Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0V3D3

Protein Details
Accession Q0V3D3    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-59MSDNERPRDRHRERDSRREPREDRNREGGGPPGERRNRSRSPRRERGGRRDNPRYRSRSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-127PRDRHRERDSRREPREDRNREGGGPPGERRNRSRSPRRERGGRRDNPRYRSRSPFRGNDREKDGTREPRGRGRGDRDQDRGPRDAPRGSRGGASAPSGPRRSDFPTREARGGPVKAAPAAK
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 2, cyto 1.5, cyto_pero 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG pno:SNOG_01481  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSDNERPRDRHRERDSRREPREDRNREGGGPPGERRNRSRSPRRERGGRRDNPRYRSRSPFRGNDREKDGTREPRGRGRGDRDQDRGPRDAPRGSRGGASAPSGPRRSDFPTREARGGPVKAAPAAKKEESPDVEMKEDAEKPEDMDDDTWEMKKMMGFAGFKSTKNQKVPGNDKNYGIRREKRMEARQYMNRQGGFNRPLSPSRM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.87
3 0.87
4 0.88
5 0.87
6 0.82
7 0.82
8 0.84
9 0.81
10 0.77
11 0.75
12 0.7
13 0.61
14 0.58
15 0.54
16 0.49
17 0.45
18 0.42
19 0.43
20 0.47
21 0.49
22 0.53
23 0.54
24 0.58
25 0.64
26 0.72
27 0.73
28 0.77
29 0.82
30 0.85
31 0.87
32 0.87
33 0.88
34 0.88
35 0.85
36 0.84
37 0.85
38 0.85
39 0.82
40 0.82
41 0.79
42 0.74
43 0.75
44 0.73
45 0.72
46 0.71
47 0.73
48 0.72
49 0.76
50 0.74
51 0.7
52 0.7
53 0.65
54 0.59
55 0.56
56 0.54
57 0.52
58 0.54
59 0.55
60 0.5
61 0.52
62 0.55
63 0.53
64 0.52
65 0.51
66 0.53
67 0.54
68 0.57
69 0.53
70 0.55
71 0.56
72 0.53
73 0.48
74 0.4
75 0.38
76 0.35
77 0.35
78 0.31
79 0.29
80 0.28
81 0.26
82 0.25
83 0.21
84 0.19
85 0.16
86 0.15
87 0.15
88 0.15
89 0.18
90 0.19
91 0.19
92 0.18
93 0.2
94 0.24
95 0.3
96 0.3
97 0.31
98 0.39
99 0.41
100 0.42
101 0.39
102 0.37
103 0.34
104 0.32
105 0.28
106 0.2
107 0.18
108 0.18
109 0.2
110 0.18
111 0.16
112 0.2
113 0.2
114 0.21
115 0.22
116 0.25
117 0.25
118 0.28
119 0.28
120 0.26
121 0.26
122 0.24
123 0.23
124 0.21
125 0.2
126 0.17
127 0.16
128 0.14
129 0.14
130 0.15
131 0.15
132 0.13
133 0.12
134 0.12
135 0.13
136 0.14
137 0.14
138 0.13
139 0.13
140 0.12
141 0.12
142 0.12
143 0.11
144 0.14
145 0.14
146 0.14
147 0.24
148 0.25
149 0.25
150 0.31
151 0.37
152 0.4
153 0.44
154 0.49
155 0.45
156 0.54
157 0.62
158 0.65
159 0.66
160 0.61
161 0.6
162 0.63
163 0.64
164 0.62
165 0.62
166 0.6
167 0.6
168 0.63
169 0.68
170 0.69
171 0.72
172 0.74
173 0.73
174 0.75
175 0.76
176 0.78
177 0.78
178 0.75
179 0.67
180 0.6
181 0.55
182 0.55
183 0.5
184 0.45
185 0.41
186 0.39