Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K5XLV2

Protein Details
Accession K5XLV2    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-39GDVVKKPKLDQHRSRCQSGFHydrophilic
218-247SSPSEDKDEKQKRKKEEKVEKEKKSKSKGABasic
255-285SEEPETDEKKERKKEKKEKERSKKVQDVTDIBasic
305-360AAPQSSKSEKDGKKKKEKRRKDDGDEDSAMSIEVEKKSKKEKKEKKEKKAKKERVABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
174-214KKDNEKMKDKKRKTQAEEAQESSERSKKKAKLEKAAEPASI
220-249PSEDKDEKQKRKKEEKVEKEKKSKSKGATK
262-278EKKERKKEKKEKERSKK
312-325SEKDGKKKKEKRRK
340-360KKSKKEKKEKKEKKAKKERVA
Subcellular Location(s) nucl 19, mito_nucl 13.833, cyto_nucl 10.333, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039999  LYAR  
IPR014898  Znf_C2H2_LYAR  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG abp:AGABI1DRAFT123178  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08790  zf-LYAR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MSFRTVYMALTALVNAERCGDVVKKPKLDQHRSRCQSGFDCLDCSKTFNTPTDYKSHTSCISEAEKYQKSMYKAPNKNNQENGYHQQQNRGGRGRGGYNQNGNRGGYFGRGGGPHQQQYWDQPRTRATGANDTPLGTPSRMSPISKLTDSEEDSKKEKEMPKAMNVEEEKVNEKKDNEKMKDKKRKTQAEEAQESSERSKKKAKLEKAAEPASIPLPSSPSEDKDEKQKRKKEEKVEKEKKSKSKGATKDTHPISEEPETDEKKERKKEKKEKERSKKVQDVTDIQHNGTVCKADANGDVEMAQAAPQSSKSEKDGKKKKEKRRKDDGDEDSAMSIEVEKKSKKEKKEKKEKKAKKERVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.1
3 0.11
4 0.11
5 0.1
6 0.14
7 0.15
8 0.2
9 0.3
10 0.37
11 0.42
12 0.45
13 0.53
14 0.61
15 0.7
16 0.73
17 0.73
18 0.77
19 0.77
20 0.8
21 0.74
22 0.7
23 0.63
24 0.59
25 0.55
26 0.45
27 0.44
28 0.38
29 0.4
30 0.34
31 0.33
32 0.28
33 0.26
34 0.28
35 0.27
36 0.33
37 0.33
38 0.35
39 0.39
40 0.41
41 0.4
42 0.39
43 0.4
44 0.36
45 0.34
46 0.32
47 0.31
48 0.31
49 0.31
50 0.31
51 0.35
52 0.35
53 0.34
54 0.38
55 0.37
56 0.36
57 0.43
58 0.49
59 0.52
60 0.57
61 0.64
62 0.7
63 0.74
64 0.78
65 0.77
66 0.71
67 0.65
68 0.63
69 0.6
70 0.58
71 0.57
72 0.5
73 0.5
74 0.51
75 0.53
76 0.53
77 0.54
78 0.46
79 0.42
80 0.44
81 0.4
82 0.41
83 0.41
84 0.39
85 0.42
86 0.45
87 0.46
88 0.46
89 0.42
90 0.35
91 0.3
92 0.26
93 0.19
94 0.16
95 0.12
96 0.12
97 0.12
98 0.13
99 0.2
100 0.23
101 0.24
102 0.24
103 0.25
104 0.24
105 0.32
106 0.4
107 0.39
108 0.36
109 0.38
110 0.4
111 0.42
112 0.42
113 0.39
114 0.32
115 0.35
116 0.35
117 0.35
118 0.32
119 0.29
120 0.28
121 0.25
122 0.23
123 0.14
124 0.13
125 0.1
126 0.15
127 0.16
128 0.16
129 0.16
130 0.2
131 0.23
132 0.23
133 0.23
134 0.21
135 0.23
136 0.25
137 0.29
138 0.27
139 0.27
140 0.28
141 0.28
142 0.26
143 0.29
144 0.31
145 0.31
146 0.35
147 0.36
148 0.39
149 0.42
150 0.41
151 0.42
152 0.37
153 0.33
154 0.27
155 0.25
156 0.23
157 0.2
158 0.22
159 0.18
160 0.18
161 0.22
162 0.28
163 0.37
164 0.38
165 0.46
166 0.54
167 0.63
168 0.73
169 0.72
170 0.72
171 0.73
172 0.78
173 0.74
174 0.76
175 0.72
176 0.7
177 0.7
178 0.63
179 0.55
180 0.46
181 0.41
182 0.33
183 0.3
184 0.22
185 0.21
186 0.27
187 0.31
188 0.39
189 0.48
190 0.53
191 0.58
192 0.64
193 0.68
194 0.68
195 0.64
196 0.54
197 0.46
198 0.39
199 0.3
200 0.24
201 0.16
202 0.09
203 0.09
204 0.1
205 0.14
206 0.14
207 0.15
208 0.2
209 0.23
210 0.24
211 0.33
212 0.42
213 0.48
214 0.56
215 0.61
216 0.66
217 0.74
218 0.82
219 0.82
220 0.83
221 0.84
222 0.86
223 0.9
224 0.89
225 0.88
226 0.88
227 0.85
228 0.82
229 0.78
230 0.75
231 0.74
232 0.74
233 0.73
234 0.72
235 0.68
236 0.69
237 0.64
238 0.59
239 0.51
240 0.43
241 0.38
242 0.34
243 0.3
244 0.26
245 0.3
246 0.3
247 0.3
248 0.38
249 0.39
250 0.44
251 0.53
252 0.58
253 0.62
254 0.72
255 0.8
256 0.83
257 0.89
258 0.92
259 0.94
260 0.95
261 0.96
262 0.95
263 0.94
264 0.92
265 0.85
266 0.8
267 0.75
268 0.7
269 0.63
270 0.62
271 0.53
272 0.45
273 0.41
274 0.35
275 0.3
276 0.24
277 0.21
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.12
282 0.14
283 0.17
284 0.16
285 0.15
286 0.14
287 0.13
288 0.13
289 0.11
290 0.08
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.08
295 0.12
296 0.14
297 0.17
298 0.21
299 0.31
300 0.37
301 0.48
302 0.57
303 0.64
304 0.73
305 0.81
306 0.88
307 0.89
308 0.93
309 0.92
310 0.93
311 0.93
312 0.92
313 0.92
314 0.88
315 0.85
316 0.76
317 0.67
318 0.56
319 0.45
320 0.35
321 0.25
322 0.19
323 0.15
324 0.16
325 0.21
326 0.24
327 0.29
328 0.4
329 0.48
330 0.57
331 0.64
332 0.71
333 0.77
334 0.85
335 0.91
336 0.92
337 0.96
338 0.96
339 0.96
340 0.96