Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QV73

Protein Details
Accession C4QV73    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-98LRNSYDSYKRLKRQRNEKRSQLNERDKRFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001623  DnaJ_domain  
IPR036869  J_dom_sf  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG ppa:PAS_chr1-3_0089  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00226  DnaJ  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50076  DNAJ_2  
CDD cd06257  DnaJ  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MDQDLKQVLDRDIDLYDLLGVPEDSQDSDIRRGYRQQALIYHPDKNDTPQANVRFQQISTALKILGTPELRNSYDSYKRLKRQRNEKRSQLNERDKRFENELVKAEEELLRNLKSQQSNAYKEAILREENLKLRRRRESKYLNLPNVTHQVESPVVVKLKWKNLIQGIFTEDEIRDIMSRFGRISKIWFPENNDSDTYHYCFIQFEDYIGGVLATLCDYSKLNPENDPVGKSGSLIKLLRSCRFVESSINLKWDRREMSQAEYIGRTLLNLQSN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.13
3 0.12
4 0.1
5 0.09
6 0.08
7 0.07
8 0.07
9 0.08
10 0.09
11 0.08
12 0.1
13 0.12
14 0.15
15 0.19
16 0.22
17 0.24
18 0.26
19 0.31
20 0.36
21 0.41
22 0.42
23 0.42
24 0.43
25 0.46
26 0.52
27 0.49
28 0.48
29 0.41
30 0.41
31 0.38
32 0.37
33 0.4
34 0.33
35 0.36
36 0.38
37 0.42
38 0.44
39 0.45
40 0.45
41 0.38
42 0.36
43 0.34
44 0.3
45 0.27
46 0.24
47 0.23
48 0.19
49 0.17
50 0.17
51 0.15
52 0.17
53 0.16
54 0.14
55 0.17
56 0.21
57 0.22
58 0.23
59 0.25
60 0.26
61 0.31
62 0.34
63 0.39
64 0.43
65 0.5
66 0.59
67 0.66
68 0.69
69 0.73
70 0.81
71 0.84
72 0.84
73 0.86
74 0.87
75 0.86
76 0.87
77 0.86
78 0.86
79 0.83
80 0.79
81 0.76
82 0.68
83 0.63
84 0.57
85 0.53
86 0.46
87 0.42
88 0.4
89 0.36
90 0.33
91 0.29
92 0.26
93 0.22
94 0.2
95 0.17
96 0.16
97 0.14
98 0.14
99 0.16
100 0.19
101 0.18
102 0.18
103 0.25
104 0.3
105 0.33
106 0.34
107 0.34
108 0.3
109 0.29
110 0.3
111 0.23
112 0.17
113 0.15
114 0.15
115 0.17
116 0.21
117 0.26
118 0.31
119 0.34
120 0.38
121 0.46
122 0.5
123 0.5
124 0.55
125 0.58
126 0.59
127 0.66
128 0.69
129 0.63
130 0.6
131 0.57
132 0.5
133 0.47
134 0.39
135 0.28
136 0.2
137 0.18
138 0.16
139 0.16
140 0.14
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.15
145 0.17
146 0.22
147 0.27
148 0.26
149 0.28
150 0.33
151 0.35
152 0.31
153 0.29
154 0.26
155 0.21
156 0.21
157 0.18
158 0.13
159 0.11
160 0.11
161 0.1
162 0.08
163 0.07
164 0.1
165 0.1
166 0.11
167 0.1
168 0.13
169 0.14
170 0.14
171 0.19
172 0.22
173 0.25
174 0.28
175 0.3
176 0.34
177 0.42
178 0.43
179 0.41
180 0.36
181 0.34
182 0.33
183 0.34
184 0.3
185 0.22
186 0.2
187 0.17
188 0.16
189 0.16
190 0.16
191 0.14
192 0.11
193 0.12
194 0.12
195 0.11
196 0.11
197 0.1
198 0.06
199 0.05
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.06
206 0.07
207 0.15
208 0.19
209 0.2
210 0.22
211 0.25
212 0.31
213 0.33
214 0.33
215 0.27
216 0.26
217 0.24
218 0.23
219 0.25
220 0.21
221 0.24
222 0.23
223 0.26
224 0.29
225 0.35
226 0.38
227 0.36
228 0.36
229 0.34
230 0.37
231 0.35
232 0.34
233 0.34
234 0.36
235 0.36
236 0.4
237 0.38
238 0.38
239 0.4
240 0.41
241 0.4
242 0.38
243 0.42
244 0.39
245 0.43
246 0.47
247 0.45
248 0.42
249 0.38
250 0.35
251 0.28
252 0.25
253 0.19
254 0.16