Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G4UBX5

Protein Details
Accession G4UBX5    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
72-93KFEENDRRRAPRRRNSPEPFSDBasic
269-289EKPQGERTRNGRPKKTQEELDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-32GRGSGSRGRGNR
80-84RAPRR
219-283RKGIDRYRPGGSSRGRSRSPLPRREGGRESGRRPGARREGGRGGRGGRGGEKPQGERTRNGRPKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12418  RRM_Aly_REF_like  
Amino Acid Sequences MADNSLDRSLDEILAERKPNGRGSGSRGRGNRDNGAANRQRRDRNDYPRDGVRKSFRDDAPRNLDSEWVHDKFEENDRRRAPRRRNSPEPFSDARGSKIRVDNIHYELTQEDLEGLFSRIGPLVKLDMKYDRAGRSEGTAFVTYESPQDASRAIREYDGANAAGQPIRLTLMPSGPRRNPFETAINPRPLAERITVPGGRSRSISPSRRDRDLDEEAARKGIDRYRPGGSSRGRSRSPLPRREGGRESGRRPGARREGGRGGRGGRGGEKPQGERTRNGRPKKTQEELDAEMEDYFGGGGANQENNTAPAAEASNGAVASGPAEDDIDMGIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.23
3 0.23
4 0.26
5 0.3
6 0.33
7 0.34
8 0.36
9 0.35
10 0.42
11 0.5
12 0.51
13 0.55
14 0.54
15 0.57
16 0.59
17 0.61
18 0.58
19 0.52
20 0.54
21 0.5
22 0.57
23 0.58
24 0.58
25 0.6
26 0.62
27 0.66
28 0.64
29 0.71
30 0.7
31 0.73
32 0.76
33 0.75
34 0.73
35 0.74
36 0.74
37 0.67
38 0.65
39 0.63
40 0.58
41 0.57
42 0.59
43 0.54
44 0.59
45 0.61
46 0.63
47 0.62
48 0.58
49 0.53
50 0.45
51 0.45
52 0.34
53 0.36
54 0.34
55 0.27
56 0.26
57 0.25
58 0.26
59 0.26
60 0.35
61 0.39
62 0.36
63 0.43
64 0.48
65 0.57
66 0.64
67 0.71
68 0.72
69 0.72
70 0.79
71 0.8
72 0.85
73 0.84
74 0.84
75 0.8
76 0.76
77 0.69
78 0.62
79 0.58
80 0.48
81 0.44
82 0.41
83 0.38
84 0.36
85 0.37
86 0.37
87 0.34
88 0.37
89 0.38
90 0.36
91 0.36
92 0.31
93 0.27
94 0.23
95 0.22
96 0.17
97 0.12
98 0.09
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.08
107 0.08
108 0.07
109 0.07
110 0.1
111 0.13
112 0.13
113 0.15
114 0.16
115 0.19
116 0.21
117 0.24
118 0.23
119 0.22
120 0.22
121 0.21
122 0.21
123 0.2
124 0.18
125 0.17
126 0.16
127 0.14
128 0.14
129 0.14
130 0.12
131 0.11
132 0.11
133 0.09
134 0.08
135 0.09
136 0.08
137 0.09
138 0.1
139 0.12
140 0.11
141 0.11
142 0.12
143 0.11
144 0.12
145 0.12
146 0.11
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.07
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.06
158 0.1
159 0.15
160 0.19
161 0.24
162 0.26
163 0.3
164 0.34
165 0.36
166 0.35
167 0.33
168 0.35
169 0.35
170 0.41
171 0.43
172 0.4
173 0.38
174 0.35
175 0.34
176 0.3
177 0.26
178 0.19
179 0.14
180 0.13
181 0.18
182 0.19
183 0.17
184 0.21
185 0.2
186 0.2
187 0.2
188 0.2
189 0.22
190 0.3
191 0.36
192 0.38
193 0.47
194 0.51
195 0.54
196 0.54
197 0.5
198 0.49
199 0.48
200 0.46
201 0.39
202 0.38
203 0.33
204 0.32
205 0.29
206 0.22
207 0.2
208 0.19
209 0.22
210 0.23
211 0.26
212 0.29
213 0.31
214 0.32
215 0.37
216 0.37
217 0.4
218 0.44
219 0.47
220 0.45
221 0.46
222 0.51
223 0.55
224 0.6
225 0.6
226 0.58
227 0.59
228 0.62
229 0.66
230 0.64
231 0.6
232 0.6
233 0.58
234 0.56
235 0.57
236 0.59
237 0.55
238 0.54
239 0.56
240 0.56
241 0.57
242 0.56
243 0.54
244 0.58
245 0.59
246 0.58
247 0.52
248 0.45
249 0.4
250 0.39
251 0.34
252 0.28
253 0.29
254 0.29
255 0.32
256 0.34
257 0.34
258 0.41
259 0.49
260 0.48
261 0.5
262 0.53
263 0.59
264 0.64
265 0.7
266 0.7
267 0.71
268 0.78
269 0.8
270 0.82
271 0.76
272 0.74
273 0.71
274 0.66
275 0.6
276 0.5
277 0.42
278 0.34
279 0.28
280 0.2
281 0.13
282 0.09
283 0.05
284 0.04
285 0.03
286 0.05
287 0.08
288 0.1
289 0.1
290 0.11
291 0.12
292 0.13
293 0.14
294 0.13
295 0.1
296 0.1
297 0.11
298 0.11
299 0.11
300 0.11
301 0.12
302 0.11
303 0.11
304 0.09
305 0.08
306 0.08
307 0.07
308 0.07
309 0.05
310 0.06
311 0.06
312 0.06