Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0UGA0

Protein Details
Accession Q0UGA0    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
322-354EEYEKRRETSKARKEKKFKNKLNDLKKRTRVEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
326-360KRRETSKARKEKKFKNKLNDLKKRTRVEAYKRARL
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR000465  XPA  
IPR022656  XPA_C  
IPR037129  XPA_sf  
Gene Ontology GO:0000110  C:nucleotide-excision repair factor 1 complex  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006284  P:base-excision repair  
GO:1901255  P:nucleotide-excision repair involved in interstrand cross-link repair  
GO:0000715  P:nucleotide-excision repair, DNA damage recognition  
GO:0070914  P:UV-damage excision repair  
KEGG pno:SNOG_09214  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05181  XPA_C  
CDD cd21077  DBD_Rad14  
Amino Acid Sequences MADRQRTPPRATRSAGQLPPNPPTPEQIRKMEIARLKAKAAAQQAQERSAPAPVAGAKRPISAISASNAPTQLRNAAAASPQKRDQNGMIQPPSNDYIQPAKKYARSEFIDYDFSKMTDTKGGFLSTVDDPHNKAMWKGMPKEEQKPEGMTITDWERERIRRKLRANRAGPFEPGISILNTVNGKEEEDEEAALLEAAENAEVENGTFKGKYGDGKRDVKGKCRECNSLEIDWKWQDIFGISVCNACKDKIPDKYSLLTKTEARDDYLLTDPELKDEDLLPHLERPNPHKQSFHAMQLFLRLQVEAYALGPKKWGSAEALDEEYEKRRETSKARKEKKFKNKLNDLKKRTRVEAYKRARLGGGADAAFGQKIKGRYDKHEHEWGRSVLDPETGMTRKRCDECGMEVEELEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.66
3 0.64
4 0.63
5 0.6
6 0.61
7 0.62
8 0.57
9 0.48
10 0.48
11 0.49
12 0.51
13 0.53
14 0.54
15 0.51
16 0.51
17 0.53
18 0.54
19 0.51
20 0.5
21 0.5
22 0.46
23 0.44
24 0.44
25 0.43
26 0.42
27 0.43
28 0.42
29 0.4
30 0.45
31 0.47
32 0.46
33 0.44
34 0.4
35 0.34
36 0.3
37 0.25
38 0.17
39 0.17
40 0.18
41 0.22
42 0.23
43 0.27
44 0.26
45 0.27
46 0.28
47 0.26
48 0.24
49 0.21
50 0.2
51 0.17
52 0.21
53 0.21
54 0.22
55 0.23
56 0.22
57 0.21
58 0.21
59 0.21
60 0.18
61 0.17
62 0.16
63 0.15
64 0.2
65 0.26
66 0.28
67 0.31
68 0.34
69 0.38
70 0.38
71 0.4
72 0.38
73 0.4
74 0.43
75 0.46
76 0.45
77 0.42
78 0.42
79 0.42
80 0.41
81 0.32
82 0.26
83 0.21
84 0.26
85 0.29
86 0.31
87 0.32
88 0.34
89 0.38
90 0.42
91 0.43
92 0.42
93 0.41
94 0.44
95 0.43
96 0.42
97 0.44
98 0.39
99 0.39
100 0.31
101 0.27
102 0.23
103 0.2
104 0.18
105 0.17
106 0.18
107 0.16
108 0.17
109 0.17
110 0.16
111 0.16
112 0.18
113 0.13
114 0.15
115 0.15
116 0.15
117 0.16
118 0.19
119 0.21
120 0.18
121 0.18
122 0.19
123 0.23
124 0.27
125 0.3
126 0.34
127 0.39
128 0.43
129 0.51
130 0.52
131 0.5
132 0.45
133 0.43
134 0.38
135 0.31
136 0.28
137 0.2
138 0.16
139 0.16
140 0.18
141 0.16
142 0.17
143 0.19
144 0.25
145 0.32
146 0.39
147 0.44
148 0.49
149 0.58
150 0.66
151 0.74
152 0.78
153 0.77
154 0.74
155 0.73
156 0.66
157 0.58
158 0.49
159 0.38
160 0.28
161 0.23
162 0.18
163 0.11
164 0.1
165 0.09
166 0.11
167 0.1
168 0.1
169 0.11
170 0.1
171 0.1
172 0.09
173 0.11
174 0.09
175 0.1
176 0.09
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.06
181 0.05
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.02
187 0.02
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.04
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.07
197 0.08
198 0.13
199 0.16
200 0.23
201 0.3
202 0.35
203 0.36
204 0.43
205 0.44
206 0.47
207 0.53
208 0.52
209 0.51
210 0.51
211 0.54
212 0.48
213 0.53
214 0.48
215 0.43
216 0.4
217 0.34
218 0.34
219 0.3
220 0.28
221 0.22
222 0.17
223 0.13
224 0.1
225 0.1
226 0.06
227 0.07
228 0.07
229 0.09
230 0.09
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.14
235 0.18
236 0.24
237 0.31
238 0.34
239 0.36
240 0.38
241 0.42
242 0.44
243 0.42
244 0.38
245 0.32
246 0.31
247 0.29
248 0.32
249 0.29
250 0.26
251 0.23
252 0.21
253 0.21
254 0.22
255 0.2
256 0.15
257 0.19
258 0.17
259 0.17
260 0.18
261 0.15
262 0.13
263 0.13
264 0.14
265 0.11
266 0.13
267 0.13
268 0.15
269 0.18
270 0.2
271 0.22
272 0.27
273 0.36
274 0.42
275 0.43
276 0.41
277 0.41
278 0.48
279 0.48
280 0.5
281 0.43
282 0.37
283 0.35
284 0.38
285 0.37
286 0.28
287 0.25
288 0.17
289 0.13
290 0.13
291 0.13
292 0.08
293 0.08
294 0.13
295 0.13
296 0.13
297 0.15
298 0.14
299 0.15
300 0.15
301 0.16
302 0.12
303 0.14
304 0.18
305 0.19
306 0.21
307 0.19
308 0.2
309 0.2
310 0.22
311 0.22
312 0.19
313 0.18
314 0.2
315 0.25
316 0.34
317 0.43
318 0.5
319 0.59
320 0.68
321 0.77
322 0.84
323 0.89
324 0.91
325 0.91
326 0.9
327 0.89
328 0.91
329 0.91
330 0.92
331 0.92
332 0.9
333 0.89
334 0.89
335 0.84
336 0.78
337 0.77
338 0.76
339 0.75
340 0.76
341 0.75
342 0.75
343 0.71
344 0.67
345 0.58
346 0.5
347 0.42
348 0.36
349 0.31
350 0.22
351 0.2
352 0.19
353 0.19
354 0.18
355 0.15
356 0.12
357 0.11
358 0.14
359 0.2
360 0.27
361 0.32
362 0.4
363 0.51
364 0.58
365 0.61
366 0.68
367 0.66
368 0.64
369 0.66
370 0.59
371 0.52
372 0.46
373 0.42
374 0.32
375 0.31
376 0.26
377 0.2
378 0.25
379 0.24
380 0.27
381 0.28
382 0.32
383 0.38
384 0.42
385 0.44
386 0.42
387 0.44
388 0.45
389 0.48
390 0.47
391 0.4