Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K5VQ82

Protein Details
Accession K5VQ82    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
238-265GTMFKIDYAKPKRERRSLPPRRRLNSYDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
247-260KPKRERRSLPPRRR
Subcellular Location(s) mito 16, nucl 8, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG abp:AGABI1DRAFT115701  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MFSTLIRQQAPLAFSARLSLPLHRQLLRSLPAAVQKPNVVSQRAFSVSRTRFAGAFSSRRSEGRDARSEFPEEREKTSVLYVGNIPFTAGEVDIRELFEPYGQVKRVTLASDRNGRLTGFGFVEYDNLENAVAAIESSYQEPFALLNRTLKLNYAHNRNPFEAKNVEPAKTISIANFPIPGDERPLRHLMQKYEEHIVRINFMKNADGEFTSRVFIEFADQENATAALEAFQDYNFEGTMFKIDYAKPKRERRSLPPRRRLNSYDH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.19
4 0.2
5 0.2
6 0.22
7 0.26
8 0.33
9 0.38
10 0.38
11 0.39
12 0.38
13 0.42
14 0.42
15 0.37
16 0.31
17 0.29
18 0.33
19 0.35
20 0.34
21 0.31
22 0.29
23 0.29
24 0.34
25 0.35
26 0.32
27 0.29
28 0.28
29 0.31
30 0.32
31 0.31
32 0.26
33 0.32
34 0.31
35 0.34
36 0.35
37 0.31
38 0.28
39 0.28
40 0.32
41 0.28
42 0.31
43 0.3
44 0.32
45 0.33
46 0.34
47 0.37
48 0.37
49 0.39
50 0.41
51 0.47
52 0.47
53 0.5
54 0.51
55 0.51
56 0.45
57 0.43
58 0.44
59 0.37
60 0.37
61 0.35
62 0.32
63 0.3
64 0.3
65 0.27
66 0.18
67 0.18
68 0.16
69 0.15
70 0.15
71 0.13
72 0.13
73 0.09
74 0.1
75 0.09
76 0.07
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.09
88 0.12
89 0.13
90 0.13
91 0.12
92 0.14
93 0.15
94 0.15
95 0.16
96 0.17
97 0.21
98 0.28
99 0.29
100 0.28
101 0.28
102 0.26
103 0.24
104 0.21
105 0.18
106 0.1
107 0.1
108 0.09
109 0.08
110 0.09
111 0.08
112 0.08
113 0.06
114 0.06
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.05
129 0.05
130 0.07
131 0.09
132 0.09
133 0.12
134 0.13
135 0.14
136 0.14
137 0.16
138 0.16
139 0.21
140 0.25
141 0.31
142 0.35
143 0.4
144 0.43
145 0.43
146 0.45
147 0.38
148 0.37
149 0.32
150 0.28
151 0.31
152 0.3
153 0.29
154 0.26
155 0.26
156 0.23
157 0.22
158 0.21
159 0.13
160 0.14
161 0.14
162 0.14
163 0.14
164 0.13
165 0.12
166 0.14
167 0.14
168 0.17
169 0.19
170 0.19
171 0.22
172 0.26
173 0.26
174 0.3
175 0.34
176 0.31
177 0.36
178 0.38
179 0.37
180 0.41
181 0.41
182 0.36
183 0.36
184 0.32
185 0.28
186 0.28
187 0.27
188 0.21
189 0.21
190 0.21
191 0.18
192 0.19
193 0.17
194 0.15
195 0.15
196 0.15
197 0.15
198 0.14
199 0.13
200 0.13
201 0.11
202 0.1
203 0.12
204 0.12
205 0.13
206 0.16
207 0.16
208 0.15
209 0.16
210 0.16
211 0.12
212 0.11
213 0.08
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.08
223 0.08
224 0.07
225 0.08
226 0.11
227 0.11
228 0.12
229 0.14
230 0.16
231 0.26
232 0.34
233 0.43
234 0.49
235 0.59
236 0.67
237 0.74
238 0.8
239 0.81
240 0.85
241 0.87
242 0.88
243 0.89
244 0.9
245 0.85
246 0.86