Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K5XB17

Protein Details
Accession K5XB17    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
540-564MLGFRRHGPGPRRKRRGPQPGGLEWBasic
622-643LQRGPNHRLTRWRRRLFPEAEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
544-557RRHGPGPRRKRRGP
Subcellular Location(s) mito 10, mito_nucl 8.833, cyto_mito 7.833, nucl 6.5, cyto 4.5, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
KEGG abp:AGABI1DRAFT73282  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13812  PPR_3  
Amino Acid Sequences MLRASSLGLHFVPTTVAIFLPCFRTSGMITGHRIQWFAGRYSSVPTLHLRLTSHDARLPTESLSFASTAALAENQPASNQPTEKSLTEKAVALEEDSLMEDGETIQRAIGDNHEFAVDPVSTEPLEGVQESEEISPPGFYIQEAFFLSGRPWARQTVKPLRGYGPRRLVVIPGPEDELEGAEKVSQDMLHVVATTSSVENGWNAYCVLSRLQRRRDLAADNGNASALIPFACLHRLARLISQNVPKTRAQFLRLLSVLTTIQNYGGKIQLHEWNALIDHAGKGWRKSHAGDFSNSLSIYYDMVYNRSPGSRFSDADFDDVLSPRPEDDPFHIHLPSTPMMEPDIYTYTTLIDIAARTNHPQTLHRATILFKQTALPPNRITHLALLKYFTARKQLAGVRSTITKMQEQNLELGVDGLNACMWAYGHNKRVDVVMMIYRLLRNNIVPEAYSGADDITAVREKLQDLEGIIIKPDWRPNEVTFTLMIQTMAYYGNLRAALSVFIDMISTSNVERGAPLTLTESGELQPVLYSPTVHVFRALMLGFRRHGPGPRRKRRGPQPGGLEWNLENLQNIFDRFIELPPDTMVSEATVFWILNSFSRMGGHDIDLLRTVWIRMEDRFGMLQRGPNHRLTRWRRRLFPEAEDLDEPESGRDDNSDDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.1
3 0.11
4 0.1
5 0.11
6 0.13
7 0.17
8 0.16
9 0.16
10 0.16
11 0.19
12 0.19
13 0.23
14 0.27
15 0.28
16 0.32
17 0.36
18 0.41
19 0.39
20 0.39
21 0.34
22 0.34
23 0.31
24 0.29
25 0.27
26 0.24
27 0.24
28 0.28
29 0.33
30 0.27
31 0.27
32 0.28
33 0.29
34 0.29
35 0.31
36 0.27
37 0.27
38 0.34
39 0.35
40 0.35
41 0.35
42 0.34
43 0.34
44 0.36
45 0.33
46 0.27
47 0.24
48 0.21
49 0.18
50 0.19
51 0.16
52 0.13
53 0.12
54 0.1
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.08
59 0.09
60 0.11
61 0.11
62 0.11
63 0.13
64 0.16
65 0.2
66 0.21
67 0.2
68 0.23
69 0.26
70 0.27
71 0.3
72 0.3
73 0.3
74 0.3
75 0.31
76 0.27
77 0.26
78 0.25
79 0.21
80 0.18
81 0.14
82 0.13
83 0.12
84 0.11
85 0.08
86 0.07
87 0.06
88 0.06
89 0.08
90 0.09
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.1
95 0.11
96 0.14
97 0.16
98 0.15
99 0.16
100 0.16
101 0.16
102 0.15
103 0.17
104 0.12
105 0.09
106 0.1
107 0.11
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.08
112 0.09
113 0.08
114 0.08
115 0.07
116 0.07
117 0.09
118 0.1
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.09
125 0.08
126 0.07
127 0.09
128 0.08
129 0.11
130 0.12
131 0.13
132 0.12
133 0.13
134 0.13
135 0.17
136 0.18
137 0.17
138 0.18
139 0.23
140 0.28
141 0.32
142 0.42
143 0.47
144 0.53
145 0.55
146 0.56
147 0.55
148 0.6
149 0.61
150 0.6
151 0.58
152 0.51
153 0.5
154 0.47
155 0.44
156 0.38
157 0.38
158 0.31
159 0.24
160 0.24
161 0.21
162 0.21
163 0.19
164 0.16
165 0.11
166 0.09
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.07
173 0.06
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.11
195 0.16
196 0.24
197 0.32
198 0.38
199 0.44
200 0.46
201 0.49
202 0.5
203 0.47
204 0.46
205 0.45
206 0.4
207 0.35
208 0.32
209 0.28
210 0.24
211 0.2
212 0.14
213 0.06
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.06
219 0.07
220 0.08
221 0.09
222 0.11
223 0.12
224 0.16
225 0.2
226 0.21
227 0.26
228 0.32
229 0.36
230 0.36
231 0.39
232 0.36
233 0.35
234 0.39
235 0.37
236 0.34
237 0.33
238 0.32
239 0.34
240 0.32
241 0.29
242 0.23
243 0.21
244 0.18
245 0.14
246 0.13
247 0.08
248 0.09
249 0.1
250 0.1
251 0.09
252 0.12
253 0.12
254 0.12
255 0.15
256 0.18
257 0.19
258 0.19
259 0.19
260 0.16
261 0.15
262 0.15
263 0.12
264 0.08
265 0.06
266 0.06
267 0.1
268 0.1
269 0.12
270 0.15
271 0.17
272 0.18
273 0.2
274 0.25
275 0.3
276 0.31
277 0.3
278 0.31
279 0.29
280 0.29
281 0.27
282 0.21
283 0.13
284 0.12
285 0.11
286 0.08
287 0.09
288 0.07
289 0.09
290 0.1
291 0.1
292 0.1
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.17
297 0.18
298 0.19
299 0.19
300 0.23
301 0.23
302 0.23
303 0.22
304 0.16
305 0.14
306 0.14
307 0.13
308 0.09
309 0.09
310 0.08
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.12
315 0.15
316 0.16
317 0.18
318 0.18
319 0.16
320 0.17
321 0.19
322 0.17
323 0.14
324 0.12
325 0.11
326 0.11
327 0.12
328 0.11
329 0.09
330 0.1
331 0.09
332 0.09
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.06
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.07
342 0.07
343 0.09
344 0.1
345 0.12
346 0.13
347 0.14
348 0.2
349 0.24
350 0.24
351 0.23
352 0.23
353 0.23
354 0.28
355 0.3
356 0.24
357 0.18
358 0.19
359 0.22
360 0.29
361 0.3
362 0.27
363 0.26
364 0.27
365 0.29
366 0.29
367 0.26
368 0.22
369 0.23
370 0.21
371 0.19
372 0.19
373 0.18
374 0.19
375 0.2
376 0.17
377 0.19
378 0.18
379 0.18
380 0.22
381 0.25
382 0.28
383 0.28
384 0.28
385 0.22
386 0.23
387 0.24
388 0.21
389 0.19
390 0.19
391 0.19
392 0.21
393 0.24
394 0.23
395 0.24
396 0.22
397 0.2
398 0.16
399 0.14
400 0.11
401 0.07
402 0.07
403 0.05
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.03
408 0.03
409 0.06
410 0.11
411 0.16
412 0.22
413 0.24
414 0.25
415 0.25
416 0.26
417 0.24
418 0.2
419 0.17
420 0.13
421 0.12
422 0.12
423 0.13
424 0.13
425 0.13
426 0.14
427 0.13
428 0.11
429 0.13
430 0.14
431 0.13
432 0.12
433 0.12
434 0.13
435 0.12
436 0.12
437 0.09
438 0.08
439 0.07
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.08
444 0.08
445 0.09
446 0.1
447 0.1
448 0.12
449 0.13
450 0.11
451 0.1
452 0.13
453 0.14
454 0.13
455 0.13
456 0.12
457 0.12
458 0.13
459 0.18
460 0.17
461 0.18
462 0.22
463 0.23
464 0.3
465 0.3
466 0.29
467 0.25
468 0.24
469 0.22
470 0.18
471 0.16
472 0.09
473 0.08
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.09
480 0.1
481 0.1
482 0.09
483 0.09
484 0.09
485 0.09
486 0.09
487 0.07
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.07
496 0.08
497 0.08
498 0.08
499 0.08
500 0.1
501 0.09
502 0.09
503 0.11
504 0.12
505 0.13
506 0.13
507 0.13
508 0.12
509 0.13
510 0.13
511 0.1
512 0.08
513 0.08
514 0.1
515 0.09
516 0.09
517 0.09
518 0.16
519 0.18
520 0.18
521 0.18
522 0.16
523 0.16
524 0.2
525 0.19
526 0.15
527 0.16
528 0.19
529 0.2
530 0.21
531 0.24
532 0.23
533 0.3
534 0.37
535 0.45
536 0.53
537 0.63
538 0.71
539 0.76
540 0.84
541 0.87
542 0.89
543 0.87
544 0.84
545 0.81
546 0.79
547 0.78
548 0.69
549 0.6
550 0.49
551 0.45
552 0.37
553 0.29
554 0.22
555 0.16
556 0.17
557 0.16
558 0.17
559 0.13
560 0.13
561 0.16
562 0.16
563 0.17
564 0.19
565 0.17
566 0.18
567 0.17
568 0.19
569 0.15
570 0.15
571 0.14
572 0.1
573 0.11
574 0.09
575 0.1
576 0.1
577 0.09
578 0.09
579 0.11
580 0.11
581 0.11
582 0.14
583 0.13
584 0.13
585 0.14
586 0.16
587 0.17
588 0.18
589 0.18
590 0.21
591 0.21
592 0.21
593 0.22
594 0.2
595 0.18
596 0.17
597 0.16
598 0.14
599 0.17
600 0.18
601 0.18
602 0.23
603 0.24
604 0.26
605 0.29
606 0.28
607 0.29
608 0.29
609 0.33
610 0.35
611 0.43
612 0.44
613 0.49
614 0.53
615 0.53
616 0.61
617 0.66
618 0.7
619 0.72
620 0.77
621 0.77
622 0.8
623 0.85
624 0.81
625 0.77
626 0.75
627 0.68
628 0.64
629 0.56
630 0.5
631 0.42
632 0.37
633 0.3
634 0.21
635 0.19
636 0.14
637 0.13
638 0.13