Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K5WXQ3

Protein Details
Accession K5WXQ3    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-44SMDLLFHPKKNKKSALPPPPRKTPPTPRPKPALEKEDDHydrophilic
155-176NNAANAKKRFQKKTKQVFYVPEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-37PKKNKKSALPPPPRKTPPTPRPKP
158-166ANAKKRFQK
562-568PKAKKRR
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008851  TFIIF-alpha  
IPR011039  TFIIF_interaction  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG abp:AGABI1DRAFT73332  -  
Amino Acid Sequences MAPKQASMDLLFHPKKNKKSALPPPPRKTPPTPRPKPALEKEDDGELKLPDWPYQEFRLLSSALNGWNYDVMKFDSRKPIDVSKWVGPVKLNRKDLRRDEPASEGAPKAVGPMVGPDGKPVIGTDGKVVMIDMEGKPIHPTDAASSPKDRGKGANNAANAKKRFQKKTKQVFYVPEEVRRLRKEERYPWVLEDSQADNKELWIGQLEDVGKAETHAFFMPAANDVFKFVPAHRWYKFQKKLKHDLPTDTAGVEQLYTTSQKRDPQAWLASRNGGRGPSASTAAMFKAEAEGRTITIGNSLVHDAGQSLGPGGRRLRAVDSGVDRLFGDDDEEEGGSKRRAKELGGEGDMDEQIYEEDFADDDEHAAMEEDDEEAKEAEERLKREYRAANKQRDAGVDEDDDDDTPGMSKQAKAMQKLIRSREGNDAYESEEDKNPYASSEEEEEEEELPVHTGPAIQQQPQQVDVRAKSQTPKPGEGVKPQTDANNSRASSPVGSPSLGGHSIVAKRATSPKAHKPLTQSISPSGSRATSPVSGAASPLNGLKSLSNKRKADESSMNSAGPPKAKKRREVIPATREEMQTMLIEWLRTSPRDKATTRECIHHFTPYLTDPEKKAEFSKLVREVATLKDGVLALRPSIASAAPSPAPLVQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.57
3 0.64
4 0.69
5 0.68
6 0.75
7 0.82
8 0.83
9 0.86
10 0.89
11 0.87
12 0.89
13 0.87
14 0.84
15 0.83
16 0.83
17 0.82
18 0.82
19 0.84
20 0.82
21 0.84
22 0.85
23 0.85
24 0.83
25 0.82
26 0.76
27 0.71
28 0.64
29 0.64
30 0.56
31 0.48
32 0.41
33 0.32
34 0.27
35 0.26
36 0.26
37 0.2
38 0.22
39 0.24
40 0.26
41 0.29
42 0.34
43 0.3
44 0.31
45 0.31
46 0.29
47 0.26
48 0.24
49 0.22
50 0.19
51 0.2
52 0.19
53 0.16
54 0.19
55 0.19
56 0.17
57 0.17
58 0.17
59 0.23
60 0.25
61 0.3
62 0.37
63 0.38
64 0.42
65 0.45
66 0.49
67 0.46
68 0.51
69 0.52
70 0.46
71 0.52
72 0.49
73 0.47
74 0.43
75 0.48
76 0.51
77 0.54
78 0.57
79 0.56
80 0.62
81 0.7
82 0.75
83 0.74
84 0.72
85 0.67
86 0.62
87 0.61
88 0.57
89 0.5
90 0.44
91 0.36
92 0.27
93 0.23
94 0.2
95 0.16
96 0.14
97 0.11
98 0.08
99 0.1
100 0.14
101 0.16
102 0.16
103 0.16
104 0.16
105 0.16
106 0.16
107 0.14
108 0.15
109 0.14
110 0.14
111 0.15
112 0.15
113 0.15
114 0.15
115 0.14
116 0.09
117 0.08
118 0.11
119 0.09
120 0.12
121 0.12
122 0.12
123 0.14
124 0.14
125 0.15
126 0.12
127 0.13
128 0.12
129 0.2
130 0.23
131 0.24
132 0.26
133 0.29
134 0.32
135 0.34
136 0.31
137 0.29
138 0.32
139 0.38
140 0.43
141 0.44
142 0.44
143 0.48
144 0.52
145 0.56
146 0.51
147 0.47
148 0.47
149 0.51
150 0.58
151 0.61
152 0.67
153 0.7
154 0.79
155 0.84
156 0.83
157 0.8
158 0.77
159 0.73
160 0.72
161 0.63
162 0.58
163 0.53
164 0.49
165 0.5
166 0.45
167 0.45
168 0.42
169 0.49
170 0.51
171 0.55
172 0.6
173 0.6
174 0.59
175 0.56
176 0.54
177 0.46
178 0.38
179 0.33
180 0.28
181 0.28
182 0.27
183 0.26
184 0.21
185 0.2
186 0.21
187 0.17
188 0.13
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.12
193 0.12
194 0.11
195 0.11
196 0.11
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.07
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.09
210 0.08
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.11
215 0.1
216 0.18
217 0.21
218 0.27
219 0.27
220 0.34
221 0.38
222 0.48
223 0.57
224 0.57
225 0.62
226 0.65
227 0.74
228 0.74
229 0.77
230 0.7
231 0.66
232 0.61
233 0.55
234 0.47
235 0.37
236 0.3
237 0.21
238 0.17
239 0.12
240 0.08
241 0.05
242 0.05
243 0.07
244 0.08
245 0.11
246 0.14
247 0.18
248 0.21
249 0.24
250 0.26
251 0.3
252 0.36
253 0.37
254 0.37
255 0.34
256 0.37
257 0.34
258 0.33
259 0.28
260 0.22
261 0.18
262 0.15
263 0.16
264 0.13
265 0.13
266 0.12
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.08
272 0.06
273 0.07
274 0.08
275 0.08
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.08
282 0.08
283 0.09
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.05
292 0.05
293 0.04
294 0.04
295 0.05
296 0.06
297 0.08
298 0.09
299 0.1
300 0.1
301 0.12
302 0.13
303 0.14
304 0.15
305 0.15
306 0.17
307 0.18
308 0.18
309 0.17
310 0.15
311 0.13
312 0.13
313 0.1
314 0.08
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.05
320 0.06
321 0.07
322 0.08
323 0.11
324 0.12
325 0.14
326 0.15
327 0.15
328 0.21
329 0.25
330 0.28
331 0.26
332 0.25
333 0.23
334 0.23
335 0.22
336 0.16
337 0.1
338 0.05
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.03
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.03
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.05
360 0.04
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.1
365 0.13
366 0.15
367 0.2
368 0.24
369 0.25
370 0.3
371 0.36
372 0.39
373 0.47
374 0.55
375 0.58
376 0.57
377 0.6
378 0.56
379 0.51
380 0.45
381 0.35
382 0.29
383 0.2
384 0.18
385 0.16
386 0.14
387 0.13
388 0.11
389 0.09
390 0.07
391 0.07
392 0.06
393 0.06
394 0.07
395 0.07
396 0.1
397 0.17
398 0.21
399 0.23
400 0.3
401 0.33
402 0.39
403 0.45
404 0.47
405 0.48
406 0.45
407 0.46
408 0.48
409 0.47
410 0.41
411 0.37
412 0.33
413 0.27
414 0.28
415 0.26
416 0.2
417 0.18
418 0.18
419 0.17
420 0.17
421 0.15
422 0.14
423 0.14
424 0.12
425 0.12
426 0.13
427 0.14
428 0.13
429 0.14
430 0.14
431 0.14
432 0.13
433 0.11
434 0.08
435 0.08
436 0.07
437 0.06
438 0.05
439 0.05
440 0.06
441 0.13
442 0.15
443 0.17
444 0.2
445 0.24
446 0.25
447 0.28
448 0.29
449 0.25
450 0.28
451 0.28
452 0.28
453 0.27
454 0.28
455 0.3
456 0.33
457 0.38
458 0.38
459 0.4
460 0.39
461 0.45
462 0.47
463 0.5
464 0.53
465 0.48
466 0.45
467 0.43
468 0.43
469 0.41
470 0.41
471 0.36
472 0.35
473 0.32
474 0.31
475 0.32
476 0.3
477 0.26
478 0.23
479 0.24
480 0.18
481 0.18
482 0.17
483 0.17
484 0.18
485 0.17
486 0.16
487 0.11
488 0.14
489 0.16
490 0.18
491 0.19
492 0.16
493 0.18
494 0.25
495 0.28
496 0.32
497 0.38
498 0.45
499 0.53
500 0.56
501 0.57
502 0.57
503 0.64
504 0.61
505 0.58
506 0.5
507 0.45
508 0.47
509 0.43
510 0.37
511 0.29
512 0.25
513 0.21
514 0.2
515 0.19
516 0.16
517 0.16
518 0.17
519 0.17
520 0.16
521 0.17
522 0.16
523 0.13
524 0.12
525 0.13
526 0.11
527 0.1
528 0.1
529 0.12
530 0.2
531 0.3
532 0.38
533 0.46
534 0.47
535 0.49
536 0.56
537 0.57
538 0.57
539 0.56
540 0.53
541 0.52
542 0.52
543 0.5
544 0.43
545 0.44
546 0.38
547 0.35
548 0.36
549 0.38
550 0.46
551 0.52
552 0.6
553 0.63
554 0.69
555 0.73
556 0.77
557 0.77
558 0.76
559 0.76
560 0.72
561 0.7
562 0.61
563 0.52
564 0.42
565 0.33
566 0.24
567 0.19
568 0.18
569 0.14
570 0.14
571 0.13
572 0.17
573 0.19
574 0.21
575 0.23
576 0.27
577 0.33
578 0.41
579 0.42
580 0.46
581 0.51
582 0.59
583 0.59
584 0.6
585 0.56
586 0.55
587 0.55
588 0.54
589 0.47
590 0.39
591 0.4
592 0.34
593 0.38
594 0.35
595 0.37
596 0.32
597 0.38
598 0.39
599 0.37
600 0.37
601 0.37
602 0.4
603 0.4
604 0.48
605 0.47
606 0.47
607 0.45
608 0.44
609 0.4
610 0.37
611 0.37
612 0.27
613 0.21
614 0.21
615 0.21
616 0.2
617 0.22
618 0.19
619 0.15
620 0.17
621 0.17
622 0.14
623 0.15
624 0.15
625 0.13
626 0.13
627 0.17
628 0.16
629 0.17