Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0UY62

Protein Details
Accession Q0UY62    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-37VASSELSRKKSKKEKSGKSKKSVIGEGHydrophilic
59-81LSKAERKAAKKAKKEAKEASKAGHydrophilic
95-117AKAARKAARKAEKKKLKEAEKTABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-31RKKSKKEKSGKSKK
61-83KAERKAAKKAKKEAKEASKAGKA
95-112AKAARKAARKAEKKKLKE
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0000464  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 upstream of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG pno:SNOG_03302  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd00268  DEADc  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MGKRPIEDDAVASSELSRKKSKKEKSGKSKKSVIGEGADTNGHAPAAETTVDGSENEALSKAERKAAKKAKKEAKEASKAGKADAPTVENDEEAAKAARKAARKAEKKKLKEAEKTASSAPTEASSVPAQTLSSSNAGSYTEHTELAQLPQSEIDAFLTKNTMTIEDPKPAARKLRPIVNFKYLPVTDESQRAPFAGFTAPTPIQAATWPFLLSGRDMVGVAETGSGKTLAFGVPCVRAILSLPKDKRKGIKAVIVSPTRELAVQIYDQLVALAHPAGLSVVCVYGGVPKDPQVAACRKAHIVVATPGRLNDLIGDGSADLSNADYVVLDEADRMLDKGFEEPIRQIISQTPKKRQTLMFTATWPPSVRDLASTFMVSPVRITIGDNQSGELRANVRIKQLVEVLDPHAKEQRLLQLLKQYQSGKNKDDRILVFCLYKKEAMRIENFIRMKGFRVGGIHGDLSQEKRSASLAAFKEGQVPLLVATDVAARGLDIPAVKLVINVTFPLTAEDYVHRIGRTGRAGKEGLAITFFTEHDKGLSGSLINVLKAANQEVPEELLKFGTTVKKKEHGAYGAFYKDVDNTKAATKITFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.24
3 0.27
4 0.33
5 0.36
6 0.46
7 0.56
8 0.65
9 0.7
10 0.78
11 0.84
12 0.86
13 0.93
14 0.93
15 0.92
16 0.91
17 0.86
18 0.83
19 0.77
20 0.7
21 0.62
22 0.55
23 0.48
24 0.4
25 0.34
26 0.26
27 0.21
28 0.17
29 0.13
30 0.09
31 0.08
32 0.08
33 0.09
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.1
38 0.11
39 0.1
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.12
44 0.11
45 0.11
46 0.12
47 0.18
48 0.18
49 0.22
50 0.28
51 0.31
52 0.41
53 0.52
54 0.59
55 0.63
56 0.72
57 0.76
58 0.79
59 0.84
60 0.83
61 0.83
62 0.83
63 0.78
64 0.75
65 0.71
66 0.63
67 0.56
68 0.5
69 0.4
70 0.35
71 0.33
72 0.27
73 0.22
74 0.26
75 0.25
76 0.21
77 0.21
78 0.17
79 0.14
80 0.14
81 0.14
82 0.11
83 0.11
84 0.17
85 0.21
86 0.25
87 0.3
88 0.39
89 0.48
90 0.57
91 0.66
92 0.72
93 0.77
94 0.78
95 0.84
96 0.83
97 0.82
98 0.81
99 0.79
100 0.78
101 0.71
102 0.68
103 0.6
104 0.53
105 0.45
106 0.36
107 0.29
108 0.2
109 0.17
110 0.15
111 0.15
112 0.13
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.11
117 0.1
118 0.12
119 0.11
120 0.12
121 0.12
122 0.11
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.13
127 0.16
128 0.15
129 0.15
130 0.15
131 0.16
132 0.17
133 0.18
134 0.2
135 0.15
136 0.14
137 0.14
138 0.14
139 0.13
140 0.12
141 0.12
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.09
147 0.11
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.17
152 0.19
153 0.22
154 0.23
155 0.25
156 0.28
157 0.29
158 0.35
159 0.31
160 0.38
161 0.39
162 0.47
163 0.5
164 0.54
165 0.57
166 0.58
167 0.56
168 0.48
169 0.5
170 0.41
171 0.36
172 0.32
173 0.3
174 0.23
175 0.26
176 0.27
177 0.22
178 0.22
179 0.21
180 0.18
181 0.15
182 0.14
183 0.12
184 0.1
185 0.09
186 0.14
187 0.14
188 0.14
189 0.15
190 0.14
191 0.12
192 0.13
193 0.15
194 0.1
195 0.11
196 0.1
197 0.09
198 0.1
199 0.11
200 0.1
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.15
228 0.18
229 0.24
230 0.28
231 0.35
232 0.38
233 0.41
234 0.46
235 0.43
236 0.46
237 0.42
238 0.45
239 0.41
240 0.44
241 0.48
242 0.44
243 0.39
244 0.33
245 0.3
246 0.24
247 0.2
248 0.15
249 0.09
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.06
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.06
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.1
278 0.1
279 0.12
280 0.13
281 0.17
282 0.2
283 0.21
284 0.21
285 0.2
286 0.21
287 0.2
288 0.16
289 0.15
290 0.15
291 0.17
292 0.16
293 0.16
294 0.15
295 0.16
296 0.15
297 0.13
298 0.09
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.03
308 0.04
309 0.04
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.03
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.05
325 0.06
326 0.08
327 0.08
328 0.1
329 0.1
330 0.12
331 0.14
332 0.14
333 0.13
334 0.17
335 0.25
336 0.32
337 0.38
338 0.44
339 0.49
340 0.51
341 0.55
342 0.53
343 0.5
344 0.5
345 0.49
346 0.42
347 0.37
348 0.39
349 0.35
350 0.34
351 0.29
352 0.22
353 0.2
354 0.19
355 0.16
356 0.14
357 0.15
358 0.15
359 0.15
360 0.14
361 0.12
362 0.14
363 0.14
364 0.11
365 0.1
366 0.09
367 0.09
368 0.09
369 0.1
370 0.14
371 0.17
372 0.2
373 0.2
374 0.2
375 0.2
376 0.21
377 0.2
378 0.14
379 0.12
380 0.14
381 0.18
382 0.18
383 0.2
384 0.22
385 0.23
386 0.23
387 0.24
388 0.2
389 0.18
390 0.18
391 0.19
392 0.21
393 0.2
394 0.2
395 0.22
396 0.21
397 0.2
398 0.21
399 0.25
400 0.27
401 0.27
402 0.28
403 0.32
404 0.36
405 0.37
406 0.39
407 0.36
408 0.37
409 0.45
410 0.48
411 0.45
412 0.49
413 0.53
414 0.51
415 0.53
416 0.49
417 0.44
418 0.42
419 0.38
420 0.34
421 0.31
422 0.32
423 0.27
424 0.29
425 0.26
426 0.28
427 0.31
428 0.31
429 0.32
430 0.35
431 0.36
432 0.4
433 0.4
434 0.36
435 0.34
436 0.3
437 0.3
438 0.28
439 0.26
440 0.19
441 0.21
442 0.21
443 0.21
444 0.22
445 0.2
446 0.15
447 0.17
448 0.17
449 0.18
450 0.19
451 0.18
452 0.16
453 0.16
454 0.16
455 0.16
456 0.16
457 0.21
458 0.2
459 0.23
460 0.24
461 0.24
462 0.28
463 0.26
464 0.26
465 0.18
466 0.17
467 0.13
468 0.13
469 0.12
470 0.06
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.07
475 0.06
476 0.05
477 0.06
478 0.06
479 0.08
480 0.07
481 0.07
482 0.08
483 0.09
484 0.09
485 0.09
486 0.09
487 0.09
488 0.1
489 0.1
490 0.11
491 0.1
492 0.11
493 0.13
494 0.13
495 0.12
496 0.13
497 0.15
498 0.16
499 0.18
500 0.21
501 0.18
502 0.18
503 0.2
504 0.24
505 0.31
506 0.34
507 0.34
508 0.37
509 0.38
510 0.37
511 0.4
512 0.35
513 0.27
514 0.22
515 0.2
516 0.16
517 0.17
518 0.17
519 0.15
520 0.15
521 0.14
522 0.14
523 0.15
524 0.15
525 0.14
526 0.15
527 0.11
528 0.11
529 0.16
530 0.16
531 0.15
532 0.15
533 0.14
534 0.15
535 0.16
536 0.18
537 0.16
538 0.15
539 0.17
540 0.17
541 0.2
542 0.2
543 0.2
544 0.18
545 0.15
546 0.14
547 0.13
548 0.17
549 0.23
550 0.27
551 0.32
552 0.38
553 0.44
554 0.48
555 0.53
556 0.57
557 0.54
558 0.51
559 0.51
560 0.5
561 0.45
562 0.42
563 0.36
564 0.29
565 0.28
566 0.29
567 0.27
568 0.23
569 0.23
570 0.26
571 0.3
572 0.3