FuNGI

K5WSU6

Protein Details

Accession

K5WSU6

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-33	TAIPSSPAKSKSKKVKEKEKDRDHERKQLPG	Basic
65-89	VMWKLYFPGKPKKRMNKENIPSRAY	Hydrophilic
423-446	KPVPAPVSPRRSRHRKEGPSGNAA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
10-35	AKSKSKKVKEKEKDRDHERKQLPGER
256-288	HAPRKEEKRKIARAEVPPPSVGKKPKKGAPSPA
399-406	RKRKEKGK
432-437	RRSRHR
478-497	RGGRRGGRGGRGRGGPPRGG

Subcellular Location(s)

nucl 11, mito 10, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
KEGG	abp:AGABI1DRAFT129598 -
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MSTAIPSSPAKSKSKKVKEKEKDRDHERKQLPGERLKIVVRRLPPNLPEDIFWQSVSNWVTDDTVMWKLYFPGKPKKRMNKENIPSRAYIAFKDSEHLLFFSREYDGHKFVDKAGNESYAVVEFAPYQKVPGEKKKPDSRNATIEKGQALRVRYAMFSISNAHLDEDYISFVESLNVQSNAEPVTIETLGAVLSLKASLIYLLTYPPVASTRPASPPKTTPLLEALKAERQAQKDKEAIIRNHPHYKDLMNAPNPHAPRKEEKRKIARAEVPPPSVGKKPKKGAPSPAPSKQIQIQTKPNASGSLTGKPNLVPPTKPSGRPGRVRHASKGPTEATPVPPTAPVPSTSPKDITPVANSPHQIPPSVPTSTAPPRRGRPVLGLGSRHFEAALNGVGVNGERKRKEKGKEPATATAFAQEPNAQDKPVPAPVSPRRSRHRKEGPSGNAASPSVIPDANGSSTLTMQQGEGPNVPNIFNVGRGGRRGGRGGRGRGGPPRGG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.71
2	0.78
3	0.81
4	0.86
5	0.88
6	0.93
7	0.94
8	0.94
9	0.93
10	0.93
11	0.93
12	0.89
13	0.89
14	0.82
15	0.8
16	0.77
17	0.75
18	0.73
19	0.71
20	0.68
21	0.61
22	0.61
23	0.57
24	0.54
25	0.52
26	0.5
27	0.48
28	0.51
29	0.53
30	0.55
31	0.53
32	0.52
33	0.51
34	0.46
35	0.4
36	0.37
37	0.37
38	0.31
39	0.28
40	0.25
41	0.19
42	0.24
43	0.24
44	0.2
45	0.15
46	0.15
47	0.16
48	0.14
49	0.15
50	0.13
51	0.15
52	0.15
53	0.15
54	0.14
55	0.16
56	0.23
57	0.27
58	0.3
59	0.38
60	0.46
61	0.56
62	0.66
63	0.75
64	0.79
65	0.85
66	0.88
67	0.88
68	0.9
69	0.9
70	0.87
71	0.8
72	0.7
73	0.62
74	0.57
75	0.47
76	0.38
77	0.32
78	0.27
79	0.24
80	0.25
81	0.24
82	0.2
83	0.2
84	0.19
85	0.17
86	0.15
87	0.16
88	0.15
89	0.14
90	0.14
91	0.18
92	0.21
93	0.22
94	0.23
95	0.25
96	0.24
97	0.26
98	0.32
99	0.28
100	0.27
101	0.26
102	0.26
103	0.23
104	0.23
105	0.21
106	0.14
107	0.14
108	0.1
109	0.08
110	0.07
111	0.09
112	0.11
113	0.1
114	0.11
115	0.12
116	0.18
117	0.24
118	0.34
119	0.42
120	0.47
121	0.56
122	0.66
123	0.71
124	0.75
125	0.77
126	0.73
127	0.72
128	0.7
129	0.66
130	0.59
131	0.54
132	0.48
133	0.41
134	0.38
135	0.32
136	0.28
137	0.25
138	0.23
139	0.22
140	0.19
141	0.19
142	0.16
143	0.13
144	0.12
145	0.14
146	0.13
147	0.14
148	0.14
149	0.14
150	0.12
151	0.12
152	0.12
153	0.09
154	0.09
155	0.07
156	0.07
157	0.06
158	0.06
159	0.07
160	0.06
161	0.07
162	0.09
163	0.09
164	0.09
165	0.09
166	0.1
167	0.1
168	0.1
169	0.08
170	0.06
171	0.08
172	0.08
173	0.08
174	0.07
175	0.06
176	0.06
177	0.06
178	0.06
179	0.03
180	0.03
181	0.03
182	0.03
183	0.03
184	0.03
185	0.03
186	0.03
187	0.04
188	0.04
189	0.04
190	0.05
191	0.05
192	0.05
193	0.05
194	0.06
195	0.07
196	0.07
197	0.1
198	0.12
199	0.2
200	0.25
201	0.27
202	0.29
203	0.31
204	0.34
205	0.37
206	0.34
207	0.28
208	0.29
209	0.29
210	0.27
211	0.26
212	0.24
213	0.22
214	0.23
215	0.25
216	0.22
217	0.23
218	0.29
219	0.29
220	0.31
221	0.3
222	0.31
223	0.34
224	0.37
225	0.35
226	0.37
227	0.42
228	0.42
229	0.48
230	0.46
231	0.41
232	0.36
233	0.35
234	0.31
235	0.29
236	0.31
237	0.27
238	0.29
239	0.31
240	0.34
241	0.34
242	0.33
243	0.3
244	0.27
245	0.31
246	0.4
247	0.48
248	0.51
249	0.59
250	0.66
251	0.72
252	0.74
253	0.72
254	0.7
255	0.65
256	0.65
257	0.6
258	0.52
259	0.45
260	0.41
261	0.37
262	0.34
263	0.37
264	0.37
265	0.4
266	0.43
267	0.48
268	0.55
269	0.56
270	0.61
271	0.62
272	0.63
273	0.63
274	0.63
275	0.62
276	0.55
277	0.53
278	0.48
279	0.48
280	0.43
281	0.42
282	0.43
283	0.45
284	0.47
285	0.46
286	0.41
287	0.34
288	0.29
289	0.29
290	0.24
291	0.25
292	0.23
293	0.23
294	0.23
295	0.22
296	0.26
297	0.26
298	0.26
299	0.2
300	0.22
301	0.31
302	0.34
303	0.36
304	0.37
305	0.42
306	0.47
307	0.55
308	0.57
309	0.58
310	0.63
311	0.65
312	0.65
313	0.63
314	0.61
315	0.54
316	0.53
317	0.45
318	0.36
319	0.37
320	0.34
321	0.29
322	0.27
323	0.26
324	0.21
325	0.2
326	0.2
327	0.18
328	0.17
329	0.14
330	0.16
331	0.21
332	0.24
333	0.25
334	0.26
335	0.24
336	0.27
337	0.27
338	0.25
339	0.24
340	0.25
341	0.26
342	0.28
343	0.29
344	0.29
345	0.32
346	0.3
347	0.27
348	0.23
349	0.23
350	0.23
351	0.23
352	0.2
353	0.16
354	0.22
355	0.3
356	0.38
357	0.4
358	0.43
359	0.46
360	0.54
361	0.56
362	0.52
363	0.49
364	0.49
365	0.5
366	0.49
367	0.48
368	0.41
369	0.43
370	0.41
371	0.35
372	0.27
373	0.2
374	0.16
375	0.14
376	0.14
377	0.09
378	0.09
379	0.09
380	0.09
381	0.08
382	0.12
383	0.14
384	0.2
385	0.23
386	0.26
387	0.34
388	0.42
389	0.49
390	0.54
391	0.61
392	0.64
393	0.69
394	0.72
395	0.72
396	0.68
397	0.63
398	0.53
399	0.46
400	0.38
401	0.29
402	0.26
403	0.19
404	0.17
405	0.22
406	0.22
407	0.19
408	0.19
409	0.21
410	0.24
411	0.28
412	0.28
413	0.23
414	0.31
415	0.4
416	0.5
417	0.55
418	0.59
419	0.62
420	0.71
421	0.77
422	0.78
423	0.81
424	0.8
425	0.83
426	0.85
427	0.82
428	0.79
429	0.77
430	0.68
431	0.59
432	0.49
433	0.41
434	0.31
435	0.26
436	0.19
437	0.16
438	0.14
439	0.13
440	0.15
441	0.15
442	0.15
443	0.14
444	0.12
445	0.13
446	0.15
447	0.14
448	0.12
449	0.12
450	0.16
451	0.19
452	0.21
453	0.23
454	0.24
455	0.26
456	0.27
457	0.27
458	0.22
459	0.21
460	0.19
461	0.18
462	0.19
463	0.2
464	0.22
465	0.24
466	0.3
467	0.31
468	0.35
469	0.4
470	0.41
471	0.47
472	0.52
473	0.56
474	0.58
475	0.58
476	0.59
477	0.61

K5WSU6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer