Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R3J1

Protein Details
Accession C4R3J1    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-32ISSNKKPVVRSKKAPAPKASKHydrophilic
193-221KPAPSKAGPKGGKKVRKPKKTVEELDQEMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-43KKPVVRSKKAPAPKASKVAKVSKKQVAR
178-212NKKKGPKATSKPAAAKPAPSKAGPKGGKKVRKPKK
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 9, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG ppa:PAS_chr3_0097  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MASLDKSLDEIISSNKKPVVRSKKAPAPKASKVAKVSKKQVARNNIPKASVPKTPGSSDYIDPSYATKVIVYNLPHDIKQNAVKEFFQSQVGGVKSIALSYNEKGLSKGIATVVFRDNTHATTAVKKYNGAPIDGGANKLRLEMIFDPTKKPLISRISANPVVEKPRKLNVQPIQTINKKKGPKATSKPAAAKPAPSKAGPKGGKKVRKPKKTVEELDQEMADYFENKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.31
3 0.33
4 0.36
5 0.46
6 0.5
7 0.51
8 0.58
9 0.65
10 0.71
11 0.78
12 0.82
13 0.81
14 0.78
15 0.76
16 0.77
17 0.72
18 0.7
19 0.67
20 0.69
21 0.69
22 0.69
23 0.7
24 0.68
25 0.71
26 0.72
27 0.74
28 0.74
29 0.75
30 0.76
31 0.77
32 0.72
33 0.66
34 0.61
35 0.59
36 0.53
37 0.48
38 0.41
39 0.37
40 0.38
41 0.38
42 0.36
43 0.34
44 0.33
45 0.3
46 0.3
47 0.26
48 0.23
49 0.21
50 0.2
51 0.18
52 0.15
53 0.14
54 0.1
55 0.1
56 0.1
57 0.14
58 0.14
59 0.14
60 0.19
61 0.2
62 0.2
63 0.21
64 0.21
65 0.2
66 0.25
67 0.27
68 0.24
69 0.25
70 0.25
71 0.25
72 0.27
73 0.24
74 0.19
75 0.15
76 0.13
77 0.16
78 0.16
79 0.14
80 0.12
81 0.11
82 0.1
83 0.1
84 0.11
85 0.08
86 0.1
87 0.09
88 0.13
89 0.13
90 0.14
91 0.14
92 0.13
93 0.12
94 0.1
95 0.1
96 0.07
97 0.09
98 0.09
99 0.1
100 0.12
101 0.12
102 0.12
103 0.14
104 0.14
105 0.12
106 0.13
107 0.12
108 0.11
109 0.15
110 0.17
111 0.18
112 0.18
113 0.18
114 0.18
115 0.22
116 0.23
117 0.19
118 0.17
119 0.14
120 0.18
121 0.17
122 0.18
123 0.13
124 0.13
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.08
129 0.12
130 0.11
131 0.16
132 0.2
133 0.21
134 0.23
135 0.24
136 0.27
137 0.23
138 0.22
139 0.24
140 0.24
141 0.26
142 0.29
143 0.32
144 0.37
145 0.4
146 0.4
147 0.35
148 0.32
149 0.37
150 0.37
151 0.35
152 0.31
153 0.35
154 0.4
155 0.39
156 0.47
157 0.46
158 0.5
159 0.52
160 0.54
161 0.55
162 0.57
163 0.62
164 0.58
165 0.58
166 0.54
167 0.54
168 0.58
169 0.57
170 0.6
171 0.63
172 0.68
173 0.69
174 0.72
175 0.75
176 0.71
177 0.73
178 0.64
179 0.63
180 0.58
181 0.57
182 0.53
183 0.48
184 0.47
185 0.43
186 0.52
187 0.51
188 0.52
189 0.55
190 0.62
191 0.69
192 0.74
193 0.81
194 0.81
195 0.85
196 0.85
197 0.86
198 0.87
199 0.88
200 0.84
201 0.82
202 0.8
203 0.75
204 0.7
205 0.6
206 0.49
207 0.39
208 0.32
209 0.24