FuNGI

Q0U4I3

Protein Details

Accession

Q0U4I3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
360-384	ITFPPNPPQKPRRPRKDGKEWTERE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
368-386	QKPRRPRKDGKEWTEREEP
388-390	GRK

Subcellular Location(s)

cyto 12, cyto_nucl 10.5, nucl 7, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR026258 SRP68 IPR034652 SRP68-RBD IPR038253 SRP68_N_sf
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0005786 C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting GO:0008312 F:7S RNA binding GO:0030942 F:endoplasmic reticulum signal peptide binding GO:0005047 F:signal recognition particle binding GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
KEGG	pno:SNOG_13331 -
Pfam	View protein in Pfam PF16969 SRP68
CDD	cd15481 SRP68-RBD

Amino Acid Sequences

MDITKFVSEFRESAFLLGDYSTYHTQLSRRLRIVEKKLGRATPKNAKYAAKAPVTAEDIAKNNEFLHLLLLTSERAWAQAMAMKAAHSEDNADKNITGSTRKHIVSRLHKAVQTAKQIIQLLSDSGASGANDTDVLEAKAYRYALAGAEEFEKQAEGVKASSASPQRWNLCLTNYSAARVIYSSLLKATKKDLFKEVLGGTIDPSIRYAAYQSRIPRTVGVPAIARKFFPQDEADLVKAVKQLDAASLEEEDDASSPNIVDAAIGQALVSADAASAVLNDSQAGAATAKDRANAYDDILIASQDTVDATRRAIEELEKEGVDEGDARMQDLRVTNLAVNYDLISWRVGRNRVLIGADDGITFPPNPPQKPRRPRKDGKEWTEREEPTGRKLARLRERIALYDAILQSIDSVKELRGAARDTAFVSELDGPTCLLPGTEMPKLIAFIRIPVETKGGIGTLQSCIVPVVTGCICPAAFDVLSVRGVEIRGDRARLENLTSHYRGVVALSQLFANSDTASKVGLSNAAPVVERLNEYPISGSVDLKNLVTWPPKLKPVPVKPLFLDVAWNYVEYPGRTPAKQEPVPEKAPAEETQPERPAAKKGWFSFGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.19
3	0.17
4	0.16
5	0.14
6	0.1
7	0.15
8	0.16
9	0.15
10	0.16
11	0.18
12	0.2
13	0.29
14	0.38
15	0.41
16	0.43
17	0.49
18	0.56
19	0.64
20	0.7
21	0.72
22	0.69
23	0.7
24	0.73
25	0.73
26	0.73
27	0.71
28	0.71
29	0.71
30	0.7
31	0.68
32	0.66
33	0.63
34	0.6
35	0.59
36	0.58
37	0.51
38	0.47
39	0.42
40	0.42
41	0.42
42	0.38
43	0.32
44	0.28
45	0.27
46	0.29
47	0.28
48	0.24
49	0.21
50	0.21
51	0.2
52	0.16
53	0.15
54	0.12
55	0.11
56	0.11
57	0.12
58	0.11
59	0.1
60	0.11
61	0.09
62	0.09
63	0.1
64	0.09
65	0.09
66	0.12
67	0.12
68	0.13
69	0.13
70	0.13
71	0.12
72	0.14
73	0.14
74	0.1
75	0.14
76	0.16
77	0.21
78	0.23
79	0.23
80	0.21
81	0.21
82	0.23
83	0.21
84	0.22
85	0.19
86	0.23
87	0.29
88	0.3
89	0.32
90	0.37
91	0.45
92	0.5
93	0.57
94	0.6
95	0.58
96	0.59
97	0.6
98	0.61
99	0.59
100	0.57
101	0.51
102	0.45
103	0.44
104	0.45
105	0.42
106	0.35
107	0.29
108	0.21
109	0.17
110	0.16
111	0.11
112	0.09
113	0.09
114	0.08
115	0.07
116	0.07
117	0.06
118	0.06
119	0.06
120	0.07
121	0.07
122	0.07
123	0.07
124	0.08
125	0.08
126	0.11
127	0.11
128	0.1
129	0.1
130	0.1
131	0.1
132	0.12
133	0.12
134	0.1
135	0.11
136	0.12
137	0.11
138	0.1
139	0.1
140	0.08
141	0.11
142	0.11
143	0.1
144	0.1
145	0.11
146	0.12
147	0.12
148	0.18
149	0.19
150	0.2
151	0.25
152	0.31
153	0.32
154	0.33
155	0.37
156	0.32
157	0.32
158	0.31
159	0.28
160	0.28
161	0.26
162	0.25
163	0.24
164	0.22
165	0.19
166	0.17
167	0.15
168	0.12
169	0.12
170	0.11
171	0.12
172	0.16
173	0.16
174	0.17
175	0.21
176	0.25
177	0.28
178	0.3
179	0.32
180	0.32
181	0.31
182	0.35
183	0.3
184	0.26
185	0.24
186	0.21
187	0.17
188	0.16
189	0.16
190	0.11
191	0.12
192	0.09
193	0.09
194	0.09
195	0.1
196	0.12
197	0.14
198	0.19
199	0.22
200	0.27
201	0.29
202	0.3
203	0.29
204	0.26
205	0.28
206	0.25
207	0.22
208	0.2
209	0.21
210	0.25
211	0.23
212	0.22
213	0.19
214	0.21
215	0.2
216	0.2
217	0.18
218	0.15
219	0.19
220	0.2
221	0.19
222	0.17
223	0.17
224	0.15
225	0.16
226	0.14
227	0.11
228	0.1
229	0.09
230	0.1
231	0.12
232	0.11
233	0.09
234	0.09
235	0.09
236	0.08
237	0.08
238	0.06
239	0.05
240	0.06
241	0.05
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.04
247	0.04
248	0.03
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.03
258	0.03
259	0.03
260	0.03
261	0.02
262	0.03
263	0.03
264	0.03
265	0.03
266	0.03
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.05
274	0.08
275	0.08
276	0.09
277	0.1
278	0.1
279	0.13
280	0.13
281	0.13
282	0.12
283	0.12
284	0.11
285	0.11
286	0.1
287	0.07
288	0.06
289	0.05
290	0.03
291	0.03
292	0.03
293	0.05
294	0.05
295	0.05
296	0.07
297	0.07
298	0.08
299	0.08
300	0.09
301	0.1
302	0.12
303	0.13
304	0.11
305	0.11
306	0.11
307	0.1
308	0.09
309	0.08
310	0.05
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.09
317	0.09
318	0.1
319	0.08
320	0.09
321	0.09
322	0.1
323	0.1
324	0.09
325	0.08
326	0.07
327	0.07
328	0.07
329	0.07
330	0.07
331	0.07
332	0.09
333	0.13
334	0.15
335	0.15
336	0.18
337	0.18
338	0.19
339	0.18
340	0.17
341	0.14
342	0.13
343	0.12
344	0.09
345	0.09
346	0.08
347	0.08
348	0.07
349	0.06
350	0.12
351	0.17
352	0.18
353	0.27
354	0.35
355	0.46
356	0.57
357	0.67
358	0.71
359	0.77
360	0.84
361	0.86
362	0.89
363	0.88
364	0.86
365	0.86
366	0.78
367	0.74
368	0.72
369	0.63
370	0.55
371	0.52
372	0.44
373	0.38
374	0.43
375	0.37
376	0.34
377	0.38
378	0.43
379	0.46
380	0.51
381	0.5
382	0.49
383	0.5
384	0.46
385	0.45
386	0.36
387	0.27
388	0.26
389	0.23
390	0.17
391	0.15
392	0.13
393	0.11
394	0.12
395	0.11
396	0.06
397	0.07
398	0.07
399	0.1
400	0.11
401	0.12
402	0.13
403	0.15
404	0.16
405	0.17
406	0.17
407	0.15
408	0.16
409	0.15
410	0.12
411	0.13
412	0.13
413	0.12
414	0.12
415	0.11
416	0.11
417	0.1
418	0.1
419	0.08
420	0.05
421	0.05
422	0.07
423	0.11
424	0.12
425	0.13
426	0.13
427	0.14
428	0.15
429	0.15
430	0.16
431	0.12
432	0.13
433	0.16
434	0.16
435	0.17
436	0.17
437	0.19
438	0.15
439	0.15
440	0.13
441	0.11
442	0.09
443	0.09
444	0.09
445	0.08
446	0.09
447	0.08
448	0.08
449	0.08
450	0.08
451	0.07
452	0.06
453	0.09
454	0.08
455	0.08
456	0.08
457	0.1
458	0.1
459	0.1
460	0.11
461	0.1
462	0.09
463	0.09
464	0.11
465	0.11
466	0.12
467	0.12
468	0.11
469	0.1
470	0.1
471	0.11
472	0.11
473	0.16
474	0.18
475	0.19
476	0.2
477	0.22
478	0.25
479	0.24
480	0.25
481	0.23
482	0.25
483	0.31
484	0.31
485	0.29
486	0.26
487	0.25
488	0.23
489	0.2
490	0.18
491	0.14
492	0.13
493	0.13
494	0.13
495	0.13
496	0.13
497	0.13
498	0.11
499	0.09
500	0.09
501	0.09
502	0.09
503	0.09
504	0.09
505	0.09
506	0.09
507	0.12
508	0.11
509	0.14
510	0.14
511	0.15
512	0.14
513	0.14
514	0.16
515	0.14
516	0.15
517	0.13
518	0.16
519	0.16
520	0.16
521	0.17
522	0.16
523	0.2
524	0.19
525	0.2
526	0.18
527	0.2
528	0.21
529	0.2
530	0.19
531	0.15
532	0.2
533	0.22
534	0.25
535	0.28
536	0.32
537	0.4
538	0.42
539	0.49
540	0.55
541	0.6
542	0.67
543	0.65
544	0.66
545	0.59
546	0.63
547	0.56
548	0.46
549	0.42
550	0.31
551	0.3
552	0.25
553	0.24
554	0.18
555	0.19
556	0.23
557	0.18
558	0.2
559	0.25
560	0.29
561	0.29
562	0.34
563	0.4
564	0.46
565	0.48
566	0.53
567	0.53
568	0.56
569	0.59
570	0.57
571	0.5
572	0.43
573	0.44
574	0.37
575	0.35
576	0.35
577	0.36
578	0.4
579	0.42
580	0.42
581	0.4
582	0.41
583	0.42
584	0.41
585	0.45
586	0.46
587	0.46

Q0U4I3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer