Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0UMI6

Protein Details
Accession Q0UMI6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
305-341APAEDGEKKKKKRKREEGEEKKDKRKKRTSVEANGDABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
227-243KKRSLSKRRVPHKVTDK
273-332KHAKERKAREEREDKMKDKMDAKRRERMAEYVAPAEDGEKKKKKRKREEGEEKKDKRKKR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 14.5, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041174  KH_8  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR024166  rRNA_assembly_KRR1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG pno:SNOG_07028  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17903  KH_8  
CDD cd22393  KH-I_KRR1_rpt1  
cd22394  KH-I_KRR1_rpt2  
Amino Acid Sequences MPSTHKKEKPWDTDDIDKWKIEPFKPEDNTAGAFTDESRFSTLFPKYREQYLKGSWKFITQALAKHGVGCELNLVEGSMTVWTTQKTYDPAAILNARDLIKLLARSVPAPQAVKILDDEVAMDIIKIRNLVGNKERFVKRRQRILGPNGSTLKALELLTETYLLVQGNTVAAMGPFKGLKTVRRIIEDTMHNIHPIYAIKELMIKKELAKDPELVNESWDRFLPNFKKRSLSKRRVPHKVTDKAKKVYTPFPPPQEKSKVDLQIESGEYFLGKHAKERKAREEREDKMKDKMDAKRRERMAEYVAPAEDGEKKKKKRKREEGEEKKDKRKKRTSVEANGDADINDVLCIYTSTSFSNGRGISIFTTPPASKDFAALPAFQNPSLLEARAINVPTNTSRATSIPNKGIGLLATKPLSFKDRITSHTPVFLAYLEGELSTLDRENWWRRAIHQLPVKSREEFLALAYVFGDERVRVQDIVKANTFQVEVGGVNHLAIFPETSRLNHACNAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.7
3 0.63
4 0.54
5 0.49
6 0.48
7 0.49
8 0.42
9 0.44
10 0.43
11 0.5
12 0.53
13 0.56
14 0.52
15 0.48
16 0.47
17 0.39
18 0.33
19 0.24
20 0.2
21 0.18
22 0.19
23 0.16
24 0.16
25 0.18
26 0.17
27 0.17
28 0.24
29 0.3
30 0.32
31 0.36
32 0.43
33 0.43
34 0.52
35 0.58
36 0.55
37 0.56
38 0.59
39 0.65
40 0.59
41 0.61
42 0.52
43 0.49
44 0.47
45 0.41
46 0.38
47 0.31
48 0.33
49 0.33
50 0.38
51 0.35
52 0.34
53 0.33
54 0.29
55 0.25
56 0.21
57 0.18
58 0.12
59 0.13
60 0.1
61 0.1
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.05
66 0.05
67 0.06
68 0.07
69 0.08
70 0.09
71 0.1
72 0.13
73 0.16
74 0.18
75 0.2
76 0.2
77 0.2
78 0.24
79 0.25
80 0.22
81 0.21
82 0.22
83 0.2
84 0.19
85 0.19
86 0.15
87 0.15
88 0.16
89 0.16
90 0.15
91 0.15
92 0.16
93 0.18
94 0.21
95 0.21
96 0.22
97 0.21
98 0.22
99 0.21
100 0.22
101 0.2
102 0.17
103 0.14
104 0.12
105 0.12
106 0.09
107 0.09
108 0.07
109 0.07
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.11
116 0.13
117 0.19
118 0.24
119 0.29
120 0.31
121 0.39
122 0.44
123 0.45
124 0.53
125 0.58
126 0.58
127 0.63
128 0.67
129 0.67
130 0.71
131 0.75
132 0.76
133 0.68
134 0.66
135 0.59
136 0.53
137 0.44
138 0.36
139 0.28
140 0.2
141 0.17
142 0.11
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.09
148 0.07
149 0.08
150 0.08
151 0.06
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.09
165 0.11
166 0.15
167 0.22
168 0.28
169 0.3
170 0.34
171 0.36
172 0.33
173 0.38
174 0.37
175 0.34
176 0.32
177 0.29
178 0.25
179 0.24
180 0.22
181 0.17
182 0.16
183 0.13
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.16
188 0.16
189 0.17
190 0.17
191 0.16
192 0.16
193 0.24
194 0.27
195 0.24
196 0.25
197 0.25
198 0.24
199 0.28
200 0.29
201 0.22
202 0.2
203 0.2
204 0.19
205 0.18
206 0.17
207 0.14
208 0.11
209 0.19
210 0.25
211 0.3
212 0.33
213 0.34
214 0.41
215 0.44
216 0.55
217 0.59
218 0.61
219 0.62
220 0.67
221 0.75
222 0.78
223 0.77
224 0.75
225 0.74
226 0.74
227 0.74
228 0.73
229 0.71
230 0.66
231 0.64
232 0.58
233 0.52
234 0.49
235 0.47
236 0.46
237 0.44
238 0.47
239 0.52
240 0.5
241 0.53
242 0.54
243 0.49
244 0.44
245 0.46
246 0.44
247 0.38
248 0.37
249 0.31
250 0.27
251 0.26
252 0.22
253 0.16
254 0.1
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.13
261 0.22
262 0.29
263 0.36
264 0.41
265 0.5
266 0.57
267 0.6
268 0.64
269 0.64
270 0.61
271 0.66
272 0.67
273 0.58
274 0.54
275 0.54
276 0.49
277 0.47
278 0.51
279 0.5
280 0.54
281 0.57
282 0.59
283 0.58
284 0.59
285 0.54
286 0.49
287 0.44
288 0.38
289 0.35
290 0.29
291 0.26
292 0.22
293 0.2
294 0.18
295 0.19
296 0.18
297 0.25
298 0.32
299 0.4
300 0.49
301 0.55
302 0.65
303 0.71
304 0.79
305 0.81
306 0.84
307 0.88
308 0.9
309 0.95
310 0.95
311 0.9
312 0.89
313 0.86
314 0.82
315 0.81
316 0.8
317 0.78
318 0.76
319 0.81
320 0.8
321 0.83
322 0.84
323 0.8
324 0.71
325 0.62
326 0.53
327 0.42
328 0.32
329 0.22
330 0.13
331 0.06
332 0.05
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.06
338 0.07
339 0.08
340 0.1
341 0.12
342 0.12
343 0.17
344 0.16
345 0.16
346 0.16
347 0.16
348 0.15
349 0.16
350 0.15
351 0.11
352 0.15
353 0.14
354 0.15
355 0.17
356 0.18
357 0.16
358 0.18
359 0.18
360 0.19
361 0.21
362 0.2
363 0.19
364 0.22
365 0.24
366 0.22
367 0.22
368 0.16
369 0.18
370 0.18
371 0.17
372 0.13
373 0.12
374 0.14
375 0.16
376 0.17
377 0.14
378 0.13
379 0.15
380 0.16
381 0.18
382 0.18
383 0.16
384 0.16
385 0.16
386 0.23
387 0.27
388 0.31
389 0.32
390 0.34
391 0.33
392 0.31
393 0.31
394 0.25
395 0.22
396 0.17
397 0.17
398 0.16
399 0.16
400 0.16
401 0.17
402 0.21
403 0.2
404 0.21
405 0.26
406 0.28
407 0.33
408 0.39
409 0.43
410 0.39
411 0.42
412 0.41
413 0.32
414 0.3
415 0.25
416 0.19
417 0.14
418 0.13
419 0.09
420 0.08
421 0.08
422 0.07
423 0.07
424 0.07
425 0.08
426 0.07
427 0.1
428 0.17
429 0.24
430 0.29
431 0.32
432 0.32
433 0.34
434 0.45
435 0.46
436 0.48
437 0.49
438 0.52
439 0.57
440 0.62
441 0.63
442 0.54
443 0.51
444 0.44
445 0.39
446 0.32
447 0.25
448 0.24
449 0.21
450 0.19
451 0.18
452 0.17
453 0.13
454 0.14
455 0.14
456 0.07
457 0.09
458 0.13
459 0.15
460 0.15
461 0.16
462 0.22
463 0.26
464 0.32
465 0.33
466 0.31
467 0.29
468 0.31
469 0.3
470 0.24
471 0.19
472 0.14
473 0.12
474 0.12
475 0.14
476 0.11
477 0.11
478 0.11
479 0.1
480 0.1
481 0.1
482 0.1
483 0.08
484 0.13
485 0.15
486 0.16
487 0.23
488 0.25
489 0.27