Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K5VLS3

Protein Details
Accession K5VLS3    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
205-224GRNRGSSRPPPPQRRNRSASHydrophilic
229-253RGSRSPPRRYRSPPRGKPRSRSRSGBasic
273-292IRSSRSRSPHINRRRPRSPSHydrophilic
301-326DYAPNPKRRRVSRSPPPRRRRGSPGGBasic
328-416ISRSRSPPRGYRPNPRRRSASPPRRQSPGLRSRRRRGPSVSSVSRSPSPRRRSRSRDRGPPPRGKRRFESRSRTRSPPHSKKEKVSPDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
159-412DRGRGGGPGRGRGRGRGRGRGGFEDDRRPRDAGWGRRGGGGGGGGGGRNRGSSRPPPPQRRNRSASMASSRGSRSPPRRYRSPPRGKPRSRSRSGSRVPPRRSSIVKSLSRSPSIRSSRSRSPHINRRRPRSPSYTPPIRERDYAPNPKRRRVSRSPPPRRRRGSPGGSISRSRSPPRGYRPNPRRRSASPPRRQSPGLRSRRRRGPSVSSVSRSPSPRRRSRSRDRGPPPRGKRRFESRSRTRSPPHSKKEKV
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 14.333, cyto 6.5, cyto_mito 5.332
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002483  PWI_dom  
IPR036483  PWI_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
KEGG abp:AGABI1DRAFT116472  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01480  PWI  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51025  PWI  
Amino Acid Sequences MADAGFFKGTSAEQDRRFSDKELKLLKSMKFPPEFDKKVDMRKVNMNVIRPWVAKKIVELVGFEDEVVVEYAMGLLEEESLRTPDPKKMQINLTGFLTKHTPTFMSALWKLLLEAQEDVTGVPRTMVEEKKQEMRKARETDSRAIDERDRRARLDEVNDRGRGGGPGRGRGRGRGRGRGGFEDDRRPRDAGWGRRGGGGGGGGGGRNRGSSRPPPPQRRNRSASMASSRGSRSPPRRYRSPPRGKPRSRSRSGSRVPPRRSSIVKSLSRSPSIRSSRSRSPHINRRRPRSPSYTPPIRERDYAPNPKRRRVSRSPPPRRRRGSPGGSISRSRSPPRGYRPNPRRRSASPPRRQSPGLRSRRRRGPSVSSVSRSPSPRRRSRSRDRGPPPRGKRRFESRSRTRSPPHSKKEKVSPDEGAGSGGELKIRGQAEVERRKSKWDDGPSSAGDAMNKTAQADLEKRENELKEKALRNKVMRSRKGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.43
3 0.48
4 0.5
5 0.48
6 0.51
7 0.49
8 0.53
9 0.55
10 0.54
11 0.55
12 0.6
13 0.59
14 0.58
15 0.6
16 0.6
17 0.57
18 0.57
19 0.58
20 0.61
21 0.62
22 0.56
23 0.58
24 0.54
25 0.59
26 0.65
27 0.62
28 0.56
29 0.62
30 0.63
31 0.64
32 0.63
33 0.58
34 0.52
35 0.53
36 0.53
37 0.46
38 0.44
39 0.4
40 0.39
41 0.35
42 0.34
43 0.35
44 0.34
45 0.34
46 0.31
47 0.28
48 0.27
49 0.26
50 0.24
51 0.17
52 0.12
53 0.12
54 0.11
55 0.08
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.04
62 0.03
63 0.05
64 0.05
65 0.06
66 0.07
67 0.08
68 0.09
69 0.13
70 0.15
71 0.21
72 0.28
73 0.35
74 0.4
75 0.44
76 0.49
77 0.54
78 0.56
79 0.51
80 0.48
81 0.43
82 0.37
83 0.33
84 0.31
85 0.23
86 0.2
87 0.19
88 0.16
89 0.15
90 0.17
91 0.17
92 0.21
93 0.21
94 0.22
95 0.21
96 0.2
97 0.19
98 0.19
99 0.19
100 0.14
101 0.14
102 0.12
103 0.12
104 0.12
105 0.12
106 0.12
107 0.11
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.11
112 0.16
113 0.19
114 0.21
115 0.26
116 0.29
117 0.38
118 0.43
119 0.46
120 0.5
121 0.54
122 0.59
123 0.59
124 0.62
125 0.62
126 0.61
127 0.62
128 0.58
129 0.54
130 0.47
131 0.44
132 0.45
133 0.42
134 0.45
135 0.47
136 0.44
137 0.4
138 0.42
139 0.42
140 0.4
141 0.42
142 0.42
143 0.41
144 0.44
145 0.44
146 0.4
147 0.37
148 0.34
149 0.27
150 0.21
151 0.19
152 0.15
153 0.23
154 0.25
155 0.3
156 0.3
157 0.36
158 0.42
159 0.46
160 0.5
161 0.51
162 0.54
163 0.53
164 0.56
165 0.52
166 0.51
167 0.48
168 0.46
169 0.47
170 0.47
171 0.45
172 0.44
173 0.41
174 0.35
175 0.39
176 0.43
177 0.41
178 0.44
179 0.45
180 0.44
181 0.45
182 0.44
183 0.35
184 0.28
185 0.19
186 0.12
187 0.07
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.07
196 0.12
197 0.19
198 0.26
199 0.36
200 0.45
201 0.56
202 0.65
203 0.74
204 0.79
205 0.81
206 0.8
207 0.73
208 0.71
209 0.63
210 0.58
211 0.53
212 0.45
213 0.37
214 0.35
215 0.31
216 0.26
217 0.26
218 0.28
219 0.31
220 0.39
221 0.48
222 0.51
223 0.58
224 0.64
225 0.72
226 0.76
227 0.79
228 0.78
229 0.8
230 0.86
231 0.84
232 0.85
233 0.86
234 0.84
235 0.79
236 0.76
237 0.72
238 0.71
239 0.69
240 0.69
241 0.68
242 0.68
243 0.67
244 0.66
245 0.64
246 0.58
247 0.58
248 0.52
249 0.5
250 0.5
251 0.5
252 0.46
253 0.49
254 0.48
255 0.49
256 0.45
257 0.39
258 0.4
259 0.4
260 0.43
261 0.41
262 0.44
263 0.49
264 0.53
265 0.57
266 0.56
267 0.6
268 0.65
269 0.7
270 0.75
271 0.74
272 0.78
273 0.8
274 0.78
275 0.76
276 0.74
277 0.71
278 0.69
279 0.7
280 0.7
281 0.65
282 0.66
283 0.65
284 0.59
285 0.54
286 0.49
287 0.5
288 0.5
289 0.58
290 0.58
291 0.62
292 0.64
293 0.69
294 0.73
295 0.69
296 0.69
297 0.68
298 0.71
299 0.72
300 0.79
301 0.83
302 0.86
303 0.89
304 0.9
305 0.87
306 0.83
307 0.81
308 0.8
309 0.76
310 0.74
311 0.73
312 0.7
313 0.67
314 0.63
315 0.57
316 0.54
317 0.51
318 0.46
319 0.43
320 0.42
321 0.47
322 0.54
323 0.61
324 0.61
325 0.68
326 0.75
327 0.8
328 0.82
329 0.8
330 0.77
331 0.71
332 0.75
333 0.76
334 0.76
335 0.75
336 0.77
337 0.75
338 0.74
339 0.72
340 0.69
341 0.68
342 0.68
343 0.69
344 0.69
345 0.74
346 0.78
347 0.84
348 0.82
349 0.78
350 0.74
351 0.72
352 0.71
353 0.72
354 0.69
355 0.63
356 0.59
357 0.57
358 0.55
359 0.52
360 0.51
361 0.51
362 0.55
363 0.61
364 0.68
365 0.74
366 0.78
367 0.84
368 0.86
369 0.87
370 0.88
371 0.88
372 0.9
373 0.89
374 0.9
375 0.89
376 0.89
377 0.88
378 0.84
379 0.82
380 0.82
381 0.83
382 0.82
383 0.83
384 0.82
385 0.84
386 0.84
387 0.83
388 0.8
389 0.81
390 0.82
391 0.82
392 0.81
393 0.82
394 0.82
395 0.82
396 0.85
397 0.85
398 0.8
399 0.75
400 0.68
401 0.61
402 0.57
403 0.49
404 0.4
405 0.29
406 0.23
407 0.19
408 0.15
409 0.12
410 0.09
411 0.09
412 0.13
413 0.14
414 0.13
415 0.14
416 0.2
417 0.29
418 0.39
419 0.47
420 0.5
421 0.5
422 0.57
423 0.6
424 0.62
425 0.61
426 0.61
427 0.6
428 0.59
429 0.63
430 0.57
431 0.55
432 0.49
433 0.4
434 0.31
435 0.26
436 0.23
437 0.2
438 0.19
439 0.16
440 0.16
441 0.16
442 0.2
443 0.23
444 0.25
445 0.32
446 0.32
447 0.35
448 0.41
449 0.43
450 0.43
451 0.44
452 0.46
453 0.46
454 0.54
455 0.6
456 0.63
457 0.69
458 0.7
459 0.75
460 0.78
461 0.8