Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0UKA4

Protein Details
Accession Q0UKA4    Localization Confidence High Confidence Score 21.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-65YGRGEKIKSKSVKDRKLRSNLRTLEHydrophilic
476-502DRKPEDKIAKLKQRGRGRNSALRRFLRBasic
512-543EEKERAREVVEQRKKRNEEKRERLKKEYGPALBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
50-50K
53-53K
55-55R
469-541RKREKDLDRKPEDKIAKLKQRGRGRNSALRRFLRKSGSKNVIDEEKERAREVVEQRKKRNEEKRERLKKEYGP
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012952  BING4_C_dom  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR040315  WDR46/Utp7  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG pno:SNOG_07810  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08149  BING4CT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MATERGSKAVATQPRRKSAAPVDDEDARALAQYTEKATQQYGRGEKIKSKSVKDRKLRSNLRTLEAKNKQAAIEAKNVEILLENNAGLIEPENELERTYQVRQDDIKQAVGVETAKKGFELRLDGLGPYDVCEYSRNGRDLLIASRKGHVATFDWRDGKPGCELQLNETVRDARWLHVSNQKNFAVAQKKCVYIYSGDGVELHQLKNHSEATHLEYLPYHFLLASVSTAGILRYTDVSTGQSLAQLYTKLGPPTAFAQNPHNAILHVGHQKGLVTLWSPNSAAPLVKLLPHHGPVRSMAVDKSGTYMVSTSQDRRMSVWDIRMFREIHTHHLRLPGQTISISDRNLTSVGYGTQLSIFKSDIFTRAADASSTQPYMNWGGDGLSISRVRYCPFEDVLGVAHERGFSSIIVPGAGEPNPDSMEQGLNPYETSKQRRETEVHALLEKLQPEMIALDPNFVGNLDLASEEQRKREKDLDRKPEDKIAKLKQRGRGRNSALRRFLRKSGSKNVIDEEKERAREVVEQRKKRNEEKRERLKKEYGPALERFARKGNQT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.66
3 0.64
4 0.64
5 0.64
6 0.65
7 0.62
8 0.58
9 0.54
10 0.53
11 0.53
12 0.45
13 0.36
14 0.25
15 0.2
16 0.16
17 0.13
18 0.11
19 0.13
20 0.16
21 0.19
22 0.2
23 0.22
24 0.24
25 0.27
26 0.3
27 0.37
28 0.38
29 0.42
30 0.45
31 0.47
32 0.52
33 0.53
34 0.58
35 0.56
36 0.59
37 0.63
38 0.68
39 0.75
40 0.78
41 0.82
42 0.83
43 0.87
44 0.89
45 0.85
46 0.84
47 0.79
48 0.75
49 0.73
50 0.66
51 0.66
52 0.64
53 0.63
54 0.57
55 0.54
56 0.48
57 0.46
58 0.48
59 0.4
60 0.41
61 0.37
62 0.33
63 0.32
64 0.31
65 0.26
66 0.21
67 0.18
68 0.13
69 0.13
70 0.12
71 0.1
72 0.11
73 0.1
74 0.09
75 0.1
76 0.07
77 0.07
78 0.08
79 0.09
80 0.1
81 0.11
82 0.11
83 0.12
84 0.15
85 0.17
86 0.2
87 0.2
88 0.24
89 0.26
90 0.31
91 0.36
92 0.35
93 0.34
94 0.3
95 0.29
96 0.25
97 0.24
98 0.2
99 0.14
100 0.15
101 0.14
102 0.14
103 0.14
104 0.15
105 0.14
106 0.16
107 0.19
108 0.18
109 0.2
110 0.21
111 0.2
112 0.2
113 0.2
114 0.17
115 0.13
116 0.13
117 0.1
118 0.1
119 0.11
120 0.13
121 0.18
122 0.24
123 0.24
124 0.23
125 0.23
126 0.24
127 0.25
128 0.29
129 0.3
130 0.28
131 0.28
132 0.29
133 0.3
134 0.28
135 0.27
136 0.22
137 0.17
138 0.21
139 0.25
140 0.28
141 0.3
142 0.3
143 0.33
144 0.32
145 0.31
146 0.28
147 0.25
148 0.22
149 0.24
150 0.24
151 0.24
152 0.32
153 0.31
154 0.28
155 0.27
156 0.26
157 0.21
158 0.26
159 0.23
160 0.15
161 0.2
162 0.22
163 0.25
164 0.32
165 0.39
166 0.38
167 0.44
168 0.43
169 0.37
170 0.36
171 0.38
172 0.39
173 0.33
174 0.36
175 0.33
176 0.34
177 0.34
178 0.34
179 0.29
180 0.21
181 0.23
182 0.19
183 0.15
184 0.14
185 0.14
186 0.13
187 0.15
188 0.15
189 0.13
190 0.12
191 0.12
192 0.13
193 0.16
194 0.18
195 0.14
196 0.14
197 0.16
198 0.19
199 0.24
200 0.23
201 0.2
202 0.19
203 0.2
204 0.2
205 0.18
206 0.13
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.06
222 0.06
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.11
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.14
241 0.18
242 0.17
243 0.16
244 0.21
245 0.23
246 0.24
247 0.24
248 0.21
249 0.16
250 0.16
251 0.15
252 0.16
253 0.16
254 0.15
255 0.14
256 0.14
257 0.14
258 0.14
259 0.13
260 0.09
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.09
265 0.09
266 0.08
267 0.09
268 0.1
269 0.09
270 0.07
271 0.08
272 0.07
273 0.09
274 0.09
275 0.11
276 0.12
277 0.15
278 0.17
279 0.16
280 0.17
281 0.16
282 0.18
283 0.17
284 0.16
285 0.13
286 0.13
287 0.13
288 0.12
289 0.13
290 0.1
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.07
295 0.1
296 0.12
297 0.12
298 0.18
299 0.2
300 0.2
301 0.21
302 0.23
303 0.23
304 0.24
305 0.29
306 0.28
307 0.28
308 0.3
309 0.32
310 0.3
311 0.26
312 0.31
313 0.26
314 0.29
315 0.33
316 0.33
317 0.31
318 0.37
319 0.38
320 0.31
321 0.33
322 0.25
323 0.19
324 0.18
325 0.18
326 0.16
327 0.17
328 0.16
329 0.15
330 0.14
331 0.14
332 0.14
333 0.13
334 0.09
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.08
339 0.07
340 0.09
341 0.1
342 0.1
343 0.11
344 0.11
345 0.1
346 0.12
347 0.12
348 0.12
349 0.13
350 0.13
351 0.13
352 0.14
353 0.14
354 0.12
355 0.12
356 0.13
357 0.13
358 0.14
359 0.13
360 0.12
361 0.14
362 0.16
363 0.15
364 0.12
365 0.1
366 0.09
367 0.1
368 0.1
369 0.08
370 0.1
371 0.1
372 0.11
373 0.13
374 0.13
375 0.14
376 0.16
377 0.18
378 0.18
379 0.19
380 0.19
381 0.17
382 0.17
383 0.17
384 0.16
385 0.14
386 0.1
387 0.09
388 0.09
389 0.08
390 0.09
391 0.08
392 0.07
393 0.07
394 0.09
395 0.09
396 0.09
397 0.08
398 0.08
399 0.1
400 0.1
401 0.1
402 0.09
403 0.1
404 0.11
405 0.12
406 0.12
407 0.1
408 0.12
409 0.11
410 0.14
411 0.13
412 0.12
413 0.12
414 0.13
415 0.17
416 0.23
417 0.29
418 0.33
419 0.4
420 0.43
421 0.49
422 0.51
423 0.52
424 0.55
425 0.54
426 0.5
427 0.44
428 0.4
429 0.38
430 0.37
431 0.31
432 0.22
433 0.15
434 0.12
435 0.12
436 0.13
437 0.11
438 0.13
439 0.13
440 0.14
441 0.14
442 0.14
443 0.13
444 0.12
445 0.11
446 0.06
447 0.06
448 0.05
449 0.06
450 0.06
451 0.1
452 0.17
453 0.18
454 0.23
455 0.3
456 0.32
457 0.37
458 0.44
459 0.5
460 0.55
461 0.64
462 0.7
463 0.72
464 0.73
465 0.71
466 0.72
467 0.67
468 0.63
469 0.62
470 0.61
471 0.63
472 0.69
473 0.72
474 0.73
475 0.79
476 0.81
477 0.8
478 0.8
479 0.78
480 0.78
481 0.81
482 0.82
483 0.81
484 0.79
485 0.79
486 0.74
487 0.73
488 0.73
489 0.71
490 0.68
491 0.7
492 0.71
493 0.67
494 0.65
495 0.63
496 0.61
497 0.56
498 0.51
499 0.49
500 0.47
501 0.45
502 0.43
503 0.38
504 0.32
505 0.37
506 0.43
507 0.47
508 0.5
509 0.57
510 0.65
511 0.75
512 0.8
513 0.82
514 0.84
515 0.84
516 0.85
517 0.87
518 0.89
519 0.9
520 0.9
521 0.88
522 0.87
523 0.83
524 0.81
525 0.79
526 0.76
527 0.71
528 0.66
529 0.65
530 0.64
531 0.59
532 0.53
533 0.51