Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R2T2

Protein Details
Accession C4R2T2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
367-391SNINSNKKNKFIQQQRDQKERDREEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045237  COPS7/eIF3m  
IPR000717  PCI_dom  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0008541  C:proteasome regulatory particle, lid subcomplex  
GO:0043161  P:proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG ppa:PAS_chr2-2_0120  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01399  PCI  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50250  PCI  
Amino Acid Sequences MLNIVVDGTIEDSIYEYGVVLDTLLKSKPKYDELFHNVTEAGEELSSKVTETLDSFYLLDDRQFEPIFNLAFHLLTSSNSDIESVLEKTQLVNKIVQIEEKVQQEDSKSRKLIEPTSLVSVLTTVFNSLPENSATRLDLLNAIVGLLERNKLQYLITPTLLDIFYESAKALGTSESSSEVLFNLYRVGNISDVSFVKKVILNFSVDVKHINEFLTDALNNEKLLDLSEYINIEKVSSADSALLDLLKIYTSVDLEAFNKFDFTTVPSVNKSAVLSKLHSLVIAQLASANSTLKFADIASALSVEREAVPDFVINTIYMGSIQARIDQPNELVYINKVNILTAFDLAQWEAVRASLQAWKGCLNEVRSNINSNKKNKFIQQQRDQKERDREEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.07
3 0.06
4 0.06
5 0.07
6 0.06
7 0.05
8 0.07
9 0.08
10 0.11
11 0.13
12 0.17
13 0.17
14 0.23
15 0.28
16 0.34
17 0.38
18 0.41
19 0.48
20 0.53
21 0.58
22 0.52
23 0.48
24 0.41
25 0.36
26 0.31
27 0.22
28 0.15
29 0.09
30 0.09
31 0.08
32 0.1
33 0.1
34 0.09
35 0.1
36 0.09
37 0.1
38 0.11
39 0.14
40 0.13
41 0.14
42 0.14
43 0.13
44 0.15
45 0.14
46 0.14
47 0.14
48 0.14
49 0.18
50 0.18
51 0.17
52 0.17
53 0.2
54 0.19
55 0.16
56 0.17
57 0.13
58 0.13
59 0.12
60 0.12
61 0.09
62 0.09
63 0.13
64 0.13
65 0.12
66 0.12
67 0.13
68 0.11
69 0.12
70 0.14
71 0.12
72 0.11
73 0.11
74 0.12
75 0.12
76 0.18
77 0.22
78 0.21
79 0.21
80 0.22
81 0.26
82 0.26
83 0.27
84 0.23
85 0.22
86 0.25
87 0.26
88 0.26
89 0.22
90 0.22
91 0.24
92 0.29
93 0.31
94 0.33
95 0.31
96 0.32
97 0.36
98 0.39
99 0.4
100 0.38
101 0.36
102 0.31
103 0.34
104 0.32
105 0.28
106 0.23
107 0.19
108 0.15
109 0.11
110 0.09
111 0.07
112 0.06
113 0.07
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.1
118 0.11
119 0.11
120 0.12
121 0.12
122 0.13
123 0.12
124 0.11
125 0.11
126 0.1
127 0.09
128 0.08
129 0.07
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.06
135 0.05
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.11
141 0.17
142 0.18
143 0.19
144 0.18
145 0.18
146 0.19
147 0.19
148 0.15
149 0.09
150 0.08
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.1
181 0.1
182 0.09
183 0.1
184 0.11
185 0.11
186 0.12
187 0.13
188 0.12
189 0.13
190 0.15
191 0.15
192 0.13
193 0.14
194 0.12
195 0.12
196 0.11
197 0.11
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.09
216 0.09
217 0.1
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.07
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.05
231 0.05
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.07
241 0.08
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.1
250 0.14
251 0.14
252 0.17
253 0.18
254 0.19
255 0.19
256 0.19
257 0.18
258 0.15
259 0.18
260 0.18
261 0.19
262 0.19
263 0.21
264 0.2
265 0.19
266 0.16
267 0.14
268 0.14
269 0.12
270 0.1
271 0.09
272 0.09
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.07
277 0.08
278 0.08
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.08
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.1
300 0.08
301 0.08
302 0.07
303 0.07
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.09
308 0.09
309 0.13
310 0.15
311 0.17
312 0.18
313 0.19
314 0.19
315 0.18
316 0.19
317 0.15
318 0.14
319 0.14
320 0.18
321 0.16
322 0.18
323 0.17
324 0.16
325 0.16
326 0.18
327 0.17
328 0.13
329 0.13
330 0.11
331 0.12
332 0.12
333 0.13
334 0.11
335 0.1
336 0.09
337 0.09
338 0.09
339 0.08
340 0.1
341 0.13
342 0.17
343 0.18
344 0.19
345 0.23
346 0.23
347 0.27
348 0.31
349 0.32
350 0.35
351 0.37
352 0.42
353 0.41
354 0.48
355 0.5
356 0.55
357 0.57
358 0.59
359 0.64
360 0.63
361 0.68
362 0.69
363 0.73
364 0.74
365 0.76
366 0.79
367 0.81
368 0.83
369 0.87
370 0.83
371 0.82
372 0.82