FuNGI

C4R668

Protein Details

Accession

C4R668

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
256-279	KFLNKRTHCLPIPKRKNQKELSYI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto_nucl 11, cyto 5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006397 P:mRNA processing
KEGG	ppa:PAS_chr3_0992 -
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MNSNQPELVLYHLSLKRPSASVKSVIGSFTGHKSKQELIVALHSSLIVYSLDTETGQLHKEREHELFCIVQNIAKFRIPGSIQHCLIITSDSGNITLTRLNEKIEFESLVNHPLTKTGLRRLNPSCYIAVDPKNRSFMLCALEKNKMITVLNRNSEDNTIKISSPLEANISKVVTFYTCALDVGYDNPLTATIECNYDSPTKKYLSYYELDLGLNHVVKKYTEEIPFKSNFLISIPRDAEGPSGLLLCSQGIIQFKFLNKRTHCLPIPKRKNQKELSYIINGECHKMKNSFFFLLQSDLGDIFKVSVTYQEVQDDTYDTKEVSSIEIKYFDSLPVCLDLHIFKSGFLFADTETGDKYLYQFEKLGDDDDGTIWSSENYPDEESVYEDHHIYFDTKELDNLSLVYILDCLNPITDGLLDQEKSQLVLTSGGSSRSSLKLLKHELAINELASSELPGSALNIFTTKVSHKDQYDKYMVISFIDGTLVLSIGESVDEVSDSGLELQVSTIAVQQVGRNSLAQVHSHGIVHLKGLNEPSFEKSLWQPPVGAEILVASMTNSQIALGLSNRELVYFEIDEYDQLIEHKERKEMSGRISALSLGQIPDGRLRSPFLAVGCNDMTIKILSTDPNSCLEVLSLQALSSIPSDLQITNLEQGAGYFVHIGLDSGIYIRTLLNRISGQLSDTRVNYLGPKRVSLSPVKIFGKNLVLAFSDTSYLSYNSGFDAKITPLCDGKFTYGCGFISEECPENGVVGVSAENLTIFTIDQLDTDMNVKDIPLTFTPRRITLVSEDVVVVTESQHYTKNPYLNSVATEESRELYQQIGYEKSSHWSSVIETVDIQSQQVIQAINLDKELAIFGSTKVSFASHPDEVYFIVSCSVEQELLPNINKGTQLRTYKITEEGLQFLHSTETDQLVYSLTEFQGKLLAGVGNLLVLYDLGLKKLLKKSLTQTSFHQITSIDYQGFRIVISDMKQSSMFLSFNAEENRFISLCDDITQRHITCSKMLDYSTVVTGDRFGTISVLRCPEKVNKDHLDYIEAKSKMIGECPFKLKQLASYYVQDVVTSLSRGSLTVGGKQSIIYTGLQGTIGILSPIQTPSDIDFFVSLEDSLRQELLKSKHLLTGRSHLKYRGYYVPAQGVVDGDLIQYFYQLPDSTKQFISTKLDRSTLEIERKISIMRSLVAL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.33
3	0.32
4	0.32
5	0.37
6	0.35
7	0.37
8	0.39
9	0.39
10	0.39
11	0.38
12	0.35
13	0.31
14	0.26
15	0.24
16	0.27
17	0.32
18	0.3
19	0.31
20	0.35
21	0.38
22	0.42
23	0.43
24	0.38
25	0.34
26	0.39
27	0.39
28	0.35
29	0.31
30	0.25
31	0.2
32	0.17
33	0.15
34	0.08
35	0.06
36	0.08
37	0.09
38	0.1
39	0.1
40	0.11
41	0.11
42	0.13
43	0.16
44	0.17
45	0.18
46	0.2
47	0.24
48	0.28
49	0.32
50	0.33
51	0.31
52	0.31
53	0.32
54	0.3
55	0.3
56	0.25
57	0.22
58	0.22
59	0.24
60	0.25
61	0.24
62	0.23
63	0.2
64	0.27
65	0.26
66	0.31
67	0.34
68	0.4
69	0.38
70	0.39
71	0.38
72	0.32
73	0.31
74	0.25
75	0.19
76	0.12
77	0.13
78	0.12
79	0.12
80	0.12
81	0.12
82	0.12
83	0.14
84	0.14
85	0.17
86	0.18
87	0.2
88	0.22
89	0.25
90	0.27
91	0.26
92	0.26
93	0.21
94	0.25
95	0.24
96	0.26
97	0.24
98	0.22
99	0.19
100	0.19
101	0.22
102	0.23
103	0.26
104	0.3
105	0.38
106	0.39
107	0.48
108	0.51
109	0.57
110	0.55
111	0.54
112	0.46
113	0.41
114	0.43
115	0.41
116	0.44
117	0.44
118	0.46
119	0.47
120	0.5
121	0.48
122	0.44
123	0.4
124	0.36
125	0.33
126	0.31
127	0.32
128	0.31
129	0.36
130	0.36
131	0.35
132	0.33
133	0.3
134	0.28
135	0.3
136	0.35
137	0.38
138	0.43
139	0.44
140	0.44
141	0.43
142	0.46
143	0.42
144	0.33
145	0.3
146	0.26
147	0.24
148	0.24
149	0.23
150	0.19
151	0.18
152	0.18
153	0.18
154	0.16
155	0.18
156	0.19
157	0.19
158	0.17
159	0.16
160	0.16
161	0.12
162	0.13
163	0.13
164	0.13
165	0.12
166	0.12
167	0.12
168	0.12
169	0.12
170	0.12
171	0.13
172	0.11
173	0.1
174	0.1
175	0.1
176	0.11
177	0.11
178	0.12
179	0.1
180	0.12
181	0.13
182	0.14
183	0.16
184	0.21
185	0.25
186	0.26
187	0.29
188	0.29
189	0.31
190	0.33
191	0.34
192	0.32
193	0.31
194	0.31
195	0.29
196	0.29
197	0.27
198	0.24
199	0.22
200	0.2
201	0.2
202	0.17
203	0.15
204	0.14
205	0.14
206	0.18
207	0.2
208	0.23
209	0.29
210	0.33
211	0.35
212	0.4
213	0.41
214	0.39
215	0.36
216	0.3
217	0.23
218	0.2
219	0.25
220	0.2
221	0.26
222	0.25
223	0.25
224	0.25
225	0.25
226	0.24
227	0.17
228	0.16
229	0.09
230	0.09
231	0.08
232	0.08
233	0.08
234	0.07
235	0.06
236	0.06
237	0.08
238	0.1
239	0.11
240	0.13
241	0.16
242	0.2
243	0.28
244	0.33
245	0.4
246	0.39
247	0.43
248	0.45
249	0.5
250	0.52
251	0.54
252	0.59
253	0.61
254	0.7
255	0.76
256	0.83
257	0.83
258	0.87
259	0.84
260	0.83
261	0.79
262	0.72
263	0.67
264	0.61
265	0.55
266	0.45
267	0.43
268	0.35
269	0.3
270	0.29
271	0.25
272	0.23
273	0.25
274	0.26
275	0.27
276	0.32
277	0.31
278	0.29
279	0.29
280	0.27
281	0.27
282	0.25
283	0.19
284	0.15
285	0.13
286	0.13
287	0.11
288	0.09
289	0.06
290	0.06
291	0.07
292	0.06
293	0.08
294	0.11
295	0.13
296	0.13
297	0.15
298	0.15
299	0.15
300	0.16
301	0.15
302	0.12
303	0.12
304	0.12
305	0.1
306	0.1
307	0.1
308	0.1
309	0.11
310	0.13
311	0.13
312	0.14
313	0.16
314	0.16
315	0.17
316	0.17
317	0.16
318	0.13
319	0.12
320	0.12
321	0.13
322	0.12
323	0.11
324	0.12
325	0.11
326	0.12
327	0.15
328	0.14
329	0.11
330	0.12
331	0.13
332	0.12
333	0.12
334	0.1
335	0.07
336	0.1
337	0.1
338	0.1
339	0.09
340	0.09
341	0.09
342	0.08
343	0.09
344	0.13
345	0.13
346	0.14
347	0.15
348	0.16
349	0.18
350	0.19
351	0.19
352	0.13
353	0.13
354	0.12
355	0.11
356	0.11
357	0.09
358	0.09
359	0.07
360	0.07
361	0.07
362	0.08
363	0.09
364	0.1
365	0.1
366	0.1
367	0.11
368	0.11
369	0.12
370	0.12
371	0.12
372	0.11
373	0.11
374	0.11
375	0.1
376	0.1
377	0.1
378	0.09
379	0.1
380	0.12
381	0.12
382	0.13
383	0.14
384	0.13
385	0.13
386	0.12
387	0.1
388	0.08
389	0.08
390	0.07
391	0.07
392	0.06
393	0.06
394	0.06
395	0.06
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.05
402	0.06
403	0.08
404	0.09
405	0.09
406	0.11
407	0.1
408	0.11
409	0.11
410	0.09
411	0.08
412	0.09
413	0.09
414	0.1
415	0.11
416	0.11
417	0.12
418	0.12
419	0.13
420	0.13
421	0.15
422	0.15
423	0.17
424	0.22
425	0.26
426	0.27
427	0.27
428	0.28
429	0.27
430	0.27
431	0.25
432	0.19
433	0.14
434	0.12
435	0.1
436	0.08
437	0.08
438	0.05
439	0.04
440	0.04
441	0.04
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.05
447	0.06
448	0.06
449	0.08
450	0.08
451	0.12
452	0.15
453	0.19
454	0.21
455	0.29
456	0.31
457	0.36
458	0.38
459	0.34
460	0.32
461	0.3
462	0.28
463	0.2
464	0.18
465	0.12
466	0.09
467	0.08
468	0.07
469	0.04
470	0.04
471	0.04
472	0.03
473	0.03
474	0.03
475	0.03
476	0.03
477	0.03
478	0.03
479	0.03
480	0.03
481	0.03
482	0.03
483	0.03
484	0.03
485	0.03
486	0.04
487	0.03
488	0.03
489	0.03
490	0.04
491	0.04
492	0.04
493	0.05
494	0.05
495	0.05
496	0.06
497	0.07
498	0.08
499	0.1
500	0.1
501	0.09
502	0.09
503	0.12
504	0.12
505	0.12
506	0.12
507	0.12
508	0.12
509	0.12
510	0.12
511	0.11
512	0.1
513	0.1
514	0.1
515	0.09
516	0.1
517	0.12
518	0.12
519	0.12
520	0.13
521	0.15
522	0.15
523	0.14
524	0.14
525	0.15
526	0.21
527	0.22
528	0.21
529	0.19
530	0.17
531	0.21
532	0.19
533	0.17
534	0.1
535	0.08
536	0.07
537	0.07
538	0.07
539	0.03
540	0.04
541	0.04
542	0.04
543	0.03
544	0.03
545	0.04
546	0.04
547	0.05
548	0.05
549	0.06
550	0.06
551	0.08
552	0.08
553	0.07
554	0.08
555	0.07
556	0.09
557	0.08
558	0.08
559	0.07
560	0.07
561	0.07
562	0.07
563	0.07
564	0.05
565	0.05
566	0.07
567	0.07
568	0.11
569	0.12
570	0.14
571	0.14
572	0.16
573	0.21
574	0.22
575	0.24
576	0.27
577	0.27
578	0.25
579	0.25
580	0.23
581	0.17
582	0.16
583	0.12
584	0.06
585	0.06
586	0.06
587	0.06
588	0.09
589	0.1
590	0.1
591	0.1
592	0.11
593	0.11
594	0.11
595	0.12
596	0.1
597	0.12
598	0.11
599	0.14
600	0.13
601	0.13
602	0.12
603	0.1
604	0.11
605	0.08
606	0.08
607	0.06
608	0.06
609	0.07
610	0.09
611	0.1
612	0.11
613	0.12
614	0.13
615	0.12
616	0.11
617	0.1
618	0.09
619	0.08
620	0.07
621	0.05
622	0.05
623	0.05
624	0.05
625	0.05
626	0.06
627	0.05
628	0.05
629	0.05
630	0.07
631	0.06
632	0.07
633	0.08
634	0.08
635	0.09
636	0.09
637	0.08
638	0.07
639	0.07
640	0.07
641	0.06
642	0.05
643	0.04
644	0.04
645	0.05
646	0.05
647	0.05
648	0.04
649	0.04
650	0.04
651	0.04
652	0.04
653	0.04
654	0.04
655	0.04
656	0.05
657	0.07
658	0.07
659	0.09
660	0.09
661	0.11
662	0.12
663	0.12
664	0.12
665	0.13
666	0.15
667	0.15
668	0.15
669	0.15
670	0.15
671	0.15
672	0.18
673	0.19
674	0.22
675	0.21
676	0.22
677	0.23
678	0.25
679	0.27
680	0.27
681	0.29
682	0.26
683	0.32
684	0.33
685	0.32
686	0.31
687	0.29
688	0.28
689	0.24
690	0.22
691	0.16
692	0.14
693	0.14
694	0.13
695	0.12
696	0.1
697	0.08
698	0.09
699	0.09
700	0.08
701	0.09
702	0.08
703	0.08
704	0.08
705	0.09
706	0.08
707	0.08
708	0.09
709	0.09
710	0.11
711	0.12
712	0.12
713	0.13
714	0.13
715	0.14
716	0.14
717	0.16
718	0.14
719	0.15
720	0.15
721	0.15
722	0.15
723	0.14
724	0.14
725	0.12
726	0.13
727	0.13
728	0.13
729	0.11
730	0.12
731	0.11
732	0.1
733	0.09
734	0.07
735	0.06
736	0.05
737	0.05
738	0.04
739	0.05
740	0.04
741	0.04
742	0.04
743	0.04
744	0.04
745	0.04
746	0.04
747	0.05
748	0.05
749	0.05
750	0.06
751	0.06
752	0.06
753	0.08
754	0.08
755	0.07
756	0.07
757	0.07
758	0.07
759	0.07
760	0.1
761	0.1
762	0.17
763	0.18
764	0.23
765	0.25
766	0.25
767	0.27
768	0.25
769	0.25
770	0.22
771	0.25
772	0.2
773	0.19
774	0.18
775	0.15
776	0.15
777	0.13
778	0.09
779	0.05
780	0.07
781	0.07
782	0.08
783	0.1
784	0.1
785	0.16
786	0.19
787	0.24
788	0.22
789	0.25
790	0.27
791	0.25
792	0.27
793	0.24
794	0.21
795	0.17
796	0.19
797	0.16
798	0.14
799	0.13
800	0.12
801	0.1
802	0.09
803	0.1
804	0.1
805	0.12
806	0.13
807	0.13
808	0.14
809	0.14
810	0.17
811	0.18
812	0.16
813	0.15
814	0.13
815	0.14
816	0.18
817	0.19
818	0.15
819	0.14
820	0.15
821	0.17
822	0.16
823	0.15
824	0.09
825	0.08
826	0.08
827	0.1
828	0.1
829	0.07
830	0.12
831	0.14
832	0.14
833	0.14
834	0.14
835	0.11
836	0.11
837	0.12
838	0.06
839	0.06
840	0.06
841	0.06
842	0.11
843	0.11
844	0.11
845	0.11
846	0.12
847	0.12
848	0.14
849	0.2
850	0.16
851	0.16
852	0.16
853	0.17
854	0.16
855	0.18
856	0.14
857	0.09
858	0.09
859	0.09
860	0.08
861	0.09
862	0.09
863	0.08
864	0.07
865	0.09
866	0.1
867	0.14
868	0.15
869	0.14
870	0.14
871	0.15
872	0.18
873	0.17
874	0.19
875	0.23
876	0.27
877	0.29
878	0.33
879	0.34
880	0.34
881	0.36
882	0.34
883	0.3
884	0.28
885	0.27
886	0.23
887	0.21
888	0.19
889	0.16
890	0.15
891	0.12
892	0.11
893	0.11
894	0.12
895	0.11
896	0.11
897	0.11
898	0.1
899	0.1
900	0.1
901	0.1
902	0.09
903	0.12
904	0.11
905	0.11
906	0.13
907	0.13
908	0.12
909	0.12
910	0.12
911	0.09
912	0.1
913	0.09
914	0.06
915	0.06
916	0.06
917	0.04
918	0.03
919	0.04
920	0.07
921	0.08
922	0.08
923	0.11
924	0.11
925	0.18
926	0.23
927	0.28
928	0.26
929	0.31
930	0.37
931	0.46
932	0.5
933	0.47
934	0.45
935	0.49
936	0.5
937	0.45
938	0.39
939	0.29
940	0.27
941	0.29
942	0.27
943	0.2
944	0.17
945	0.18
946	0.19
947	0.18
948	0.15
949	0.11
950	0.1
951	0.11
952	0.13
953	0.17
954	0.16
955	0.18
956	0.18
957	0.18
958	0.18
959	0.19
960	0.17
961	0.12
962	0.17
963	0.16
964	0.2
965	0.24
966	0.24
967	0.21
968	0.22
969	0.25
970	0.2
971	0.19
972	0.16
973	0.13
974	0.13
975	0.14
976	0.15
977	0.13
978	0.18
979	0.24
980	0.23
981	0.26
982	0.28
983	0.27
984	0.28
985	0.31
986	0.29
987	0.26
988	0.26
989	0.23
990	0.23
991	0.23
992	0.21
993	0.19
994	0.16
995	0.13
996	0.14
997	0.13
998	0.12
999	0.1
1000	0.09
1001	0.1
1002	0.11
1003	0.14
1004	0.17
1005	0.22
1006	0.22
1007	0.23
1008	0.27
1009	0.33
1010	0.4
1011	0.43
1012	0.47
1013	0.48
1014	0.52
1015	0.57
1016	0.54
1017	0.51
1018	0.46
1019	0.45
1020	0.45
1021	0.38
1022	0.33
1023	0.28
1024	0.3
1025	0.25
1026	0.27
1027	0.29
1028	0.26
1029	0.31
1030	0.37
1031	0.38
1032	0.37
1033	0.39
1034	0.35
1035	0.37
1036	0.37
1037	0.38
1038	0.36
1039	0.38
1040	0.38
1041	0.38
1042	0.37
1043	0.3
1044	0.23
1045	0.21
1046	0.18
1047	0.15
1048	0.13
1049	0.11
1050	0.11
1051	0.12
1052	0.13
1053	0.16
1054	0.16
1055	0.21
1056	0.24
1057	0.24
1058	0.24
1059	0.24
1060	0.23
1061	0.19
1062	0.2
1063	0.14
1064	0.12
1065	0.12
1066	0.13
1067	0.13
1068	0.12
1069	0.1
1070	0.09
1071	0.09
1072	0.07
1073	0.06
1074	0.07
1075	0.09
1076	0.1
1077	0.1
1078	0.1
1079	0.11
1080	0.14
1081	0.17
1082	0.16
1083	0.15
1084	0.14
1085	0.14
1086	0.14
1087	0.14
1088	0.11
1089	0.09
1090	0.11
1091	0.12
1092	0.12
1093	0.13
1094	0.12
1095	0.13
1096	0.21
1097	0.24
1098	0.3
1099	0.32
1100	0.33
1101	0.38
1102	0.41
1103	0.44
1104	0.42
1105	0.47
1106	0.49
1107	0.51
1108	0.53
1109	0.52
1110	0.55
1111	0.54
1112	0.55
1113	0.53
1114	0.49
1115	0.48
1116	0.49
1117	0.5
1118	0.45
1119	0.42
1120	0.37
1121	0.28
1122	0.24
1123	0.2
1124	0.15
1125	0.1
1126	0.08
1127	0.09
1128	0.08
1129	0.08
1130	0.08
1131	0.08
1132	0.11
1133	0.12
1134	0.14
1135	0.2
1136	0.25
1137	0.28
1138	0.29
1139	0.33
1140	0.32
1141	0.36
1142	0.41
1143	0.41
1144	0.45
1145	0.45
1146	0.48
1147	0.44
1148	0.48
1149	0.49
1150	0.49
1151	0.51
1152	0.47
1153	0.45
1154	0.43
1155	0.43
1156	0.4
1157	0.35
1158	0.31
1159	0.25

C4R668

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer