Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K5VTD2

Protein Details
Accession K5VTD2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-87EEGSSRNMKTKRPNKRTRKTPAPVGVFLHydrophilic
300-322RVYYTMKMGKRKRGTRPPQALFDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
68-78KTKRPNKRTRK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036735  NGN_dom_sf  
IPR039659  SPT5  
Gene Ontology GO:0032784  P:regulation of DNA-templated transcription elongation  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG abp:AGABI1DRAFT129997  -  
Amino Acid Sequences MSTTGTGTRPSYLPHGEAVNEDGSLKEAWEISWVDDPDDEDIGTAAIFSARHSGTPKATEEGSSRNMKTKRPNKRTRKTPAPVGVFLDIEAAVSGSCDESEEVTDDEFINDIHDGNNDLGMDMRLLTATEVDSGFIENLRTKYAGRMSDRNDDLTPGTQEDSPQELGAVSPTWEVPVTMGLEIDALFHIFRRSEEGLRGSYDAPRSSFFKPNMPGRIFIEVLSRASAIHICTGIPGVHTSHTKRVGHASAVFYLESEQVTDKIERGHWVRLTRSPYKHDLALVTSANPQQSTVDVLTIPRVYYTMKMGKRKRGTRPPQALFDPVKCGQPISTVVTAGGYQFEDQIFDRAGYAILKDLPFGLYRPVLHASRTEYILFSDCTALSSVELRSAMKLLANRTLKRFDKVRVLDGQFEGWLCGVASAVCHVDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.29
3 0.26
4 0.27
5 0.27
6 0.21
7 0.18
8 0.16
9 0.14
10 0.14
11 0.13
12 0.12
13 0.1
14 0.09
15 0.09
16 0.13
17 0.14
18 0.14
19 0.21
20 0.21
21 0.2
22 0.2
23 0.21
24 0.2
25 0.2
26 0.17
27 0.1
28 0.1
29 0.09
30 0.08
31 0.07
32 0.05
33 0.05
34 0.05
35 0.06
36 0.11
37 0.12
38 0.14
39 0.17
40 0.21
41 0.24
42 0.28
43 0.3
44 0.28
45 0.28
46 0.29
47 0.29
48 0.3
49 0.32
50 0.34
51 0.33
52 0.39
53 0.42
54 0.46
55 0.54
56 0.58
57 0.64
58 0.68
59 0.78
60 0.81
61 0.88
62 0.92
63 0.91
64 0.93
65 0.89
66 0.88
67 0.86
68 0.81
69 0.73
70 0.66
71 0.57
72 0.46
73 0.38
74 0.29
75 0.19
76 0.13
77 0.1
78 0.07
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.04
83 0.04
84 0.05
85 0.05
86 0.06
87 0.07
88 0.08
89 0.09
90 0.09
91 0.1
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.06
100 0.07
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.1
125 0.1
126 0.11
127 0.12
128 0.12
129 0.16
130 0.21
131 0.26
132 0.27
133 0.33
134 0.36
135 0.44
136 0.45
137 0.43
138 0.38
139 0.33
140 0.3
141 0.26
142 0.22
143 0.15
144 0.15
145 0.12
146 0.13
147 0.13
148 0.15
149 0.13
150 0.12
151 0.11
152 0.1
153 0.09
154 0.1
155 0.08
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.06
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.1
179 0.13
180 0.14
181 0.17
182 0.19
183 0.19
184 0.19
185 0.21
186 0.16
187 0.17
188 0.17
189 0.16
190 0.14
191 0.15
192 0.18
193 0.2
194 0.25
195 0.24
196 0.27
197 0.31
198 0.36
199 0.41
200 0.39
201 0.37
202 0.32
203 0.34
204 0.29
205 0.25
206 0.22
207 0.15
208 0.15
209 0.13
210 0.12
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.09
225 0.12
226 0.14
227 0.19
228 0.26
229 0.26
230 0.26
231 0.3
232 0.29
233 0.29
234 0.29
235 0.25
236 0.2
237 0.21
238 0.19
239 0.15
240 0.14
241 0.12
242 0.09
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.1
250 0.11
251 0.14
252 0.17
253 0.21
254 0.23
255 0.26
256 0.28
257 0.32
258 0.38
259 0.42
260 0.43
261 0.43
262 0.45
263 0.45
264 0.43
265 0.39
266 0.33
267 0.27
268 0.27
269 0.22
270 0.17
271 0.18
272 0.18
273 0.18
274 0.16
275 0.15
276 0.12
277 0.12
278 0.14
279 0.11
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.12
284 0.12
285 0.12
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.1
290 0.16
291 0.22
292 0.28
293 0.37
294 0.44
295 0.53
296 0.62
297 0.69
298 0.74
299 0.76
300 0.8
301 0.82
302 0.86
303 0.81
304 0.77
305 0.72
306 0.68
307 0.6
308 0.53
309 0.48
310 0.39
311 0.37
312 0.31
313 0.29
314 0.22
315 0.21
316 0.22
317 0.21
318 0.2
319 0.18
320 0.18
321 0.18
322 0.17
323 0.14
324 0.13
325 0.08
326 0.07
327 0.08
328 0.08
329 0.1
330 0.1
331 0.12
332 0.12
333 0.11
334 0.11
335 0.11
336 0.11
337 0.1
338 0.1
339 0.1
340 0.12
341 0.12
342 0.11
343 0.12
344 0.12
345 0.13
346 0.13
347 0.15
348 0.15
349 0.15
350 0.19
351 0.23
352 0.23
353 0.23
354 0.26
355 0.28
356 0.28
357 0.3
358 0.27
359 0.23
360 0.24
361 0.25
362 0.23
363 0.18
364 0.17
365 0.14
366 0.15
367 0.15
368 0.14
369 0.12
370 0.14
371 0.13
372 0.14
373 0.15
374 0.14
375 0.14
376 0.15
377 0.15
378 0.15
379 0.19
380 0.19
381 0.27
382 0.35
383 0.37
384 0.42
385 0.5
386 0.5
387 0.54
388 0.56
389 0.53
390 0.56
391 0.57
392 0.58
393 0.58
394 0.58
395 0.57
396 0.53
397 0.48
398 0.38
399 0.34
400 0.29
401 0.19
402 0.16
403 0.11
404 0.09
405 0.08
406 0.07
407 0.07
408 0.08