Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K5XXT4

Protein Details
Accession K5XXT4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
197-218EIGHRKAKQLEQELKKNRRKPYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
75-93RGGAGGKLAKGGKRTTVLR
201-217RKAKQLEQELKKNRRKP
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034215  RBM42_RRM  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG abp:AGABI1DRAFT84574  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12383  RRM_RBM42  
Amino Acid Sequences MDPYSNQSYPYTYGQQANYDSNSYYKGYHGSTSSFPLPGASSSQPAPVPANAYEYDVGIVAQQSVYVPGAAIDKRGGAGGKLAKGGKRTTVLRKGGGKVWEDQTLLEWNPSWFRLFVGDLSNDVSDDVLANAFNKYTSFQKARVIRDRLSGKAKYGFVAFSDPEDFLKAWKEMDGKYVGNRPVKLKKADNMAIRPVEIGHRKAKQLEQELKKNRRKPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.38
3 0.38
4 0.38
5 0.35
6 0.32
7 0.28
8 0.25
9 0.25
10 0.22
11 0.2
12 0.17
13 0.19
14 0.19
15 0.2
16 0.21
17 0.21
18 0.22
19 0.26
20 0.27
21 0.24
22 0.22
23 0.2
24 0.19
25 0.17
26 0.19
27 0.15
28 0.16
29 0.16
30 0.19
31 0.18
32 0.19
33 0.2
34 0.16
35 0.18
36 0.17
37 0.19
38 0.17
39 0.19
40 0.18
41 0.16
42 0.15
43 0.12
44 0.11
45 0.08
46 0.07
47 0.05
48 0.05
49 0.04
50 0.04
51 0.05
52 0.05
53 0.05
54 0.05
55 0.05
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.09
63 0.09
64 0.06
65 0.1
66 0.11
67 0.12
68 0.15
69 0.17
70 0.17
71 0.2
72 0.21
73 0.2
74 0.21
75 0.25
76 0.3
77 0.37
78 0.38
79 0.4
80 0.43
81 0.42
82 0.42
83 0.41
84 0.35
85 0.29
86 0.29
87 0.26
88 0.23
89 0.21
90 0.18
91 0.17
92 0.15
93 0.13
94 0.11
95 0.09
96 0.09
97 0.1
98 0.09
99 0.07
100 0.07
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.11
105 0.1
106 0.1
107 0.11
108 0.11
109 0.09
110 0.09
111 0.07
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.03
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.05
121 0.05
122 0.06
123 0.09
124 0.15
125 0.17
126 0.19
127 0.27
128 0.33
129 0.4
130 0.48
131 0.5
132 0.45
133 0.51
134 0.52
135 0.5
136 0.5
137 0.44
138 0.38
139 0.38
140 0.37
141 0.31
142 0.28
143 0.24
144 0.18
145 0.2
146 0.18
147 0.14
148 0.15
149 0.14
150 0.14
151 0.15
152 0.14
153 0.12
154 0.15
155 0.13
156 0.12
157 0.15
158 0.17
159 0.16
160 0.2
161 0.23
162 0.21
163 0.24
164 0.31
165 0.34
166 0.37
167 0.39
168 0.42
169 0.47
170 0.53
171 0.56
172 0.55
173 0.54
174 0.58
175 0.62
176 0.63
177 0.59
178 0.59
179 0.53
180 0.47
181 0.42
182 0.34
183 0.35
184 0.33
185 0.33
186 0.34
187 0.37
188 0.41
189 0.45
190 0.5
191 0.51
192 0.55
193 0.61
194 0.62
195 0.68
196 0.75
197 0.81
198 0.86