Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K5WI61

Protein Details
Accession K5WI61    Localization Confidence High Confidence Score 24.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-69TSTPSPSPPSPQKPKPKVPRPPRAKEEEDGHydrophilic
181-204KEKEKPSAAKKKFQKKTRQVFLVPHydrophilic
256-275VPAHRWYKFQKRPHYHVPNLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-64QKPKPKVPRPPRAK
179-197KGKEKEKPSAAKKKFQKKT
590-614GKPGHKRKAEEGAGGVPSKLKKRKA
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008851  TFIIF-alpha  
IPR011039  TFIIF_interaction  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG pco:PHACADRAFT_249234  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05793  TFIIF_alpha  
Amino Acid Sequences MAPATSVLFHPKKKQLYTQLRAQGGGERPTQSSSQNTSGTSTPSPSPPSPQKPKPKVPRPPRAKEEEDGPPKLEGPFAEFRLMSSALNGWKYDVMKFDSRKPVDILAWAQPVKLNRKEVRRNTGADDTSGPAAPVAVGPMLGPDNKPVIGMDGRVVMVDAEGKPIRPGEQQTNGAGDTKGKEKEKPSAAKKKFQKKTRQVFLVPEHIRQLRREERYPWIIEDSSEQELWVASMEEVSKAETQAMFMPAANDIFKFVPAHRWYKFQKRPHYHVPNLEEAEDLMKQLAKNKDPERWLLRRRNGQGPSDATAAIFKAERDGSMPPSSSSLVYSTSQSVGPGGRKLRSVDSGVDRLFGDDDEEDGEGKRRKREYGQEGDLDELDFEDDVQDDDDKMEPDADDEEAKELEERLKREYKTANKTREGYIDESDEEEEINELSTAGKDMRKLMKKLEKNGAYDESDDEKNPYASSEEEEPEEEPLQAPQGPAIIPPEPQAQSRQSSQAPGTPVPSGAKSPTQPPATIKTESGSRATSPIPGHGGHAVVAQRATSPKAPKLKTNGTSRATSPLAGGSQPTSPIGSPITGRADSPPTQGKPGHKRKAEEGAGGVPSKLKKRKATAGPTADGELEDWMLVEWLKKAPNATTRDCIHHFTPWLTTEDKKQNFTKLVKEVAQLKGGVLVLRPAYRGSNAPNSPAPASPAPTSPTPNGTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.68
3 0.73
4 0.75
5 0.76
6 0.75
7 0.69
8 0.65
9 0.56
10 0.52
11 0.47
12 0.46
13 0.4
14 0.34
15 0.33
16 0.35
17 0.36
18 0.32
19 0.33
20 0.34
21 0.36
22 0.36
23 0.36
24 0.36
25 0.36
26 0.37
27 0.32
28 0.29
29 0.26
30 0.28
31 0.34
32 0.32
33 0.4
34 0.45
35 0.54
36 0.61
37 0.68
38 0.74
39 0.78
40 0.87
41 0.9
42 0.9
43 0.91
44 0.91
45 0.93
46 0.92
47 0.92
48 0.9
49 0.87
50 0.82
51 0.74
52 0.7
53 0.7
54 0.67
55 0.6
56 0.53
57 0.45
58 0.41
59 0.38
60 0.33
61 0.23
62 0.22
63 0.24
64 0.24
65 0.26
66 0.25
67 0.25
68 0.27
69 0.28
70 0.21
71 0.17
72 0.18
73 0.19
74 0.21
75 0.21
76 0.18
77 0.2
78 0.22
79 0.22
80 0.23
81 0.24
82 0.31
83 0.33
84 0.41
85 0.47
86 0.48
87 0.49
88 0.48
89 0.46
90 0.39
91 0.4
92 0.35
93 0.3
94 0.34
95 0.31
96 0.29
97 0.28
98 0.33
99 0.37
100 0.39
101 0.43
102 0.43
103 0.54
104 0.64
105 0.7
106 0.74
107 0.72
108 0.69
109 0.66
110 0.68
111 0.58
112 0.5
113 0.43
114 0.36
115 0.31
116 0.28
117 0.22
118 0.13
119 0.12
120 0.1
121 0.08
122 0.07
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.08
128 0.08
129 0.09
130 0.1
131 0.12
132 0.12
133 0.13
134 0.11
135 0.14
136 0.14
137 0.14
138 0.13
139 0.13
140 0.13
141 0.12
142 0.12
143 0.08
144 0.07
145 0.09
146 0.08
147 0.12
148 0.12
149 0.13
150 0.14
151 0.15
152 0.17
153 0.18
154 0.23
155 0.25
156 0.32
157 0.34
158 0.34
159 0.36
160 0.34
161 0.31
162 0.27
163 0.22
164 0.17
165 0.19
166 0.24
167 0.24
168 0.29
169 0.3
170 0.39
171 0.45
172 0.53
173 0.58
174 0.63
175 0.66
176 0.71
177 0.77
178 0.79
179 0.79
180 0.79
181 0.81
182 0.8
183 0.86
184 0.86
185 0.84
186 0.76
187 0.74
188 0.69
189 0.68
190 0.6
191 0.51
192 0.46
193 0.43
194 0.42
195 0.37
196 0.41
197 0.39
198 0.43
199 0.45
200 0.44
201 0.47
202 0.52
203 0.52
204 0.45
205 0.4
206 0.34
207 0.3
208 0.29
209 0.25
210 0.21
211 0.19
212 0.17
213 0.13
214 0.13
215 0.12
216 0.1
217 0.07
218 0.04
219 0.05
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.08
228 0.09
229 0.11
230 0.12
231 0.1
232 0.1
233 0.1
234 0.09
235 0.1
236 0.1
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.17
244 0.21
245 0.27
246 0.27
247 0.33
248 0.38
249 0.48
250 0.57
251 0.57
252 0.64
253 0.66
254 0.72
255 0.76
256 0.8
257 0.75
258 0.73
259 0.68
260 0.64
261 0.56
262 0.49
263 0.38
264 0.28
265 0.25
266 0.17
267 0.13
268 0.07
269 0.08
270 0.08
271 0.14
272 0.19
273 0.2
274 0.27
275 0.3
276 0.35
277 0.36
278 0.42
279 0.43
280 0.47
281 0.53
282 0.55
283 0.6
284 0.62
285 0.65
286 0.67
287 0.64
288 0.58
289 0.53
290 0.47
291 0.42
292 0.35
293 0.3
294 0.21
295 0.18
296 0.15
297 0.11
298 0.09
299 0.06
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.1
305 0.13
306 0.14
307 0.15
308 0.13
309 0.14
310 0.15
311 0.13
312 0.13
313 0.1
314 0.11
315 0.11
316 0.12
317 0.11
318 0.11
319 0.11
320 0.1
321 0.1
322 0.1
323 0.1
324 0.13
325 0.15
326 0.15
327 0.16
328 0.18
329 0.19
330 0.2
331 0.2
332 0.2
333 0.21
334 0.23
335 0.22
336 0.21
337 0.19
338 0.17
339 0.15
340 0.12
341 0.09
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.1
349 0.13
350 0.16
351 0.21
352 0.22
353 0.24
354 0.3
355 0.39
356 0.43
357 0.47
358 0.49
359 0.46
360 0.45
361 0.43
362 0.38
363 0.28
364 0.19
365 0.11
366 0.07
367 0.04
368 0.04
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.05
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.07
380 0.06
381 0.06
382 0.07
383 0.07
384 0.06
385 0.06
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.06
391 0.11
392 0.14
393 0.15
394 0.19
395 0.25
396 0.25
397 0.3
398 0.37
399 0.41
400 0.48
401 0.56
402 0.58
403 0.57
404 0.59
405 0.57
406 0.53
407 0.47
408 0.4
409 0.33
410 0.27
411 0.22
412 0.21
413 0.19
414 0.15
415 0.12
416 0.09
417 0.07
418 0.05
419 0.05
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.05
425 0.06
426 0.08
427 0.08
428 0.13
429 0.22
430 0.28
431 0.29
432 0.37
433 0.45
434 0.5
435 0.56
436 0.6
437 0.57
438 0.53
439 0.55
440 0.5
441 0.42
442 0.37
443 0.33
444 0.27
445 0.23
446 0.21
447 0.19
448 0.17
449 0.16
450 0.15
451 0.13
452 0.1
453 0.1
454 0.12
455 0.14
456 0.14
457 0.14
458 0.15
459 0.15
460 0.16
461 0.16
462 0.13
463 0.1
464 0.09
465 0.1
466 0.1
467 0.1
468 0.08
469 0.08
470 0.08
471 0.08
472 0.11
473 0.1
474 0.1
475 0.12
476 0.17
477 0.17
478 0.18
479 0.21
480 0.22
481 0.25
482 0.27
483 0.3
484 0.26
485 0.28
486 0.28
487 0.28
488 0.28
489 0.26
490 0.25
491 0.21
492 0.21
493 0.2
494 0.2
495 0.17
496 0.16
497 0.19
498 0.18
499 0.22
500 0.28
501 0.29
502 0.29
503 0.31
504 0.36
505 0.36
506 0.36
507 0.33
508 0.27
509 0.29
510 0.29
511 0.29
512 0.23
513 0.19
514 0.2
515 0.2
516 0.23
517 0.19
518 0.2
519 0.2
520 0.19
521 0.2
522 0.19
523 0.18
524 0.14
525 0.16
526 0.14
527 0.13
528 0.12
529 0.11
530 0.11
531 0.13
532 0.15
533 0.18
534 0.22
535 0.28
536 0.37
537 0.39
538 0.44
539 0.51
540 0.57
541 0.59
542 0.64
543 0.66
544 0.6
545 0.61
546 0.56
547 0.54
548 0.45
549 0.38
550 0.29
551 0.23
552 0.2
553 0.18
554 0.17
555 0.13
556 0.13
557 0.13
558 0.13
559 0.12
560 0.11
561 0.13
562 0.13
563 0.12
564 0.12
565 0.15
566 0.19
567 0.18
568 0.19
569 0.2
570 0.25
571 0.25
572 0.29
573 0.33
574 0.3
575 0.35
576 0.39
577 0.45
578 0.51
579 0.61
580 0.65
581 0.63
582 0.65
583 0.67
584 0.73
585 0.67
586 0.58
587 0.5
588 0.45
589 0.42
590 0.38
591 0.32
592 0.25
593 0.26
594 0.32
595 0.37
596 0.4
597 0.45
598 0.53
599 0.62
600 0.69
601 0.74
602 0.76
603 0.75
604 0.71
605 0.64
606 0.58
607 0.49
608 0.39
609 0.3
610 0.2
611 0.13
612 0.1
613 0.08
614 0.06
615 0.06
616 0.07
617 0.07
618 0.08
619 0.11
620 0.14
621 0.15
622 0.17
623 0.22
624 0.3
625 0.36
626 0.39
627 0.43
628 0.44
629 0.5
630 0.51
631 0.51
632 0.45
633 0.44
634 0.42
635 0.36
636 0.37
637 0.33
638 0.33
639 0.31
640 0.31
641 0.35
642 0.42
643 0.45
644 0.47
645 0.48
646 0.53
647 0.58
648 0.6
649 0.59
650 0.54
651 0.56
652 0.53
653 0.55
654 0.54
655 0.49
656 0.49
657 0.4
658 0.35
659 0.31
660 0.29
661 0.24
662 0.18
663 0.18
664 0.18
665 0.19
666 0.2
667 0.18
668 0.19
669 0.21
670 0.24
671 0.27
672 0.34
673 0.34
674 0.39
675 0.4
676 0.42
677 0.42
678 0.39
679 0.39
680 0.32
681 0.34
682 0.31
683 0.31
684 0.31
685 0.33
686 0.37
687 0.35