Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0V3W5

Protein Details
Accession Q0V3W5    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
119-148AGEGEEPKKKKKRADKPRRKKNKDGEEGEGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
113-169HKRKRTAGEGEEPKKKKKRADKPRRKKNKDGEEGEGADDGTRKSKRSKKEGGGSRAR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016973  P:poly(A)+ mRNA export from nucleus  
KEGG pno:SNOG_01299  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MEDVEFKEDHSNSVLPEAGNDPSDPLRPEIDEENSTPNPTIAEPYQDMEVTEDKEEMPDNDDIQAGLSDNESVLSDALDDDQLDEQFGEFDASNIAIEERAIDEDTVKQIGVHKRKRTAGEGEEPKKKKKRADKPRRKKNKDGEEGEGADDGTRKSKRSKKEGGGSRARAASPDDNEDHLTPEERRKRALDRQINALVKSSANRSRKKKDIDLEQMADQEIEEMRRRMAQAAEADNEGRKRNEPARHKLKLLPEVVALLNTNRLRETIVDPEVNLLESVRFFLEPLSDGSLPAYDIQKELFASLARLPVNKDTLVASGIGKVIMFYIKSKKPELTIKRQAERLFTDWTRPILRRTDDYRKKEFAQADYDPTKVAAPRTQAASQAAQIAANRKKALEAPKAFQRARMEAGPTTYTIAPKSNVVFNESGRSRSSNVDILKQIKGRGGGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.17
3 0.19
4 0.2
5 0.18
6 0.17
7 0.17
8 0.17
9 0.17
10 0.21
11 0.21
12 0.21
13 0.21
14 0.21
15 0.25
16 0.26
17 0.29
18 0.29
19 0.29
20 0.34
21 0.33
22 0.33
23 0.3
24 0.26
25 0.22
26 0.2
27 0.23
28 0.17
29 0.21
30 0.21
31 0.22
32 0.24
33 0.22
34 0.22
35 0.2
36 0.22
37 0.18
38 0.17
39 0.17
40 0.15
41 0.16
42 0.17
43 0.15
44 0.16
45 0.15
46 0.15
47 0.16
48 0.16
49 0.14
50 0.14
51 0.13
52 0.1
53 0.08
54 0.08
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.07
65 0.07
66 0.06
67 0.07
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.05
84 0.05
85 0.06
86 0.06
87 0.07
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.1
92 0.12
93 0.12
94 0.11
95 0.1
96 0.16
97 0.26
98 0.35
99 0.42
100 0.47
101 0.54
102 0.6
103 0.63
104 0.62
105 0.6
106 0.56
107 0.58
108 0.61
109 0.61
110 0.65
111 0.65
112 0.68
113 0.7
114 0.69
115 0.68
116 0.68
117 0.73
118 0.74
119 0.83
120 0.85
121 0.88
122 0.93
123 0.96
124 0.94
125 0.93
126 0.92
127 0.92
128 0.9
129 0.84
130 0.78
131 0.71
132 0.64
133 0.54
134 0.44
135 0.32
136 0.22
137 0.18
138 0.13
139 0.14
140 0.14
141 0.16
142 0.24
143 0.31
144 0.39
145 0.48
146 0.57
147 0.59
148 0.68
149 0.75
150 0.75
151 0.78
152 0.72
153 0.66
154 0.59
155 0.5
156 0.41
157 0.36
158 0.31
159 0.23
160 0.24
161 0.22
162 0.21
163 0.23
164 0.23
165 0.21
166 0.17
167 0.17
168 0.15
169 0.23
170 0.29
171 0.28
172 0.31
173 0.32
174 0.38
175 0.45
176 0.54
177 0.53
178 0.48
179 0.53
180 0.58
181 0.57
182 0.5
183 0.43
184 0.33
185 0.25
186 0.24
187 0.22
188 0.23
189 0.29
190 0.36
191 0.43
192 0.49
193 0.56
194 0.61
195 0.63
196 0.61
197 0.63
198 0.64
199 0.62
200 0.57
201 0.5
202 0.44
203 0.37
204 0.3
205 0.21
206 0.13
207 0.08
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.1
213 0.1
214 0.11
215 0.11
216 0.12
217 0.14
218 0.16
219 0.17
220 0.16
221 0.16
222 0.16
223 0.17
224 0.16
225 0.14
226 0.13
227 0.16
228 0.23
229 0.31
230 0.38
231 0.46
232 0.54
233 0.56
234 0.58
235 0.58
236 0.57
237 0.55
238 0.49
239 0.39
240 0.3
241 0.28
242 0.26
243 0.21
244 0.16
245 0.09
246 0.14
247 0.13
248 0.13
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.14
253 0.17
254 0.16
255 0.18
256 0.18
257 0.18
258 0.18
259 0.18
260 0.16
261 0.13
262 0.08
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.09
273 0.12
274 0.11
275 0.11
276 0.12
277 0.12
278 0.11
279 0.12
280 0.12
281 0.08
282 0.08
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.08
288 0.07
289 0.09
290 0.1
291 0.13
292 0.13
293 0.14
294 0.16
295 0.17
296 0.2
297 0.18
298 0.18
299 0.15
300 0.15
301 0.15
302 0.14
303 0.11
304 0.1
305 0.1
306 0.09
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.09
313 0.17
314 0.21
315 0.25
316 0.28
317 0.29
318 0.33
319 0.43
320 0.49
321 0.52
322 0.58
323 0.63
324 0.65
325 0.68
326 0.65
327 0.6
328 0.56
329 0.48
330 0.45
331 0.38
332 0.38
333 0.36
334 0.38
335 0.38
336 0.35
337 0.36
338 0.36
339 0.39
340 0.4
341 0.46
342 0.53
343 0.58
344 0.64
345 0.67
346 0.65
347 0.64
348 0.65
349 0.62
350 0.54
351 0.52
352 0.47
353 0.47
354 0.44
355 0.41
356 0.34
357 0.3
358 0.28
359 0.23
360 0.23
361 0.2
362 0.22
363 0.25
364 0.3
365 0.3
366 0.32
367 0.33
368 0.31
369 0.28
370 0.27
371 0.24
372 0.2
373 0.21
374 0.26
375 0.28
376 0.32
377 0.31
378 0.28
379 0.3
380 0.35
381 0.42
382 0.44
383 0.44
384 0.45
385 0.53
386 0.62
387 0.6
388 0.6
389 0.57
390 0.51
391 0.5
392 0.48
393 0.42
394 0.36
395 0.39
396 0.35
397 0.3
398 0.29
399 0.26
400 0.24
401 0.22
402 0.24
403 0.21
404 0.23
405 0.25
406 0.27
407 0.26
408 0.3
409 0.3
410 0.28
411 0.36
412 0.35
413 0.34
414 0.32
415 0.34
416 0.31
417 0.33
418 0.36
419 0.34
420 0.35
421 0.39
422 0.42
423 0.43
424 0.48
425 0.46
426 0.44
427 0.41
428 0.44