Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K5VRD0

Protein Details
Accession K5VRD0    Localization Confidence High Confidence Score 20.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
371-399NFGQSSRSHKPYKKNKHRSQKSIPRYSNIHydrophilic
490-509ECFFCHKKGHWYRDCRARKLHydrophilic
519-555MDRNPGTDRKKKQGNGKPKKQKTWKKKEPIDPNAMVYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
380-388KPYKKNKHR
525-545TDRKKKQGNGKPKKQKTWKKK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045358  Ty3_capsid  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG abp:AGABI1DRAFT93686  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF19259  Ty3_capsid  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MESFFSNKFKQTAYKEDKTKKWYYTNITEGRSYYFDDADQQRIASECLEHETQKLFRAANVPRIRTSSQDEHINRQTSEAIRNLRSATQSAAQSATHSAKSDHQEKGKDKEPSQSIFDWPETTVGEGNTDSGKGNPGPRNQDTESPQEEIKTNRSPTGNTNSSPPKSPQPTPPRTPTPPTPPAGNPGSPTGNMAQPPAGPHIKYPKPNRYYGDPRLYRPWMVSLELYFNSYGITTDNSKINYTLGLLEGAASNWKSDFIATHPNYPNWTDFKNSLEQAFAPAQQGYEAEQKLRRYRQNGEYIEHYISGFSVLSSQAGLPDSTALRAYFAEGLDKDVRIEAIRFTPTTLQQWKDAARNAFRIVMEQRKASGNFGQSSRSHKPYKKNKHRSQKSIPRYSNIYNEPVQHKPARSEWDMDVDQIYFQLNQLGLDNESEDSESESEESESEDSDDEEVNFIRQRRTQTQTPKQAVQGFINAILTDEQRAALKRGECFFCHKKGHWYRDCRARKLYIKQGGRTSMDRNPGTDRKKKQGNGKPKKQKTWKKKEPIDPNAMVYNIEEEEDNFEEFSKDGNF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.66
3 0.73
4 0.78
5 0.78
6 0.79
7 0.76
8 0.75
9 0.74
10 0.73
11 0.72
12 0.74
13 0.73
14 0.68
15 0.63
16 0.56
17 0.51
18 0.44
19 0.38
20 0.31
21 0.25
22 0.22
23 0.27
24 0.29
25 0.3
26 0.29
27 0.26
28 0.24
29 0.24
30 0.25
31 0.18
32 0.16
33 0.12
34 0.17
35 0.19
36 0.19
37 0.2
38 0.24
39 0.25
40 0.28
41 0.31
42 0.26
43 0.26
44 0.33
45 0.35
46 0.4
47 0.47
48 0.45
49 0.44
50 0.49
51 0.48
52 0.45
53 0.49
54 0.46
55 0.43
56 0.5
57 0.5
58 0.53
59 0.59
60 0.59
61 0.51
62 0.45
63 0.45
64 0.38
65 0.4
66 0.38
67 0.36
68 0.34
69 0.36
70 0.36
71 0.35
72 0.34
73 0.3
74 0.27
75 0.26
76 0.26
77 0.25
78 0.24
79 0.21
80 0.2
81 0.23
82 0.23
83 0.19
84 0.19
85 0.19
86 0.24
87 0.31
88 0.36
89 0.38
90 0.41
91 0.48
92 0.52
93 0.56
94 0.58
95 0.59
96 0.54
97 0.56
98 0.56
99 0.51
100 0.51
101 0.46
102 0.42
103 0.38
104 0.38
105 0.3
106 0.25
107 0.23
108 0.19
109 0.18
110 0.16
111 0.12
112 0.12
113 0.11
114 0.12
115 0.11
116 0.11
117 0.1
118 0.09
119 0.12
120 0.13
121 0.21
122 0.25
123 0.31
124 0.38
125 0.4
126 0.46
127 0.46
128 0.5
129 0.46
130 0.48
131 0.45
132 0.39
133 0.37
134 0.32
135 0.32
136 0.29
137 0.31
138 0.3
139 0.29
140 0.31
141 0.32
142 0.32
143 0.36
144 0.42
145 0.4
146 0.34
147 0.39
148 0.42
149 0.43
150 0.44
151 0.41
152 0.41
153 0.43
154 0.46
155 0.5
156 0.53
157 0.59
158 0.62
159 0.67
160 0.66
161 0.65
162 0.68
163 0.65
164 0.63
165 0.61
166 0.56
167 0.53
168 0.46
169 0.47
170 0.44
171 0.38
172 0.31
173 0.27
174 0.27
175 0.23
176 0.24
177 0.19
178 0.18
179 0.17
180 0.16
181 0.14
182 0.12
183 0.14
184 0.17
185 0.18
186 0.15
187 0.17
188 0.26
189 0.31
190 0.38
191 0.45
192 0.51
193 0.53
194 0.58
195 0.59
196 0.59
197 0.62
198 0.62
199 0.64
200 0.57
201 0.56
202 0.57
203 0.56
204 0.48
205 0.4
206 0.35
207 0.26
208 0.24
209 0.22
210 0.16
211 0.17
212 0.16
213 0.17
214 0.13
215 0.11
216 0.1
217 0.09
218 0.08
219 0.06
220 0.07
221 0.08
222 0.11
223 0.13
224 0.14
225 0.15
226 0.15
227 0.14
228 0.13
229 0.11
230 0.1
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.07
246 0.17
247 0.18
248 0.26
249 0.28
250 0.29
251 0.3
252 0.31
253 0.31
254 0.23
255 0.23
256 0.18
257 0.17
258 0.19
259 0.21
260 0.2
261 0.18
262 0.16
263 0.15
264 0.16
265 0.15
266 0.14
267 0.11
268 0.1
269 0.1
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.13
274 0.12
275 0.13
276 0.16
277 0.2
278 0.25
279 0.31
280 0.34
281 0.33
282 0.4
283 0.45
284 0.52
285 0.51
286 0.47
287 0.44
288 0.42
289 0.38
290 0.32
291 0.24
292 0.15
293 0.12
294 0.11
295 0.07
296 0.05
297 0.05
298 0.04
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.06
304 0.06
305 0.05
306 0.06
307 0.06
308 0.07
309 0.08
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.1
317 0.09
318 0.13
319 0.13
320 0.13
321 0.13
322 0.11
323 0.12
324 0.1
325 0.1
326 0.08
327 0.09
328 0.11
329 0.11
330 0.12
331 0.14
332 0.15
333 0.21
334 0.24
335 0.23
336 0.24
337 0.27
338 0.29
339 0.3
340 0.33
341 0.31
342 0.29
343 0.31
344 0.3
345 0.3
346 0.27
347 0.26
348 0.26
349 0.29
350 0.28
351 0.25
352 0.26
353 0.27
354 0.28
355 0.27
356 0.27
357 0.23
358 0.24
359 0.25
360 0.27
361 0.25
362 0.32
363 0.35
364 0.38
365 0.42
366 0.45
367 0.54
368 0.61
369 0.71
370 0.75
371 0.81
372 0.84
373 0.88
374 0.93
375 0.92
376 0.92
377 0.91
378 0.9
379 0.89
380 0.82
381 0.75
382 0.7
383 0.64
384 0.6
385 0.53
386 0.47
387 0.38
388 0.4
389 0.4
390 0.37
391 0.39
392 0.36
393 0.34
394 0.33
395 0.36
396 0.38
397 0.35
398 0.36
399 0.33
400 0.35
401 0.34
402 0.31
403 0.27
404 0.2
405 0.18
406 0.14
407 0.14
408 0.07
409 0.07
410 0.09
411 0.08
412 0.08
413 0.09
414 0.1
415 0.1
416 0.1
417 0.11
418 0.09
419 0.09
420 0.09
421 0.08
422 0.09
423 0.08
424 0.09
425 0.08
426 0.09
427 0.09
428 0.08
429 0.09
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.09
436 0.1
437 0.08
438 0.09
439 0.09
440 0.11
441 0.14
442 0.15
443 0.18
444 0.21
445 0.28
446 0.35
447 0.41
448 0.48
449 0.56
450 0.65
451 0.71
452 0.73
453 0.7
454 0.68
455 0.66
456 0.61
457 0.52
458 0.45
459 0.36
460 0.31
461 0.27
462 0.22
463 0.17
464 0.16
465 0.14
466 0.11
467 0.1
468 0.1
469 0.12
470 0.14
471 0.16
472 0.19
473 0.22
474 0.26
475 0.32
476 0.35
477 0.34
478 0.41
479 0.45
480 0.48
481 0.51
482 0.49
483 0.54
484 0.61
485 0.69
486 0.7
487 0.73
488 0.73
489 0.78
490 0.84
491 0.8
492 0.77
493 0.75
494 0.75
495 0.75
496 0.77
497 0.76
498 0.74
499 0.74
500 0.74
501 0.71
502 0.66
503 0.61
504 0.56
505 0.52
506 0.54
507 0.48
508 0.44
509 0.46
510 0.51
511 0.56
512 0.6
513 0.61
514 0.62
515 0.71
516 0.74
517 0.77
518 0.78
519 0.81
520 0.83
521 0.87
522 0.88
523 0.89
524 0.93
525 0.94
526 0.94
527 0.94
528 0.94
529 0.94
530 0.94
531 0.94
532 0.93
533 0.93
534 0.92
535 0.9
536 0.82
537 0.75
538 0.67
539 0.58
540 0.48
541 0.37
542 0.3
543 0.21
544 0.18
545 0.14
546 0.11
547 0.16
548 0.17
549 0.17
550 0.15
551 0.15
552 0.15
553 0.15