Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R959

Protein Details
Accession C4R959    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
200-220LEFMRKLEPQKQKPLCKEVKCHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito 9, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001604  DNA/RNA_non-sp_Endonuclease  
IPR044929  DNA/RNA_non-sp_Endonuclease_sf  
IPR020821  Extracellular_endonuc_su_A  
IPR044925  His-Me_finger_sf  
IPR040255  Non-specific_endonuclease  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005743  C:mitochondrial inner membrane  
GO:0005736  C:RNA polymerase I complex  
GO:0004529  F:DNA exonuclease activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004521  F:RNA endonuclease activity  
GO:0000014  F:single-stranded DNA endodeoxyribonuclease activity  
GO:0006309  P:apoptotic DNA fragmentation  
GO:0051607  P:defense response to virus  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
KEGG ppa:PAS_chr4_0864  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01223  Endonuclease_NS  
Amino Acid Sequences MFWSKAKDTIVANPTTISPSSLSPPTTSVSLETPIVRPSDFFKYGFPGPIHDLQTRAEFVSVYNRQTRNPYYVVEHLTPDSLASHNADRKNSFFKEDEQIPSIFRARLKDYFRSGPLFLPKQDPNDGKWKVTYELIGSPPSVAVPTHFFKLVVAEDPKNRRNPGDVALAAFVLPNEPIPNSVKLTDFEVPLEALERATGLEFMRKLEPQKQKPLCKEVKCELIIRDFNNNIKQLPLPQK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.29
3 0.27
4 0.2
5 0.15
6 0.16
7 0.2
8 0.22
9 0.23
10 0.2
11 0.22
12 0.22
13 0.22
14 0.21
15 0.18
16 0.17
17 0.18
18 0.19
19 0.18
20 0.18
21 0.19
22 0.19
23 0.17
24 0.16
25 0.18
26 0.24
27 0.25
28 0.24
29 0.23
30 0.27
31 0.29
32 0.33
33 0.29
34 0.25
35 0.27
36 0.32
37 0.35
38 0.31
39 0.3
40 0.27
41 0.29
42 0.27
43 0.22
44 0.17
45 0.13
46 0.13
47 0.21
48 0.22
49 0.23
50 0.29
51 0.3
52 0.31
53 0.37
54 0.4
55 0.35
56 0.34
57 0.32
58 0.29
59 0.32
60 0.35
61 0.3
62 0.28
63 0.23
64 0.22
65 0.2
66 0.16
67 0.13
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.13
72 0.17
73 0.2
74 0.22
75 0.23
76 0.25
77 0.3
78 0.3
79 0.3
80 0.26
81 0.27
82 0.3
83 0.32
84 0.32
85 0.27
86 0.27
87 0.23
88 0.24
89 0.23
90 0.19
91 0.16
92 0.17
93 0.18
94 0.24
95 0.28
96 0.3
97 0.32
98 0.34
99 0.35
100 0.35
101 0.31
102 0.27
103 0.29
104 0.26
105 0.23
106 0.25
107 0.25
108 0.25
109 0.3
110 0.29
111 0.26
112 0.33
113 0.33
114 0.29
115 0.29
116 0.27
117 0.23
118 0.23
119 0.21
120 0.13
121 0.15
122 0.16
123 0.15
124 0.13
125 0.12
126 0.11
127 0.11
128 0.09
129 0.06
130 0.06
131 0.09
132 0.11
133 0.12
134 0.13
135 0.13
136 0.12
137 0.14
138 0.14
139 0.14
140 0.16
141 0.17
142 0.23
143 0.3
144 0.35
145 0.38
146 0.38
147 0.35
148 0.36
149 0.36
150 0.34
151 0.34
152 0.29
153 0.25
154 0.24
155 0.23
156 0.19
157 0.16
158 0.12
159 0.06
160 0.06
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.08
165 0.11
166 0.14
167 0.15
168 0.17
169 0.18
170 0.18
171 0.22
172 0.22
173 0.2
174 0.18
175 0.17
176 0.16
177 0.14
178 0.15
179 0.11
180 0.08
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.07
185 0.08
186 0.07
187 0.12
188 0.12
189 0.15
190 0.18
191 0.2
192 0.24
193 0.32
194 0.43
195 0.46
196 0.56
197 0.63
198 0.69
199 0.74
200 0.81
201 0.81
202 0.77
203 0.78
204 0.73
205 0.73
206 0.66
207 0.62
208 0.55
209 0.55
210 0.53
211 0.47
212 0.48
213 0.43
214 0.46
215 0.49
216 0.47
217 0.39
218 0.37
219 0.36