Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K5XFV1

Protein Details
Accession K5XFV1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MDQGQEKTGRPKRIRKPTQQFTSTPHydrophilic
70-92TGEPTKKKARTTKQSAPKEEKRLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-13KR
31-50KKQRATRKAVARTTGKGKGK
Subcellular Location(s) nucl 9.5, cyto_nucl 8, cyto 5.5, mito 4, plas 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007527  Znf_SWIM  
IPR039903  Zswim2  
Gene Ontology GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG abp:AGABI1DRAFT34029  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04434  SWIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50966  ZF_SWIM  
Amino Acid Sequences MDQGQEKTGRPKRIRKPTQQFTSTPTTAQPKKQRATRKAVARTTGKGKGKAADPVAEGASGNQSRTEDTTGEPTKKKARTTKQSAPKEEKRLAQFRSHCPQNVLERAERVRIQRFFMIERKREGKTFKEEFKVLGSTANVYTVTIDHKPKCSCPDNAIRGNHCKHIMFIFLKVLLVPITSHIWYQKALLTSELETVFAQAPEAPNSVTHPRVLDAYLRATGQKAEAARQTGKEITCVWCRSSWGVTTSSKSAGAATQQHGFINLADAVPDLNAHRDTSTYYHGPRHGQHYYGYNQYTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.87
3 0.9
4 0.9
5 0.92
6 0.88
7 0.79
8 0.74
9 0.72
10 0.62
11 0.52
12 0.47
13 0.46
14 0.45
15 0.53
16 0.57
17 0.57
18 0.64
19 0.71
20 0.76
21 0.75
22 0.79
23 0.79
24 0.79
25 0.79
26 0.77
27 0.77
28 0.71
29 0.68
30 0.66
31 0.66
32 0.62
33 0.56
34 0.53
35 0.5
36 0.48
37 0.48
38 0.44
39 0.38
40 0.33
41 0.3
42 0.28
43 0.24
44 0.21
45 0.15
46 0.19
47 0.16
48 0.15
49 0.15
50 0.15
51 0.16
52 0.18
53 0.2
54 0.14
55 0.15
56 0.23
57 0.27
58 0.32
59 0.32
60 0.35
61 0.41
62 0.45
63 0.51
64 0.52
65 0.58
66 0.63
67 0.71
68 0.76
69 0.78
70 0.83
71 0.84
72 0.84
73 0.82
74 0.79
75 0.75
76 0.7
77 0.67
78 0.65
79 0.59
80 0.59
81 0.56
82 0.55
83 0.59
84 0.57
85 0.51
86 0.47
87 0.49
88 0.47
89 0.47
90 0.43
91 0.36
92 0.35
93 0.35
94 0.36
95 0.34
96 0.31
97 0.32
98 0.31
99 0.32
100 0.31
101 0.31
102 0.31
103 0.36
104 0.4
105 0.35
106 0.39
107 0.4
108 0.39
109 0.41
110 0.41
111 0.38
112 0.39
113 0.42
114 0.42
115 0.42
116 0.41
117 0.38
118 0.36
119 0.32
120 0.23
121 0.19
122 0.14
123 0.12
124 0.11
125 0.11
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.06
130 0.09
131 0.11
132 0.15
133 0.15
134 0.2
135 0.21
136 0.23
137 0.29
138 0.3
139 0.29
140 0.3
141 0.38
142 0.4
143 0.45
144 0.46
145 0.44
146 0.47
147 0.47
148 0.45
149 0.37
150 0.31
151 0.25
152 0.23
153 0.24
154 0.18
155 0.17
156 0.15
157 0.14
158 0.13
159 0.12
160 0.12
161 0.07
162 0.06
163 0.05
164 0.06
165 0.08
166 0.08
167 0.09
168 0.09
169 0.1
170 0.11
171 0.12
172 0.13
173 0.13
174 0.13
175 0.13
176 0.14
177 0.13
178 0.16
179 0.15
180 0.13
181 0.11
182 0.12
183 0.12
184 0.1
185 0.09
186 0.08
187 0.09
188 0.1
189 0.11
190 0.1
191 0.09
192 0.13
193 0.16
194 0.16
195 0.16
196 0.15
197 0.15
198 0.16
199 0.17
200 0.16
201 0.14
202 0.16
203 0.16
204 0.16
205 0.16
206 0.15
207 0.15
208 0.13
209 0.14
210 0.12
211 0.15
212 0.18
213 0.22
214 0.23
215 0.24
216 0.26
217 0.27
218 0.27
219 0.25
220 0.24
221 0.25
222 0.3
223 0.31
224 0.29
225 0.27
226 0.29
227 0.3
228 0.3
229 0.28
230 0.24
231 0.26
232 0.26
233 0.28
234 0.29
235 0.27
236 0.25
237 0.22
238 0.2
239 0.18
240 0.2
241 0.22
242 0.22
243 0.24
244 0.25
245 0.24
246 0.25
247 0.24
248 0.19
249 0.17
250 0.15
251 0.11
252 0.1
253 0.1
254 0.09
255 0.08
256 0.09
257 0.07
258 0.1
259 0.12
260 0.13
261 0.13
262 0.14
263 0.17
264 0.19
265 0.25
266 0.27
267 0.3
268 0.35
269 0.39
270 0.44
271 0.45
272 0.5
273 0.47
274 0.43
275 0.43
276 0.43
277 0.44
278 0.46