Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K5VMY0

Protein Details
Accession K5VMY0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-33SYADRAKKNIRQRPTNDDPSPHydrophilic
483-502ASSPSIKSRKPNKPIKNDGGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 10.5, mito 5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG abp:AGABI1DRAFT109173  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd07323  LAM  
Amino Acid Sequences MVAPSSASVPALSYADRAKKNIRQRPTNDDPSPPQPQQLSPQKQVTANVWTKRKEEFAARHKSAVAPAMQPSTSTSSSSENLSQNGTVEPSVDSNNNNSNSNDDDDPFVVRRSRAPRPHVPLPPTDSADDWPQVGQAMSSSTSAETTKAEDLRNESRKVSQGGPPKWQPLPIQPPADVHPRDSHPSIANRQSTNSSRPSSNYGHGRASRNHSGRTSANQSANHSRIHSNAGSAHSSPRHSRSRRLPADDTNGAANRSSRGPSPLPQNAPSFPPTDIAAQGSTYGAYLSPPHGPAPYYHQNLPPVSPSAYHSPSHAQQPLGLPDPSLPMPSAHGYPYVPYFPGPYDYVQPSAPYPYWNGHHSHPPSGQQSPAYPPSATPSTYAGTLPMHLQQHLYPHPPIQPSILQSTSTSERSSAGRLSPVTGLDVITTSVPSLLDTESKINGELKKSTSVVFGTIDDPVTAEVDPNSNLEKGLKLLAIGVEASSPSIKSRKPNKPIKNDGGEKENHHHHHHYHHTKIVNGDLTLDPLLAKQAESVEARWKFGNEGLVSPAGGVAIDIEARTATDEDDLPAKTFPTAKFEGEKGKATANEDETEERVEPPRSQLFREGGGRGRRGNYIDRGFPRRGRGMNGFNRGFRGGFGRGGNGPHHHGGNYQQRQGPLPPYNVPPPLPFQGVPSPHPMGGLDANYYNGPPGTPLATYIPTGYDPYAPPQQQPPLTPVQSFSAPSSAAGPASPPMPVPSTQIPFPLDPTRYYLLGQLEYYLSPQNMAQDLFLRRHMDSRGWISTSLLASFNRVKRLTQDPQLVREVLTYSSLVQVKDDFARMGGWERFVLPDAPRSMVESEESPFPTMYIPQFAYPQPLHVHEGSGVIPRGEEQQQQWNNSNNGVNIGGDTGVEEEVEDEDEEDDVVFVMGENDAEGKGMWSHEKRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.28
3 0.31
4 0.34
5 0.41
6 0.48
7 0.59
8 0.65
9 0.68
10 0.7
11 0.74
12 0.79
13 0.8
14 0.82
15 0.75
16 0.74
17 0.7
18 0.67
19 0.69
20 0.61
21 0.56
22 0.49
23 0.48
24 0.51
25 0.56
26 0.56
27 0.56
28 0.61
29 0.59
30 0.59
31 0.59
32 0.53
33 0.52
34 0.52
35 0.53
36 0.53
37 0.53
38 0.53
39 0.53
40 0.53
41 0.48
42 0.5
43 0.52
44 0.54
45 0.61
46 0.61
47 0.6
48 0.57
49 0.54
50 0.47
51 0.42
52 0.35
53 0.27
54 0.28
55 0.29
56 0.28
57 0.26
58 0.26
59 0.28
60 0.26
61 0.24
62 0.23
63 0.23
64 0.25
65 0.28
66 0.31
67 0.27
68 0.27
69 0.28
70 0.27
71 0.23
72 0.23
73 0.21
74 0.15
75 0.14
76 0.13
77 0.13
78 0.15
79 0.16
80 0.17
81 0.2
82 0.27
83 0.29
84 0.3
85 0.28
86 0.29
87 0.3
88 0.32
89 0.3
90 0.23
91 0.24
92 0.22
93 0.25
94 0.23
95 0.23
96 0.22
97 0.22
98 0.28
99 0.33
100 0.42
101 0.47
102 0.54
103 0.61
104 0.66
105 0.75
106 0.75
107 0.72
108 0.69
109 0.66
110 0.64
111 0.57
112 0.49
113 0.41
114 0.36
115 0.36
116 0.31
117 0.24
118 0.19
119 0.16
120 0.16
121 0.14
122 0.12
123 0.08
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.11
130 0.11
131 0.12
132 0.11
133 0.13
134 0.17
135 0.2
136 0.21
137 0.22
138 0.28
139 0.37
140 0.43
141 0.42
142 0.39
143 0.4
144 0.43
145 0.44
146 0.42
147 0.39
148 0.42
149 0.45
150 0.51
151 0.52
152 0.52
153 0.5
154 0.51
155 0.47
156 0.47
157 0.51
158 0.5
159 0.49
160 0.44
161 0.45
162 0.44
163 0.5
164 0.41
165 0.35
166 0.34
167 0.35
168 0.39
169 0.38
170 0.38
171 0.35
172 0.4
173 0.44
174 0.46
175 0.48
176 0.44
177 0.44
178 0.47
179 0.46
180 0.45
181 0.45
182 0.41
183 0.37
184 0.38
185 0.42
186 0.4
187 0.43
188 0.44
189 0.42
190 0.45
191 0.49
192 0.51
193 0.51
194 0.55
195 0.57
196 0.54
197 0.54
198 0.48
199 0.47
200 0.45
201 0.46
202 0.45
203 0.42
204 0.43
205 0.41
206 0.46
207 0.49
208 0.49
209 0.44
210 0.39
211 0.34
212 0.31
213 0.34
214 0.28
215 0.22
216 0.23
217 0.24
218 0.24
219 0.24
220 0.26
221 0.24
222 0.27
223 0.29
224 0.33
225 0.4
226 0.41
227 0.49
228 0.55
229 0.63
230 0.67
231 0.71
232 0.69
233 0.65
234 0.7
235 0.63
236 0.53
237 0.46
238 0.4
239 0.33
240 0.28
241 0.22
242 0.16
243 0.17
244 0.17
245 0.15
246 0.18
247 0.21
248 0.24
249 0.32
250 0.37
251 0.39
252 0.41
253 0.43
254 0.4
255 0.4
256 0.38
257 0.31
258 0.24
259 0.22
260 0.19
261 0.18
262 0.17
263 0.15
264 0.13
265 0.11
266 0.11
267 0.1
268 0.09
269 0.07
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.06
274 0.07
275 0.09
276 0.1
277 0.11
278 0.12
279 0.12
280 0.13
281 0.21
282 0.28
283 0.29
284 0.31
285 0.34
286 0.37
287 0.38
288 0.38
289 0.32
290 0.25
291 0.22
292 0.21
293 0.2
294 0.22
295 0.24
296 0.23
297 0.22
298 0.24
299 0.26
300 0.31
301 0.31
302 0.25
303 0.24
304 0.26
305 0.28
306 0.27
307 0.24
308 0.18
309 0.16
310 0.19
311 0.17
312 0.15
313 0.12
314 0.09
315 0.11
316 0.13
317 0.13
318 0.11
319 0.12
320 0.11
321 0.12
322 0.14
323 0.13
324 0.11
325 0.11
326 0.11
327 0.11
328 0.13
329 0.14
330 0.13
331 0.16
332 0.17
333 0.18
334 0.17
335 0.17
336 0.15
337 0.17
338 0.16
339 0.13
340 0.14
341 0.15
342 0.18
343 0.19
344 0.21
345 0.2
346 0.29
347 0.3
348 0.32
349 0.31
350 0.33
351 0.35
352 0.33
353 0.33
354 0.25
355 0.25
356 0.25
357 0.26
358 0.23
359 0.2
360 0.18
361 0.21
362 0.22
363 0.21
364 0.18
365 0.17
366 0.15
367 0.16
368 0.16
369 0.12
370 0.11
371 0.11
372 0.11
373 0.12
374 0.12
375 0.12
376 0.13
377 0.12
378 0.17
379 0.19
380 0.21
381 0.18
382 0.19
383 0.22
384 0.23
385 0.22
386 0.2
387 0.2
388 0.19
389 0.22
390 0.2
391 0.17
392 0.17
393 0.19
394 0.2
395 0.19
396 0.17
397 0.14
398 0.14
399 0.15
400 0.16
401 0.14
402 0.12
403 0.13
404 0.13
405 0.14
406 0.13
407 0.13
408 0.12
409 0.1
410 0.1
411 0.07
412 0.07
413 0.06
414 0.05
415 0.05
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.05
421 0.05
422 0.06
423 0.07
424 0.08
425 0.09
426 0.09
427 0.1
428 0.12
429 0.13
430 0.14
431 0.15
432 0.15
433 0.17
434 0.18
435 0.18
436 0.16
437 0.15
438 0.14
439 0.12
440 0.12
441 0.1
442 0.1
443 0.09
444 0.08
445 0.07
446 0.06
447 0.06
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.06
453 0.07
454 0.08
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.08
461 0.07
462 0.06
463 0.06
464 0.06
465 0.06
466 0.05
467 0.05
468 0.04
469 0.04
470 0.04
471 0.04
472 0.04
473 0.05
474 0.08
475 0.1
476 0.19
477 0.29
478 0.38
479 0.48
480 0.58
481 0.66
482 0.73
483 0.8
484 0.79
485 0.77
486 0.72
487 0.64
488 0.59
489 0.52
490 0.44
491 0.4
492 0.4
493 0.35
494 0.34
495 0.34
496 0.32
497 0.37
498 0.44
499 0.46
500 0.42
501 0.43
502 0.41
503 0.4
504 0.39
505 0.35
506 0.26
507 0.2
508 0.19
509 0.14
510 0.14
511 0.12
512 0.11
513 0.08
514 0.07
515 0.08
516 0.06
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.08
521 0.09
522 0.1
523 0.17
524 0.18
525 0.19
526 0.19
527 0.19
528 0.17
529 0.18
530 0.22
531 0.14
532 0.14
533 0.15
534 0.14
535 0.14
536 0.13
537 0.11
538 0.06
539 0.05
540 0.04
541 0.03
542 0.03
543 0.03
544 0.03
545 0.03
546 0.03
547 0.03
548 0.04
549 0.04
550 0.04
551 0.05
552 0.06
553 0.07
554 0.09
555 0.1
556 0.1
557 0.1
558 0.1
559 0.09
560 0.13
561 0.13
562 0.17
563 0.19
564 0.19
565 0.21
566 0.23
567 0.29
568 0.28
569 0.3
570 0.25
571 0.26
572 0.26
573 0.26
574 0.27
575 0.22
576 0.21
577 0.2
578 0.2
579 0.18
580 0.19
581 0.17
582 0.14
583 0.15
584 0.16
585 0.15
586 0.18
587 0.25
588 0.25
589 0.26
590 0.3
591 0.29
592 0.31
593 0.33
594 0.31
595 0.3
596 0.34
597 0.35
598 0.32
599 0.32
600 0.31
601 0.31
602 0.34
603 0.34
604 0.32
605 0.36
606 0.39
607 0.43
608 0.44
609 0.45
610 0.45
611 0.44
612 0.42
613 0.41
614 0.42
615 0.46
616 0.5
617 0.55
618 0.52
619 0.47
620 0.47
621 0.43
622 0.36
623 0.27
624 0.24
625 0.17
626 0.19
627 0.18
628 0.19
629 0.19
630 0.21
631 0.22
632 0.2
633 0.22
634 0.2
635 0.21
636 0.19
637 0.18
638 0.24
639 0.33
640 0.35
641 0.37
642 0.37
643 0.38
644 0.4
645 0.42
646 0.41
647 0.35
648 0.34
649 0.32
650 0.34
651 0.38
652 0.38
653 0.36
654 0.31
655 0.31
656 0.3
657 0.3
658 0.26
659 0.25
660 0.29
661 0.31
662 0.31
663 0.32
664 0.31
665 0.28
666 0.28
667 0.24
668 0.2
669 0.19
670 0.18
671 0.13
672 0.11
673 0.13
674 0.12
675 0.12
676 0.1
677 0.08
678 0.07
679 0.07
680 0.08
681 0.08
682 0.08
683 0.1
684 0.12
685 0.13
686 0.14
687 0.13
688 0.13
689 0.13
690 0.14
691 0.13
692 0.13
693 0.13
694 0.17
695 0.25
696 0.24
697 0.25
698 0.29
699 0.35
700 0.35
701 0.35
702 0.35
703 0.35
704 0.36
705 0.35
706 0.32
707 0.28
708 0.28
709 0.28
710 0.24
711 0.19
712 0.17
713 0.17
714 0.17
715 0.14
716 0.12
717 0.11
718 0.1
719 0.09
720 0.1
721 0.1
722 0.08
723 0.09
724 0.12
725 0.12
726 0.16
727 0.21
728 0.24
729 0.24
730 0.27
731 0.28
732 0.26
733 0.3
734 0.32
735 0.28
736 0.26
737 0.3
738 0.3
739 0.28
740 0.28
741 0.28
742 0.24
743 0.24
744 0.23
745 0.19
746 0.17
747 0.16
748 0.17
749 0.16
750 0.13
751 0.12
752 0.12
753 0.14
754 0.15
755 0.15
756 0.14
757 0.17
758 0.21
759 0.22
760 0.26
761 0.26
762 0.24
763 0.28
764 0.3
765 0.27
766 0.3
767 0.34
768 0.34
769 0.33
770 0.32
771 0.3
772 0.31
773 0.29
774 0.25
775 0.21
776 0.16
777 0.19
778 0.27
779 0.29
780 0.33
781 0.33
782 0.32
783 0.35
784 0.44
785 0.47
786 0.48
787 0.54
788 0.51
789 0.54
790 0.57
791 0.53
792 0.44
793 0.38
794 0.31
795 0.22
796 0.2
797 0.16
798 0.12
799 0.18
800 0.2
801 0.18
802 0.18
803 0.18
804 0.19
805 0.21
806 0.22
807 0.16
808 0.14
809 0.15
810 0.15
811 0.2
812 0.19
813 0.19
814 0.18
815 0.18
816 0.19
817 0.2
818 0.23
819 0.18
820 0.23
821 0.23
822 0.25
823 0.24
824 0.26
825 0.25
826 0.23
827 0.23
828 0.18
829 0.18
830 0.21
831 0.22
832 0.21
833 0.2
834 0.19
835 0.18
836 0.2
837 0.2
838 0.2
839 0.2
840 0.2
841 0.24
842 0.24
843 0.3
844 0.27
845 0.29
846 0.27
847 0.29
848 0.32
849 0.3
850 0.31
851 0.24
852 0.26
853 0.23
854 0.25
855 0.22
856 0.17
857 0.17
858 0.16
859 0.2
860 0.22
861 0.25
862 0.23
863 0.33
864 0.38
865 0.44
866 0.49
867 0.51
868 0.49
869 0.49
870 0.49
871 0.39
872 0.36
873 0.31
874 0.26
875 0.19
876 0.18
877 0.13
878 0.1
879 0.1
880 0.08
881 0.07
882 0.07
883 0.07
884 0.06
885 0.07
886 0.09
887 0.08
888 0.08
889 0.08
890 0.08
891 0.09
892 0.08
893 0.07
894 0.06
895 0.06
896 0.05
897 0.04
898 0.05
899 0.05
900 0.05
901 0.05
902 0.06
903 0.06
904 0.07
905 0.07
906 0.07
907 0.09
908 0.11
909 0.19