FuNGI

C4R219

Protein Details

Accession

C4R219

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
316-347	DDEKERAFKQSKKKKKNKNKNKTARDEDKNSS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
321-340	RAFKQSKKKKKNKNKNKTAR

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 15, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
KEGG	ppa:PAS_chr2-2_0363 -
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MSDNDICQPDKIAFGEDEKRDTKANLIPESLHTASTKSDESVKDLFQLAPEILDVHHKEEQEGDVAIESHENKDDLEPFLLQNNDNMVQRNTTSDDRIFVGIKGSNPSYSSDDCSESLDLESSSNESANSDQDSDLDSESESDSESETELNSVEANDLIHDSEDETSPAIGPIRSKNEVVDEKAPELPKDLVIDEGTPVELIGEISACVERSVVIKAYASGEFRVLKENSVLCLEDRTILGPLFEIFGKLETPFYRVKYNSVEEFENFKHMKGTKVYYLVPQSEFQYTEKIKSVKGTDASNWHDEEIPEEEQEFSDDEKERAFKQSKKKKKNKNKNKTARDEDKNSSEPSAKRRQNQVPNGYTNFTQLPIKYSLPQNSKVDPSVQQQILPTTTQRHALLESQSQPQLTSPIHAPERRSISSQSQLHLQQPSHPQFVPHDHSIALTHPQNYSPNEPSLKNIEMNSAYDQTPPQQAYYPPQPYGITQTHSQNKQALQNGMSLDTASMSESELKLQLQMQFQIMNQLASQLNHQQQQNSRYTTGHLPPYNQRKQPPPGNN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.31
3	0.31
4	0.37
5	0.35
6	0.36
7	0.35
8	0.35
9	0.35
10	0.32
11	0.37
12	0.34
13	0.35
14	0.34
15	0.35
16	0.41
17	0.36
18	0.33
19	0.26
20	0.23
21	0.23
22	0.25
23	0.23
24	0.17
25	0.23
26	0.22
27	0.27
28	0.29
29	0.28
30	0.28
31	0.28
32	0.27
33	0.22
34	0.23
35	0.18
36	0.15
37	0.14
38	0.12
39	0.1
40	0.17
41	0.18
42	0.2
43	0.24
44	0.24
45	0.24
46	0.25
47	0.26
48	0.21
49	0.2
50	0.15
51	0.13
52	0.13
53	0.13
54	0.14
55	0.13
56	0.13
57	0.14
58	0.14
59	0.14
60	0.16
61	0.19
62	0.18
63	0.19
64	0.18
65	0.17
66	0.21
67	0.23
68	0.2
69	0.19
70	0.21
71	0.22
72	0.23
73	0.25
74	0.21
75	0.22
76	0.22
77	0.23
78	0.24
79	0.24
80	0.26
81	0.24
82	0.25
83	0.24
84	0.26
85	0.24
86	0.2
87	0.2
88	0.18
89	0.19
90	0.21
91	0.21
92	0.2
93	0.2
94	0.23
95	0.24
96	0.24
97	0.26
98	0.25
99	0.26
100	0.25
101	0.27
102	0.24
103	0.2
104	0.19
105	0.15
106	0.13
107	0.11
108	0.11
109	0.1
110	0.1
111	0.09
112	0.09
113	0.09
114	0.09
115	0.11
116	0.12
117	0.12
118	0.11
119	0.12
120	0.14
121	0.14
122	0.13
123	0.12
124	0.1
125	0.09
126	0.1
127	0.1
128	0.08
129	0.07
130	0.07
131	0.07
132	0.08
133	0.07
134	0.07
135	0.07
136	0.07
137	0.06
138	0.06
139	0.06
140	0.06
141	0.06
142	0.06
143	0.06
144	0.06
145	0.06
146	0.06
147	0.06
148	0.06
149	0.07
150	0.08
151	0.08
152	0.08
153	0.07
154	0.07
155	0.08
156	0.08
157	0.08
158	0.1
159	0.15
160	0.2
161	0.22
162	0.22
163	0.22
164	0.28
165	0.31
166	0.32
167	0.32
168	0.28
169	0.28
170	0.31
171	0.31
172	0.24
173	0.24
174	0.21
175	0.17
176	0.17
177	0.15
178	0.12
179	0.12
180	0.12
181	0.1
182	0.09
183	0.08
184	0.07
185	0.06
186	0.05
187	0.04
188	0.04
189	0.03
190	0.03
191	0.03
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.05
198	0.06
199	0.07
200	0.08
201	0.08
202	0.08
203	0.09
204	0.11
205	0.12
206	0.12
207	0.11
208	0.12
209	0.13
210	0.14
211	0.19
212	0.17
213	0.16
214	0.18
215	0.18
216	0.17
217	0.17
218	0.17
219	0.11
220	0.12
221	0.12
222	0.1
223	0.09
224	0.09
225	0.09
226	0.08
227	0.08
228	0.07
229	0.07
230	0.07
231	0.06
232	0.06
233	0.05
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.08
238	0.07
239	0.11
240	0.13
241	0.15
242	0.19
243	0.19
244	0.21
245	0.24
246	0.26
247	0.26
248	0.26
249	0.25
250	0.22
251	0.25
252	0.23
253	0.25
254	0.22
255	0.2
256	0.21
257	0.21
258	0.23
259	0.21
260	0.24
261	0.2
262	0.22
263	0.23
264	0.22
265	0.24
266	0.23
267	0.22
268	0.2
269	0.19
270	0.18
271	0.18
272	0.15
273	0.19
274	0.18
275	0.18
276	0.21
277	0.2
278	0.2
279	0.21
280	0.23
281	0.2
282	0.22
283	0.21
284	0.19
285	0.24
286	0.27
287	0.26
288	0.25
289	0.22
290	0.21
291	0.19
292	0.19
293	0.16
294	0.14
295	0.12
296	0.12
297	0.11
298	0.1
299	0.11
300	0.1
301	0.07
302	0.09
303	0.1
304	0.1
305	0.11
306	0.13
307	0.13
308	0.19
309	0.24
310	0.27
311	0.37
312	0.48
313	0.58
314	0.67
315	0.77
316	0.81
317	0.87
318	0.93
319	0.93
320	0.94
321	0.95
322	0.94
323	0.95
324	0.93
325	0.91
326	0.89
327	0.85
328	0.8
329	0.73
330	0.68
331	0.61
332	0.52
333	0.44
334	0.4
335	0.35
336	0.36
337	0.42
338	0.41
339	0.44
340	0.52
341	0.6
342	0.65
343	0.71
344	0.73
345	0.68
346	0.68
347	0.64
348	0.57
349	0.48
350	0.4
351	0.32
352	0.24
353	0.2
354	0.15
355	0.17
356	0.18
357	0.19
358	0.21
359	0.25
360	0.32
361	0.34
362	0.4
363	0.4
364	0.39
365	0.4
366	0.38
367	0.36
368	0.31
369	0.31
370	0.33
371	0.3
372	0.28
373	0.26
374	0.27
375	0.26
376	0.23
377	0.21
378	0.18
379	0.19
380	0.21
381	0.21
382	0.2
383	0.2
384	0.23
385	0.24
386	0.25
387	0.27
388	0.27
389	0.27
390	0.26
391	0.25
392	0.22
393	0.22
394	0.17
395	0.17
396	0.15
397	0.2
398	0.26
399	0.28
400	0.3
401	0.33
402	0.39
403	0.39
404	0.4
405	0.38
406	0.38
407	0.44
408	0.44
409	0.39
410	0.38
411	0.38
412	0.4
413	0.41
414	0.35
415	0.33
416	0.4
417	0.43
418	0.42
419	0.39
420	0.37
421	0.36
422	0.43
423	0.43
424	0.35
425	0.31
426	0.27
427	0.28
428	0.27
429	0.25
430	0.23
431	0.2
432	0.2
433	0.19
434	0.22
435	0.26
436	0.29
437	0.33
438	0.31
439	0.34
440	0.35
441	0.35
442	0.36
443	0.37
444	0.36
445	0.33
446	0.3
447	0.29
448	0.27
449	0.29
450	0.29
451	0.26
452	0.24
453	0.23
454	0.23
455	0.21
456	0.25
457	0.24
458	0.21
459	0.23
460	0.24
461	0.3
462	0.39
463	0.41
464	0.36
465	0.38
466	0.37
467	0.35
468	0.4
469	0.36
470	0.3
471	0.29
472	0.37
473	0.43
474	0.45
475	0.47
476	0.45
477	0.46
478	0.49
479	0.52
480	0.47
481	0.39
482	0.4
483	0.38
484	0.34
485	0.3
486	0.23
487	0.16
488	0.13
489	0.12
490	0.09
491	0.08
492	0.08
493	0.11
494	0.11
495	0.13
496	0.14
497	0.14
498	0.15
499	0.18
500	0.22
501	0.22
502	0.24
503	0.24
504	0.23
505	0.23
506	0.29
507	0.27
508	0.23
509	0.19
510	0.21
511	0.21
512	0.2
513	0.24
514	0.25
515	0.3
516	0.34
517	0.37
518	0.4
519	0.45
520	0.52
521	0.56
522	0.53
523	0.5
524	0.45
525	0.47
526	0.49
527	0.48
528	0.5
529	0.45
530	0.46
531	0.54
532	0.63
533	0.69
534	0.67
535	0.68
536	0.67
537	0.74

C4R219

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer