Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R5J1

Protein Details
Accession C4R5J1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-34CHLCHSRKAVMKRPKTLQKLCKECFYHydrophilic
267-294IQSGENFKLKPKKQRKNVVKRNTAQEIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
276-282KPKKQRK
Subcellular Location(s) mito 20.5, cyto_mito 12, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032442  CTU1_C  
IPR000541  Ncs6/Tuc1/Ctu1  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR011063  TilS/TtcA_N  
IPR035107  tRNA_thiolation_TtcA_Ctu1  
IPR020554  UPF0021_CS  
Gene Ontology GO:0002144  C:cytosolic tRNA wobble base thiouridylase complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016779  F:nucleotidyltransferase activity  
GO:0000049  F:tRNA binding  
GO:0032447  P:protein urmylation  
GO:0002143  P:tRNA wobble position uridine thiolation  
KEGG ppa:PAS_chr3_0775  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01171  ATP_bind_3  
PF16503  zn-ribbon_14  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01263  UPF0021  
CDD cd01993  Alpha_ANH_like_II  
Amino Acid Sequences MAFNPKTACHLCHSRKAVMKRPKTLQKLCKECFYNVFETEIHNTIISANLFHKGERVAIGASGGKDSTVLAHILKTLNERYDYGLELVLLSIDEGIVGYRDDSLATVKRNKEQYQMPLEIVSYKELYSWSMDEIVACAGIRSSCTYCGVLRRQALDRGAARLGIAHVVTGHNADDMAETVLMNLLRGDVNRLESSTNIITQSSGSPIKRSKPFKYTYEKEIVLYAHYKKLDYFSTECTYAPEAFRGTARTLLKSLEAIKPSCIIDIIQSGENFKLKPKKQRKNVVKRNTAQEIEVRGDGSVSLNKDGNKCESCGYLSTNKICKACILLKGLESSRAKVPIEGGNIAIDGAAQVTKKLETLSF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.64
3 0.7
4 0.74
5 0.74
6 0.76
7 0.75
8 0.8
9 0.82
10 0.84
11 0.86
12 0.85
13 0.85
14 0.86
15 0.81
16 0.8
17 0.74
18 0.67
19 0.64
20 0.59
21 0.54
22 0.44
23 0.43
24 0.35
25 0.34
26 0.34
27 0.29
28 0.24
29 0.19
30 0.18
31 0.16
32 0.18
33 0.15
34 0.13
35 0.12
36 0.16
37 0.16
38 0.16
39 0.18
40 0.16
41 0.17
42 0.16
43 0.17
44 0.13
45 0.12
46 0.14
47 0.14
48 0.13
49 0.13
50 0.11
51 0.1
52 0.09
53 0.09
54 0.09
55 0.08
56 0.09
57 0.08
58 0.09
59 0.11
60 0.12
61 0.13
62 0.16
63 0.18
64 0.2
65 0.21
66 0.21
67 0.23
68 0.23
69 0.23
70 0.2
71 0.17
72 0.14
73 0.13
74 0.12
75 0.08
76 0.06
77 0.05
78 0.04
79 0.03
80 0.03
81 0.03
82 0.03
83 0.03
84 0.03
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.05
89 0.05
90 0.08
91 0.11
92 0.15
93 0.22
94 0.24
95 0.3
96 0.37
97 0.38
98 0.41
99 0.43
100 0.47
101 0.47
102 0.47
103 0.42
104 0.35
105 0.34
106 0.29
107 0.24
108 0.18
109 0.12
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.09
117 0.1
118 0.1
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.07
123 0.06
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.05
128 0.07
129 0.08
130 0.09
131 0.11
132 0.12
133 0.13
134 0.19
135 0.23
136 0.25
137 0.26
138 0.28
139 0.28
140 0.31
141 0.31
142 0.29
143 0.26
144 0.23
145 0.22
146 0.19
147 0.16
148 0.13
149 0.12
150 0.09
151 0.07
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.04
162 0.05
163 0.05
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.05
174 0.07
175 0.06
176 0.09
177 0.09
178 0.1
179 0.1
180 0.09
181 0.13
182 0.12
183 0.12
184 0.1
185 0.1
186 0.09
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.13
191 0.12
192 0.16
193 0.19
194 0.25
195 0.33
196 0.39
197 0.41
198 0.45
199 0.5
200 0.53
201 0.6
202 0.58
203 0.56
204 0.56
205 0.51
206 0.44
207 0.41
208 0.34
209 0.26
210 0.26
211 0.22
212 0.2
213 0.19
214 0.19
215 0.18
216 0.2
217 0.2
218 0.2
219 0.21
220 0.21
221 0.24
222 0.25
223 0.24
224 0.23
225 0.24
226 0.21
227 0.2
228 0.16
229 0.14
230 0.14
231 0.15
232 0.15
233 0.14
234 0.19
235 0.19
236 0.2
237 0.2
238 0.2
239 0.2
240 0.19
241 0.22
242 0.2
243 0.22
244 0.21
245 0.21
246 0.23
247 0.22
248 0.2
249 0.17
250 0.12
251 0.11
252 0.12
253 0.14
254 0.14
255 0.13
256 0.15
257 0.16
258 0.17
259 0.16
260 0.21
261 0.28
262 0.32
263 0.43
264 0.53
265 0.62
266 0.7
267 0.81
268 0.86
269 0.88
270 0.93
271 0.93
272 0.92
273 0.88
274 0.86
275 0.82
276 0.72
277 0.62
278 0.55
279 0.49
280 0.41
281 0.35
282 0.27
283 0.2
284 0.18
285 0.17
286 0.15
287 0.14
288 0.13
289 0.15
290 0.17
291 0.21
292 0.23
293 0.26
294 0.31
295 0.29
296 0.29
297 0.28
298 0.28
299 0.27
300 0.27
301 0.29
302 0.28
303 0.32
304 0.37
305 0.42
306 0.45
307 0.43
308 0.41
309 0.38
310 0.38
311 0.37
312 0.36
313 0.35
314 0.32
315 0.33
316 0.38
317 0.38
318 0.39
319 0.36
320 0.33
321 0.33
322 0.36
323 0.35
324 0.31
325 0.33
326 0.3
327 0.33
328 0.31
329 0.27
330 0.23
331 0.22
332 0.2
333 0.17
334 0.11
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.06
339 0.07
340 0.09
341 0.1
342 0.11