Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K5X5N7

Protein Details
Accession K5X5N7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
80-106FRCDYSQTHRRKGRRIRRPPGIHSTEPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
89-99RRKGRRIRRPP
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 7, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG abp:AGABI1DRAFT104893  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSTFCGQLVGWSPSVNQDQYGGSYARMAQEPSQAFPNSPSSVSSSFSDPDSRPIRSSCPSTRRPHEPGWVARPRNAFIVFRCDYSQTHRRKGRRIRRPPGIHSTEPSLSKRAAMAWKQMTPEEKEPYMIRAEQEREEHMRRNPDYRFRPQRQPGTGPKSRYKLRLTLEPVTDEKVRPPTNCGASCELPTVSTASTPTSWPSSTAGGSQSGVHSEGQHLSISSTRWIQPIACGVSAAPADSAEIPAVQEMMPTEYTAYSLTRTPSSTTSETTSSVSTQPPLFQGGEMTPSPIATGTQIPPNTLASLPEVADFFASSNFAQSEGYYGVQQYGTLQYPDYAEGLWYGQTGSSHVEPMAPCHTSLYDYAVATGYQNSFTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.27
3 0.22
4 0.2
5 0.21
6 0.22
7 0.25
8 0.2
9 0.16
10 0.17
11 0.18
12 0.19
13 0.2
14 0.2
15 0.19
16 0.26
17 0.27
18 0.28
19 0.32
20 0.29
21 0.28
22 0.29
23 0.33
24 0.27
25 0.26
26 0.25
27 0.25
28 0.26
29 0.28
30 0.26
31 0.24
32 0.23
33 0.24
34 0.28
35 0.23
36 0.3
37 0.32
38 0.33
39 0.32
40 0.34
41 0.37
42 0.37
43 0.44
44 0.45
45 0.5
46 0.56
47 0.62
48 0.68
49 0.71
50 0.72
51 0.7
52 0.69
53 0.69
54 0.67
55 0.68
56 0.7
57 0.64
58 0.62
59 0.6
60 0.53
61 0.5
62 0.45
63 0.38
64 0.3
65 0.37
66 0.32
67 0.31
68 0.31
69 0.28
70 0.26
71 0.32
72 0.39
73 0.38
74 0.47
75 0.53
76 0.59
77 0.66
78 0.76
79 0.79
80 0.81
81 0.85
82 0.85
83 0.87
84 0.89
85 0.86
86 0.85
87 0.82
88 0.73
89 0.64
90 0.59
91 0.52
92 0.48
93 0.43
94 0.35
95 0.28
96 0.26
97 0.24
98 0.23
99 0.26
100 0.25
101 0.31
102 0.32
103 0.34
104 0.35
105 0.37
106 0.36
107 0.34
108 0.36
109 0.33
110 0.29
111 0.29
112 0.28
113 0.28
114 0.27
115 0.23
116 0.19
117 0.2
118 0.22
119 0.23
120 0.24
121 0.25
122 0.29
123 0.31
124 0.34
125 0.33
126 0.38
127 0.37
128 0.42
129 0.43
130 0.47
131 0.5
132 0.56
133 0.62
134 0.6
135 0.68
136 0.7
137 0.74
138 0.7
139 0.7
140 0.69
141 0.67
142 0.66
143 0.62
144 0.6
145 0.58
146 0.56
147 0.56
148 0.5
149 0.48
150 0.46
151 0.48
152 0.48
153 0.47
154 0.44
155 0.4
156 0.37
157 0.33
158 0.32
159 0.24
160 0.21
161 0.23
162 0.24
163 0.22
164 0.26
165 0.27
166 0.32
167 0.33
168 0.34
169 0.3
170 0.29
171 0.29
172 0.27
173 0.22
174 0.16
175 0.15
176 0.13
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.08
182 0.08
183 0.09
184 0.1
185 0.1
186 0.11
187 0.12
188 0.12
189 0.12
190 0.13
191 0.12
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.1
196 0.09
197 0.1
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.08
206 0.09
207 0.1
208 0.1
209 0.12
210 0.12
211 0.12
212 0.13
213 0.12
214 0.12
215 0.16
216 0.17
217 0.14
218 0.13
219 0.12
220 0.14
221 0.14
222 0.12
223 0.08
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.07
241 0.08
242 0.09
243 0.09
244 0.08
245 0.1
246 0.12
247 0.13
248 0.14
249 0.15
250 0.17
251 0.22
252 0.23
253 0.23
254 0.24
255 0.24
256 0.24
257 0.23
258 0.22
259 0.18
260 0.18
261 0.17
262 0.17
263 0.16
264 0.16
265 0.16
266 0.18
267 0.16
268 0.14
269 0.15
270 0.13
271 0.16
272 0.15
273 0.15
274 0.12
275 0.12
276 0.12
277 0.1
278 0.1
279 0.08
280 0.12
281 0.12
282 0.18
283 0.19
284 0.2
285 0.21
286 0.22
287 0.22
288 0.18
289 0.17
290 0.14
291 0.15
292 0.14
293 0.14
294 0.13
295 0.11
296 0.11
297 0.1
298 0.08
299 0.07
300 0.09
301 0.08
302 0.1
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.09
307 0.12
308 0.12
309 0.13
310 0.11
311 0.12
312 0.13
313 0.12
314 0.12
315 0.11
316 0.13
317 0.14
318 0.14
319 0.15
320 0.14
321 0.16
322 0.17
323 0.16
324 0.12
325 0.1
326 0.1
327 0.11
328 0.1
329 0.09
330 0.08
331 0.08
332 0.09
333 0.1
334 0.13
335 0.13
336 0.14
337 0.14
338 0.18
339 0.17
340 0.21
341 0.25
342 0.22
343 0.21
344 0.22
345 0.23
346 0.21
347 0.22
348 0.23
349 0.21
350 0.2
351 0.21
352 0.19
353 0.19
354 0.18
355 0.2
356 0.16
357 0.14