Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K5W9C0

Protein Details
Accession K5W9C0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
271-297QEPPKGPPGGGKKKRKRTSLAAPPALPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
274-288PKGPPGGGKKKRKRT
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG abp:AGABI1DRAFT66107  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MDINELHPPDDYSHRFFIWHEWIQAHGPLTTENVFDYFTTSMFYDKQSNNQVLRMQTMHTGIPIANEAEELKRFTGIEFALVHAQPPSFFIIHKRERLSPDDAKPLAAYFIVHNRIYQSPDVYSILSNRLLATVQSLQASLNILRKYRPDYTPRTGFVWPIADPNLPDDISKTRKQDSEATAPEQDSLAPDTNKNSQNAKKEQNTALLFNAMRTTAAHSRLSYSPVTAEAADTGAATATPALTQQRSSVTPAPGSQETLAKGSAATVNQIQEPPKGPPGGGKKKRKRTSLAAPPALP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.33
3 0.33
4 0.36
5 0.36
6 0.36
7 0.33
8 0.3
9 0.32
10 0.34
11 0.36
12 0.3
13 0.22
14 0.18
15 0.16
16 0.19
17 0.17
18 0.15
19 0.13
20 0.13
21 0.13
22 0.12
23 0.14
24 0.12
25 0.11
26 0.12
27 0.11
28 0.13
29 0.13
30 0.16
31 0.21
32 0.21
33 0.28
34 0.34
35 0.4
36 0.39
37 0.42
38 0.44
39 0.37
40 0.39
41 0.33
42 0.27
43 0.24
44 0.24
45 0.21
46 0.17
47 0.17
48 0.13
49 0.13
50 0.13
51 0.1
52 0.08
53 0.09
54 0.09
55 0.1
56 0.12
57 0.13
58 0.12
59 0.12
60 0.12
61 0.12
62 0.14
63 0.12
64 0.14
65 0.12
66 0.13
67 0.16
68 0.16
69 0.16
70 0.13
71 0.13
72 0.11
73 0.12
74 0.13
75 0.09
76 0.1
77 0.15
78 0.24
79 0.3
80 0.35
81 0.37
82 0.39
83 0.42
84 0.46
85 0.48
86 0.46
87 0.44
88 0.46
89 0.43
90 0.39
91 0.35
92 0.31
93 0.24
94 0.18
95 0.14
96 0.07
97 0.13
98 0.16
99 0.16
100 0.16
101 0.18
102 0.2
103 0.21
104 0.21
105 0.17
106 0.13
107 0.15
108 0.16
109 0.14
110 0.13
111 0.12
112 0.13
113 0.12
114 0.12
115 0.1
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.1
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.09
128 0.13
129 0.13
130 0.13
131 0.14
132 0.16
133 0.21
134 0.24
135 0.27
136 0.28
137 0.34
138 0.4
139 0.44
140 0.44
141 0.42
142 0.39
143 0.34
144 0.3
145 0.25
146 0.18
147 0.15
148 0.15
149 0.12
150 0.11
151 0.13
152 0.13
153 0.11
154 0.1
155 0.11
156 0.14
157 0.19
158 0.23
159 0.24
160 0.26
161 0.27
162 0.3
163 0.36
164 0.36
165 0.39
166 0.38
167 0.39
168 0.37
169 0.35
170 0.33
171 0.26
172 0.2
173 0.13
174 0.13
175 0.13
176 0.12
177 0.13
178 0.15
179 0.22
180 0.25
181 0.26
182 0.3
183 0.32
184 0.4
185 0.47
186 0.52
187 0.5
188 0.53
189 0.53
190 0.54
191 0.51
192 0.44
193 0.38
194 0.33
195 0.28
196 0.23
197 0.21
198 0.13
199 0.12
200 0.11
201 0.15
202 0.16
203 0.2
204 0.21
205 0.21
206 0.25
207 0.26
208 0.28
209 0.23
210 0.2
211 0.17
212 0.16
213 0.17
214 0.13
215 0.12
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.09
229 0.1
230 0.11
231 0.13
232 0.16
233 0.18
234 0.24
235 0.28
236 0.27
237 0.28
238 0.29
239 0.33
240 0.3
241 0.31
242 0.27
243 0.25
244 0.23
245 0.23
246 0.22
247 0.16
248 0.15
249 0.14
250 0.16
251 0.13
252 0.14
253 0.15
254 0.17
255 0.19
256 0.22
257 0.22
258 0.23
259 0.25
260 0.27
261 0.3
262 0.29
263 0.27
264 0.33
265 0.42
266 0.49
267 0.57
268 0.64
269 0.69
270 0.79
271 0.88
272 0.89
273 0.86
274 0.84
275 0.85
276 0.85
277 0.85