Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R9B7

Protein Details
Accession C4R9B7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-33MIKLKLHTDKKQNTVERRPKIKVKPPINKPESTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-26RRPKIKVKPP
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG ppa:PAS_FragD_0016  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MIKLKLHTDKKQNTVERRPKIKVKPPINKPESTVIPRIRVKPTRIAGDGYDSEDPDREDDPTTEEAIVMRIVPNDYSLEYVKKCVEQGDFSEISLQWKDKRRAVLRLKDRLYGAKLVDLPTMVEIHKTIDRKNIFKTMDVSQILLVIKELKYESEYLDIQLTASETFDDGLTPPLRGVKKRFDKRMTSKVFQIIEEQVDELFRLDEEAEASKYELVDTEAGTIPSFDADASTPNTKEFTVRGHLDVEDNEDLELELEQAFQQQSDTPLNPQQRSKGGRKTNDSDAHVRFYEQEEEDDEDEETFELKRVCSAEAKVEEGEEEAEEETEETEDDEDDDDEEVVGGKEIISGQRAGIDERLTHTQIIKEEIEELQATIGLKQSDFNKASNPIMKNRISDVIGRLKAELETKLRQVEMEQKEQQNNSNVTSHNIYQQRELDEDEDEDDDEDGDEDDDDDMEDLF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.84
3 0.84
4 0.84
5 0.84
6 0.84
7 0.85
8 0.85
9 0.84
10 0.84
11 0.85
12 0.87
13 0.9
14 0.86
15 0.79
16 0.73
17 0.7
18 0.68
19 0.63
20 0.62
21 0.55
22 0.57
23 0.61
24 0.62
25 0.64
26 0.63
27 0.62
28 0.63
29 0.64
30 0.62
31 0.58
32 0.55
33 0.46
34 0.46
35 0.42
36 0.37
37 0.33
38 0.26
39 0.25
40 0.24
41 0.23
42 0.19
43 0.18
44 0.16
45 0.16
46 0.16
47 0.19
48 0.2
49 0.21
50 0.18
51 0.17
52 0.16
53 0.15
54 0.14
55 0.11
56 0.1
57 0.09
58 0.1
59 0.1
60 0.11
61 0.11
62 0.12
63 0.14
64 0.15
65 0.18
66 0.18
67 0.21
68 0.22
69 0.22
70 0.22
71 0.23
72 0.24
73 0.22
74 0.25
75 0.29
76 0.27
77 0.26
78 0.28
79 0.25
80 0.26
81 0.25
82 0.24
83 0.24
84 0.33
85 0.38
86 0.4
87 0.49
88 0.51
89 0.59
90 0.67
91 0.7
92 0.71
93 0.75
94 0.73
95 0.67
96 0.64
97 0.58
98 0.51
99 0.45
100 0.36
101 0.3
102 0.3
103 0.27
104 0.26
105 0.21
106 0.18
107 0.14
108 0.15
109 0.11
110 0.1
111 0.09
112 0.11
113 0.15
114 0.17
115 0.17
116 0.25
117 0.29
118 0.31
119 0.35
120 0.4
121 0.37
122 0.38
123 0.39
124 0.34
125 0.37
126 0.34
127 0.31
128 0.23
129 0.24
130 0.22
131 0.19
132 0.16
133 0.11
134 0.1
135 0.11
136 0.11
137 0.09
138 0.11
139 0.12
140 0.12
141 0.13
142 0.13
143 0.13
144 0.13
145 0.13
146 0.11
147 0.1
148 0.1
149 0.07
150 0.07
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.15
162 0.17
163 0.21
164 0.25
165 0.31
166 0.41
167 0.5
168 0.59
169 0.6
170 0.68
171 0.72
172 0.78
173 0.75
174 0.67
175 0.63
176 0.6
177 0.54
178 0.44
179 0.39
180 0.3
181 0.23
182 0.21
183 0.18
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.07
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.05
217 0.08
218 0.09
219 0.09
220 0.1
221 0.11
222 0.1
223 0.11
224 0.1
225 0.11
226 0.15
227 0.16
228 0.17
229 0.17
230 0.17
231 0.17
232 0.17
233 0.18
234 0.13
235 0.12
236 0.1
237 0.09
238 0.09
239 0.08
240 0.08
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.06
250 0.09
251 0.11
252 0.12
253 0.13
254 0.19
255 0.25
256 0.27
257 0.28
258 0.29
259 0.33
260 0.39
261 0.43
262 0.46
263 0.49
264 0.54
265 0.58
266 0.6
267 0.62
268 0.61
269 0.58
270 0.56
271 0.49
272 0.46
273 0.4
274 0.35
275 0.28
276 0.24
277 0.25
278 0.19
279 0.18
280 0.16
281 0.18
282 0.18
283 0.18
284 0.16
285 0.11
286 0.11
287 0.1
288 0.09
289 0.06
290 0.08
291 0.08
292 0.07
293 0.09
294 0.1
295 0.12
296 0.14
297 0.15
298 0.2
299 0.21
300 0.23
301 0.21
302 0.2
303 0.19
304 0.16
305 0.15
306 0.09
307 0.08
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.07
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.04
331 0.05
332 0.06
333 0.07
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.11
338 0.12
339 0.13
340 0.14
341 0.14
342 0.14
343 0.17
344 0.21
345 0.19
346 0.2
347 0.2
348 0.21
349 0.22
350 0.25
351 0.22
352 0.18
353 0.19
354 0.18
355 0.18
356 0.16
357 0.14
358 0.1
359 0.11
360 0.1
361 0.09
362 0.12
363 0.1
364 0.1
365 0.13
366 0.15
367 0.23
368 0.25
369 0.25
370 0.27
371 0.3
372 0.35
373 0.4
374 0.41
375 0.39
376 0.45
377 0.47
378 0.44
379 0.44
380 0.43
381 0.37
382 0.37
383 0.36
384 0.38
385 0.37
386 0.36
387 0.33
388 0.3
389 0.3
390 0.29
391 0.28
392 0.24
393 0.26
394 0.29
395 0.31
396 0.3
397 0.29
398 0.29
399 0.35
400 0.35
401 0.4
402 0.44
403 0.47
404 0.53
405 0.55
406 0.58
407 0.56
408 0.52
409 0.47
410 0.44
411 0.38
412 0.37
413 0.39
414 0.35
415 0.35
416 0.39
417 0.37
418 0.39
419 0.42
420 0.41
421 0.38
422 0.39
423 0.32
424 0.28
425 0.28
426 0.24
427 0.2
428 0.18
429 0.16
430 0.14
431 0.12
432 0.11
433 0.1
434 0.08
435 0.08
436 0.07
437 0.07
438 0.08
439 0.07
440 0.07