05
487 0.05
488 0.04
489 0.05
490 0.04
491 0.04
492 0.04
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.07
503 0.08
504 0.11
505 0.12
506 0.13
507 0.13
508 0.13
509 0.14
510 0.13
511 0.14
512 0.11
513 0.11
514 0.12
515 0.14
516 0.19
517 0.22
518 0.23
519 0.26
520 0.29
521 0.31
522 0.32
523 0.32
524 0.28
525 0.25
526 0.23
527 0.19
528 0.21
529 0.2
530 0.21
531 0.23
532 0.26
533 0.29
534 0.32
535 0.32
536 0.28
537 0.29
538 0.29
539 0.34
540 0.41
541 0.42
542 0.49
543 0.55
544 0.64
545 0.7
546 0.74
547 0.75
548 0.71
549 0.71
550 0.63
551 0.61
552 0.54
553 0.45
554 0.38
555 0.3
556 0.23
557 0.2
558 0.19
559 0.15
560 0.16
561 0.16
562 0.16
563 0.17
564 0.16
565 0.18
566 0.2
567 0.24
568 0.27
569 0.27
570 0.27
571 0.3
572 0.3
573 0.27
574 0.24
575 0.2
576 0.15
577 0.15
578 0.15
579 0.1
580 0.1
581 0.12
582 0.11
583 0.11
584 0.13
585 0.11
586 0.09
587 0.09
588 0.1
589 0.1
590 0.12
591 0.15
592 0.14
593 0.15
594 0.17
595 0.17
596 0.16
597 0.15
598 0.17
599 0.2
600 0.23
601 0.24
602 0.27
603 0.3
604 0.29
605 0.29
606 0.26
607 0.26
608 0.24
609 0.23
610 0.25
611 0.25
612 0.3
613 0.32
614 0.36
615 0.35
616 0.36
617 0.37
618 0.37
619 0.41
620 0.38
621 0.37
622 0.34
623 0.32
624 0.37
625 0.34
626 0.28
627 0.24
628 0.29
629 0.33
630 0.32
631 0.31
632 0.27
633 0.3
634 0.37
635 0.44
636 0.48
637 0.51
638 0.59
639 0.64