Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QVR2

Protein Details
Accession C4QVR2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
400-424EPEVLNEKWRKKRKLIAEQESKEELHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
410-411KK
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 6, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001406  PsdUridine_synth_TruA  
IPR020097  PsdUridine_synth_TruA_a/b_dom  
IPR020095  PsdUridine_synth_TruA_C  
IPR041707  Pus3-like  
IPR020094  TruA/RsuA/RluB/E/F_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:1990481  P:mRNA pseudouridine synthesis  
GO:0031119  P:tRNA pseudouridine synthesis  
KEGG ppa:PAS_chr1-3_0271  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01416  PseudoU_synth_1  
CDD cd02569  PseudoU_synth_ScPus3  
Amino Acid Sequences MRPFPSLLKNHHLRLLMSDTDYRKWSKPQLISRILQLEGKSGELALMESKPRKNEVDFSTATIRQIALKFSYLGWNYQGLAVQREATDLPTIEFKILEALRQCRMIPSLNPIDCAFSRCGRTDKGVSAMNQVIGLNVRSRLTPEELESPENDIKELDYINILNQLLPSDIRIHGVCLRPPKGFDARFSCRGRHYKYVFQDEGLDLESMKKAAPMFEGVHDFRNFCKVDGAKQMTNYTRAVRSSQILPLEGHPGYYVFDLKGTAFLWHQVRCMVAILLMIGQGFESPDIVSKLLDIQSHPQKPVYVMAHDIPLVLYDCIYDDDVNFQPATNANKILKSHQEFRGVYYDYHLKYIISNFMRNIVMPGPIQITAGKQLHNTGDGKGKFANKHVKLLNRPTVEEPEVLNEKWRKKRKLIAEQESKEELQETNGISNGDVPSI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.46
3 0.38
4 0.35
5 0.38
6 0.36
7 0.37
8 0.4
9 0.39
10 0.37
11 0.42
12 0.47
13 0.5
14 0.56
15 0.62
16 0.68
17 0.72
18 0.7
19 0.69
20 0.64
21 0.56
22 0.5
23 0.41
24 0.35
25 0.28
26 0.27
27 0.21
28 0.16
29 0.15
30 0.12
31 0.12
32 0.1
33 0.11
34 0.16
35 0.22
36 0.26
37 0.29
38 0.32
39 0.36
40 0.37
41 0.43
42 0.42
43 0.45
44 0.42
45 0.43
46 0.45
47 0.43
48 0.4
49 0.32
50 0.27
51 0.24
52 0.24
53 0.23
54 0.19
55 0.19
56 0.19
57 0.19
58 0.26
59 0.23
60 0.23
61 0.22
62 0.22
63 0.21
64 0.21
65 0.23
66 0.16
67 0.18
68 0.17
69 0.16
70 0.15
71 0.16
72 0.15
73 0.14
74 0.14
75 0.12
76 0.12
77 0.14
78 0.14
79 0.13
80 0.13
81 0.11
82 0.16
83 0.15
84 0.18
85 0.19
86 0.22
87 0.24
88 0.26
89 0.26
90 0.22
91 0.24
92 0.24
93 0.21
94 0.26
95 0.32
96 0.31
97 0.33
98 0.31
99 0.33
100 0.3
101 0.32
102 0.27
103 0.21
104 0.24
105 0.24
106 0.28
107 0.26
108 0.3
109 0.3
110 0.3
111 0.3
112 0.31
113 0.29
114 0.31
115 0.3
116 0.25
117 0.22
118 0.2
119 0.16
120 0.13
121 0.13
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.11
127 0.14
128 0.16
129 0.16
130 0.18
131 0.23
132 0.24
133 0.25
134 0.24
135 0.27
136 0.25
137 0.24
138 0.21
139 0.15
140 0.13
141 0.13
142 0.13
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.08
147 0.1
148 0.1
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.08
156 0.09
157 0.1
158 0.1
159 0.12
160 0.16
161 0.18
162 0.2
163 0.24
164 0.27
165 0.26
166 0.27
167 0.29
168 0.33
169 0.32
170 0.34
171 0.35
172 0.39
173 0.46
174 0.47
175 0.45
176 0.44
177 0.5
178 0.51
179 0.51
180 0.5
181 0.49
182 0.53
183 0.58
184 0.52
185 0.45
186 0.42
187 0.33
188 0.29
189 0.22
190 0.17
191 0.08
192 0.09
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.09
201 0.1
202 0.11
203 0.15
204 0.14
205 0.18
206 0.18
207 0.18
208 0.15
209 0.21
210 0.19
211 0.16
212 0.2
213 0.17
214 0.2
215 0.28
216 0.32
217 0.27
218 0.28
219 0.32
220 0.29
221 0.31
222 0.28
223 0.22
224 0.2
225 0.2
226 0.2
227 0.18
228 0.19
229 0.18
230 0.2
231 0.18
232 0.18
233 0.17
234 0.17
235 0.19
236 0.17
237 0.15
238 0.12
239 0.11
240 0.11
241 0.1
242 0.1
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.12
252 0.15
253 0.15
254 0.15
255 0.15
256 0.14
257 0.14
258 0.15
259 0.1
260 0.07
261 0.06
262 0.06
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.04
267 0.04
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.04
272 0.04
273 0.05
274 0.06
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.09
279 0.11
280 0.12
281 0.11
282 0.18
283 0.26
284 0.3
285 0.31
286 0.29
287 0.28
288 0.28
289 0.34
290 0.29
291 0.21
292 0.21
293 0.21
294 0.21
295 0.2
296 0.19
297 0.13
298 0.11
299 0.11
300 0.08
301 0.07
302 0.06
303 0.06
304 0.08
305 0.09
306 0.08
307 0.07
308 0.11
309 0.12
310 0.14
311 0.13
312 0.12
313 0.12
314 0.15
315 0.2
316 0.18
317 0.21
318 0.21
319 0.25
320 0.27
321 0.3
322 0.36
323 0.37
324 0.42
325 0.43
326 0.51
327 0.48
328 0.5
329 0.52
330 0.45
331 0.39
332 0.37
333 0.38
334 0.3
335 0.31
336 0.28
337 0.21
338 0.21
339 0.24
340 0.28
341 0.24
342 0.26
343 0.24
344 0.28
345 0.28
346 0.26
347 0.26
348 0.19
349 0.18
350 0.15
351 0.17
352 0.15
353 0.14
354 0.15
355 0.13
356 0.14
357 0.19
358 0.21
359 0.21
360 0.2
361 0.23
362 0.24
363 0.28
364 0.27
365 0.22
366 0.29
367 0.28
368 0.3
369 0.31
370 0.36
371 0.34
372 0.41
373 0.49
374 0.43
375 0.51
376 0.54
377 0.59
378 0.62
379 0.69
380 0.7
381 0.62
382 0.63
383 0.59
384 0.6
385 0.53
386 0.46
387 0.37
388 0.35
389 0.36
390 0.33
391 0.36
392 0.37
393 0.44
394 0.52
395 0.62
396 0.63
397 0.67
398 0.77
399 0.79
400 0.84
401 0.85
402 0.86
403 0.87
404 0.82
405 0.8
406 0.76
407 0.65
408 0.54
409 0.45
410 0.34
411 0.26
412 0.26
413 0.21
414 0.19
415 0.2
416 0.2
417 0.18
418 0.21