Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K5XMD9

Protein Details
Accession K5XMD9    Localization Confidence High Confidence Score 25.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
61-86DDDEAPKKRKRNAKPKDPNAPKRPASBasic
165-186EAAAAKKSKPRKKKAVEATPEQHydrophilic
232-257EEPVEVKPTKKTKKATNHVAQTHKSKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
66-83PKKRKRNAKPKDPNAPKR
169-179AKKSKPRKKKA
255-261KSKKGSS
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG abp:AGABI1DRAFT116212  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MADQLVQRRELYFASLISLTENFRKCAEMSESFARALKDASDDDIRALSNTHKRKADVALDDDEAPKKRKRNAKPKDPNAPKRPASSYILFQNEIRKQLKDQHPELTNAELLNMISDIWKKMSEDEKATYHKLVEDAKERYSQDKKAYDSRTPEEVAAANAAVAEAAAAKKSKPRKKKAVEATPEQSSRPPPVAAEVSRSTEASSDEESDADDSEDDAHAEKDTDSDASEVEEPVEVKPTKKTKKATNHVAQTHKSKKGSSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.16
4 0.17
5 0.18
6 0.16
7 0.22
8 0.24
9 0.22
10 0.23
11 0.25
12 0.23
13 0.27
14 0.31
15 0.27
16 0.31
17 0.36
18 0.37
19 0.35
20 0.37
21 0.32
22 0.26
23 0.23
24 0.18
25 0.15
26 0.14
27 0.18
28 0.18
29 0.18
30 0.18
31 0.18
32 0.18
33 0.15
34 0.15
35 0.17
36 0.24
37 0.3
38 0.36
39 0.38
40 0.39
41 0.42
42 0.47
43 0.47
44 0.43
45 0.41
46 0.37
47 0.36
48 0.36
49 0.34
50 0.32
51 0.28
52 0.28
53 0.28
54 0.31
55 0.37
56 0.46
57 0.55
58 0.62
59 0.7
60 0.77
61 0.84
62 0.87
63 0.91
64 0.92
65 0.91
66 0.88
67 0.86
68 0.78
69 0.72
70 0.66
71 0.6
72 0.54
73 0.46
74 0.41
75 0.38
76 0.38
77 0.34
78 0.31
79 0.34
80 0.32
81 0.36
82 0.34
83 0.29
84 0.28
85 0.37
86 0.45
87 0.44
88 0.44
89 0.44
90 0.44
91 0.46
92 0.45
93 0.37
94 0.29
95 0.22
96 0.19
97 0.13
98 0.1
99 0.08
100 0.07
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.06
105 0.06
106 0.07
107 0.07
108 0.1
109 0.15
110 0.16
111 0.18
112 0.21
113 0.23
114 0.26
115 0.27
116 0.24
117 0.2
118 0.18
119 0.17
120 0.17
121 0.16
122 0.19
123 0.19
124 0.2
125 0.24
126 0.24
127 0.27
128 0.29
129 0.31
130 0.32
131 0.34
132 0.35
133 0.4
134 0.44
135 0.42
136 0.44
137 0.43
138 0.4
139 0.37
140 0.34
141 0.27
142 0.23
143 0.19
144 0.14
145 0.1
146 0.07
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.03
151 0.02
152 0.03
153 0.03
154 0.04
155 0.05
156 0.05
157 0.11
158 0.22
159 0.31
160 0.4
161 0.5
162 0.6
163 0.68
164 0.78
165 0.83
166 0.84
167 0.82
168 0.79
169 0.74
170 0.69
171 0.62
172 0.53
173 0.45
174 0.37
175 0.33
176 0.28
177 0.23
178 0.18
179 0.21
180 0.25
181 0.23
182 0.26
183 0.25
184 0.27
185 0.27
186 0.27
187 0.23
188 0.19
189 0.2
190 0.17
191 0.17
192 0.15
193 0.15
194 0.14
195 0.15
196 0.14
197 0.13
198 0.11
199 0.09
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.11
217 0.11
218 0.1
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.18
223 0.17
224 0.17
225 0.26
226 0.36
227 0.44
228 0.51
229 0.59
230 0.62
231 0.72
232 0.81
233 0.84
234 0.84
235 0.84
236 0.84
237 0.85
238 0.81
239 0.8
240 0.78
241 0.75
242 0.69