FuNGI

Q0UJ24

Protein Details

Accession

Q0UJ24

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
24-52	IDSIAAEQRPPKRQRKTKHTIKKELEAEF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
33-42	PPKRQRKTKH
537-596	KEAPTGRGGGGGGGGRGGPAARGGQNQRGRGQQNGGRGGAQRGGGPPAQRGRGNIARTGR

Subcellular Location(s)

cyto 13.5, cyto_nucl 11.5, nucl 8.5, pero 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR025696 rRNA_proc-arch_dom IPR016438 SKI2-like IPR012961 Ski2/MTR4_C IPR040801 Ski2_N
Gene Ontology	GO:0055087 C:Ski complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0030968 P:endoplasmic reticulum unfolded protein response GO:0070478 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, 3'-5' exonucleolytic nonsense-mediated decay GO:0070481 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, non-stop decay
KEGG	pno:SNOG_08240 -
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF08148 DSHCT PF00271 Helicase_C PF13234 rRNA_proc-arch PF17911 Ski2_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd18795 SF2_C_Ski2

Amino Acid Sequences

MEALSAELDKLRLSTSALSDPGWIDSIAAEQRPPKRQRKTKHTIKKELEAEFLTPSRSFNTQWLNQLQQRWDAPTNYRSLCQIAPTQTRTIIRFTREGLEGRVTGYKEVTVPANSATAKNSTSLLRKPANRAEFVRGAAGFFPFAPGGLDGVEAIAAREDEAIVQQEKASAKAGGGLDRVINFSDPTGLLAIPPGFTRGLDFQKKLLPDAKITKEVEDTLGEASAVNKSSEDDDDEGSNDDRNGGAAAGEDGQTPMEEEIDALLPVEFPALAPHGPLAMAASRKKGREWAHMVDINRDITNFRELVPDMAREYPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRLTFDDVGILTGDVQIRPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDLERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTYEFASWVGRTKKKDIYVISTPKRPIPLEHYLWAGKGMYKIVTADKKFIDNGWKEANDVMSGKDKVKAPVTKEAPTGRGGGGGGGGRGGPAARGGQNQRGRGQQNGGRGGAQRGGGPPAQRGRGNIARTGRGGGRTTAAQDRNIWVHLIQFLRSKDLLPACIFVFSKKRCEENAEALSNIDYCTAAEKSAIHMTIEKSLARLSPEDRDLPQIKRLRELLSRGIAVHHGGMLPIVKEVVEILFAKTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGFRKHDGREFRDLLPGEYTQMAGRAGRRGLDSVGTVIVCAPGADEAPPAARLRQMMLGEPTKLRSQFRLTYNMMLNLLRVEALKIEEMIKRSFSENATQALLPEHEKNVKVSEADLEKIKREPCEICDIDLEACHQSCEDYKRLTNEMHLSLLVDPVGRRVLSRNRLIVYKKDNKRTAGMLMQDGTSRGNEPTIKVLEIAQNEDRKADDLLPYLGPFAKFFRNLPKSPKDLILKTAFVPLNDIECFTKTTIDVPESVQNLNRKKDTLKLAQDQFLPLCQSWNYEDWDEYDYSRIKSMKFRELMETRVKEGQNAVDKKCLECPDFLKHFEMEHDQWVIKENILSLRQLMSDQNLQLLPDYEQRIRVLQDLGFIDGGSRVELKGKVACEIHSADELVLTELVLENVLADYTPEEIVSLLSAFVFQEKTDTEPTLTASLERGVAAIVKISEKVNEIQTLHQVILSADDSNDFVSKPRFGMVEVVYEWARGMSFNRITDLTDVMEGTIVRVITRLDETCREVKNAARIIGDPVLFQKMGTCQELIKRDICNCASLYL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.18
3	0.22
4	0.23
5	0.23
6	0.24
7	0.24
8	0.23
9	0.21
10	0.17
11	0.12
12	0.11
13	0.15
14	0.16
15	0.17
16	0.18
17	0.23
18	0.31
19	0.41
20	0.5
21	0.56
22	0.64
23	0.73
24	0.82
25	0.86
26	0.89
27	0.9
28	0.92
29	0.93
30	0.93
31	0.9
32	0.89
33	0.85
34	0.78
35	0.72
36	0.62
37	0.53
38	0.47
39	0.4
40	0.33
41	0.26
42	0.24
43	0.22
44	0.23
45	0.23
46	0.25
47	0.33
48	0.35
49	0.42
50	0.47
51	0.51
52	0.53
53	0.58
54	0.54
55	0.52
56	0.49
57	0.48
58	0.47
59	0.44
60	0.45
61	0.44
62	0.48
63	0.43
64	0.42
65	0.38
66	0.37
67	0.34
68	0.32
69	0.33
70	0.34
71	0.39
72	0.42
73	0.43
74	0.44
75	0.47
76	0.45
77	0.46
78	0.43
79	0.4
80	0.4
81	0.4
82	0.4
83	0.39
84	0.39
85	0.35
86	0.34
87	0.3
88	0.29
89	0.31
90	0.27
91	0.24
92	0.23
93	0.21
94	0.17
95	0.19
96	0.2
97	0.16
98	0.17
99	0.16
100	0.2
101	0.2
102	0.2
103	0.2
104	0.2
105	0.19
106	0.19
107	0.21
108	0.21
109	0.26
110	0.29
111	0.35
112	0.4
113	0.45
114	0.51
115	0.59
116	0.6
117	0.59
118	0.59
119	0.58
120	0.54
121	0.5
122	0.46
123	0.37
124	0.32
125	0.27
126	0.24
127	0.18
128	0.14
129	0.14
130	0.1
131	0.1
132	0.1
133	0.09
134	0.09
135	0.08
136	0.09
137	0.06
138	0.06
139	0.07
140	0.05
141	0.05
142	0.05
143	0.05
144	0.05
145	0.06
146	0.06
147	0.06
148	0.07
149	0.11
150	0.11
151	0.12
152	0.11
153	0.15
154	0.16
155	0.17
156	0.18
157	0.14
158	0.13
159	0.18
160	0.2
161	0.18
162	0.18
163	0.18
164	0.17
165	0.18
166	0.19
167	0.15
168	0.14
169	0.12
170	0.11
171	0.13
172	0.11
173	0.11
174	0.11
175	0.1
176	0.09
177	0.12
178	0.12
179	0.1
180	0.1
181	0.11
182	0.1
183	0.1
184	0.13
185	0.16
186	0.25
187	0.31
188	0.32
189	0.33
190	0.37
191	0.38
192	0.39
193	0.4
194	0.33
195	0.33
196	0.41
197	0.43
198	0.46
199	0.46
200	0.44
201	0.4
202	0.39
203	0.33
204	0.26
205	0.21
206	0.15
207	0.14
208	0.12
209	0.1
210	0.09
211	0.1
212	0.1
213	0.1
214	0.09
215	0.1
216	0.12
217	0.13
218	0.16
219	0.15
220	0.15
221	0.16
222	0.17
223	0.18
224	0.16
225	0.16
226	0.13
227	0.12
228	0.1
229	0.1
230	0.09
231	0.07
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.07
236	0.07
237	0.07
238	0.07
239	0.07
240	0.07
241	0.08
242	0.07
243	0.06
244	0.06
245	0.05
246	0.06
247	0.07
248	0.07
249	0.06
250	0.06
251	0.06
252	0.06
253	0.06
254	0.05
255	0.04
256	0.05
257	0.07
258	0.07
259	0.07
260	0.08
261	0.08
262	0.08
263	0.07
264	0.08
265	0.09
266	0.13
267	0.15
268	0.22
269	0.26
270	0.27
271	0.29
272	0.35
273	0.37
274	0.43
275	0.48
276	0.47
277	0.51
278	0.53
279	0.53
280	0.49
281	0.47
282	0.39
283	0.32
284	0.27
285	0.19
286	0.17
287	0.2
288	0.16
289	0.14
290	0.16
291	0.16
292	0.19
293	0.2
294	0.19
295	0.18
296	0.21
297	0.21
298	0.18
299	0.19
300	0.17
301	0.16
302	0.15
303	0.15
304	0.14
305	0.16
306	0.18
307	0.16
308	0.16
309	0.15
310	0.16
311	0.18
312	0.18
313	0.17
314	0.15
315	0.15
316	0.14
317	0.15
318	0.14
319	0.1
320	0.07
321	0.06
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.06
328	0.06
329	0.07
330	0.07
331	0.06
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.07
336	0.06
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.06
341	0.05
342	0.07
343	0.07
344	0.08
345	0.08
346	0.08
347	0.08
348	0.1
349	0.11
350	0.18
351	0.19
352	0.21
353	0.23
354	0.26
355	0.26
356	0.3
357	0.38
358	0.38
359	0.47
360	0.47
361	0.52
362	0.52
363	0.53
364	0.59
365	0.5
366	0.43
367	0.41
368	0.42
369	0.35
370	0.32
371	0.31
372	0.2
373	0.2
374	0.18
375	0.1
376	0.06
377	0.07
378	0.08
379	0.07
380	0.07
381	0.07
382	0.08
383	0.08
384	0.09
385	0.07
386	0.07
387	0.07
388	0.07
389	0.09
390	0.08
391	0.08
392	0.09
393	0.09
394	0.09
395	0.09
396	0.09
397	0.07
398	0.08
399	0.11
400	0.1
401	0.09
402	0.1
403	0.11
404	0.11
405	0.11
406	0.11
407	0.09
408	0.09
409	0.1
410	0.08
411	0.07
412	0.07
413	0.09
414	0.07
415	0.06
416	0.08
417	0.08
418	0.08
419	0.09
420	0.09
421	0.07
422	0.09
423	0.09
424	0.07
425	0.07
426	0.08
427	0.09
428	0.08
429	0.08
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.05
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.03
440	0.03
441	0.03
442	0.03
443	0.04
444	0.03
445	0.03
446	0.04
447	0.05
448	0.05
449	0.05
450	0.06
451	0.06
452	0.07
453	0.07
454	0.07
455	0.07
456	0.09
457	0.1
458	0.1
459	0.16
460	0.22
461	0.26
462	0.29
463	0.34
464	0.37
465	0.4
466	0.45
467	0.41
468	0.41
469	0.46
470	0.52
471	0.51
472	0.51
473	0.49
474	0.45
475	0.46
476	0.4
477	0.34
478	0.31
479	0.35
480	0.33
481	0.33
482	0.34
483	0.3
484	0.3
485	0.28
486	0.21
487	0.14
488	0.12
489	0.11
490	0.09
491	0.09
492	0.1
493	0.14
494	0.2
495	0.2
496	0.22
497	0.22
498	0.23
499	0.23
500	0.23
501	0.27
502	0.22
503	0.24
504	0.26
505	0.25
506	0.24
507	0.24
508	0.23
509	0.16
510	0.15
511	0.13
512	0.13
513	0.14
514	0.15
515	0.18
516	0.19
517	0.2
518	0.26
519	0.28
520	0.27
521	0.35
522	0.38
523	0.37
524	0.39
525	0.38
526	0.34
527	0.32
528	0.3
529	0.2
530	0.18
531	0.15
532	0.11
533	0.1
534	0.08
535	0.07
536	0.05
537	0.05
538	0.04
539	0.04
540	0.04
541	0.03
542	0.04
543	0.05
544	0.06
545	0.1
546	0.13
547	0.21
548	0.25
549	0.28
550	0.3
551	0.34
552	0.34
553	0.33
554	0.36
555	0.3
556	0.32
557	0.32
558	0.3
559	0.26
560	0.25
561	0.24
562	0.21
563	0.19
564	0.14
565	0.12
566	0.13
567	0.13
568	0.13
569	0.16
570	0.17
571	0.19
572	0.19
573	0.19
574	0.24
575	0.28
576	0.29
577	0.29
578	0.28
579	0.27
580	0.27
581	0.28
582	0.23
583	0.2
584	0.19
585	0.15
586	0.14
587	0.13
588	0.15
589	0.19
590	0.19
591	0.18
592	0.18
593	0.19
594	0.19
595	0.19
596	0.17
597	0.11
598	0.1
599	0.12
600	0.12
601	0.12
602	0.15
603	0.15
604	0.17
605	0.17
606	0.17
607	0.17
608	0.17
609	0.18
610	0.15
611	0.16
612	0.13
613	0.15
614	0.15
615	0.13
616	0.19
617	0.18
618	0.25
619	0.25
620	0.28
621	0.26
622	0.32
623	0.34
624	0.34
625	0.38
626	0.32
627	0.3
628	0.27
629	0.27
630	0.21
631	0.17
632	0.1
633	0.05
634	0.04
635	0.06
636	0.06
637	0.06
638	0.06
639	0.06
640	0.08
641	0.1
642	0.11
643	0.09
644	0.11
645	0.11
646	0.14
647	0.15
648	0.12
649	0.11
650	0.11
651	0.12
652	0.11
653	0.12
654	0.1
655	0.12
656	0.15
657	0.16
658	0.16
659	0.21
660	0.23
661	0.23
662	0.29
663	0.32
664	0.3
665	0.32
666	0.33
667	0.31
668	0.3
669	0.32
670	0.29
671	0.26
672	0.26
673	0.22
674	0.21
675	0.18
676	0.15
677	0.12
678	0.08
679	0.06
680	0.05
681	0.05
682	0.05
683	0.05
684	0.04
685	0.04
686	0.04
687	0.04
688	0.04
689	0.04
690	0.05
691	0.05
692	0.05
693	0.06
694	0.06
695	0.07
696	0.06
697	0.08
698	0.07
699	0.07
700	0.06
701	0.06
702	0.08
703	0.08
704	0.09
705	0.08
706	0.08
707	0.07
708	0.08
709	0.07
710	0.06
711	0.07
712	0.07
713	0.07
714	0.06
715	0.06
716	0.07
717	0.07
718	0.07
719	0.08
720	0.1
721	0.12
722	0.18
723	0.19
724	0.23
725	0.24
726	0.25
727	0.3
728	0.34
729	0.37
730	0.39
731	0.4
732	0.37
733	0.41
734	0.4
735	0.35
736	0.3
737	0.25
738	0.18
739	0.15
740	0.15
741	0.09
742	0.1
743	0.09
744	0.08
745	0.09
746	0.11
747	0.11
748	0.12
749	0.12
750	0.12
751	0.12
752	0.12
753	0.11
754	0.09
755	0.1
756	0.08
757	0.07
758	0.07
759	0.06
760	0.05
761	0.04
762	0.04
763	0.03
764	0.04
765	0.04
766	0.04
767	0.04
768	0.05
769	0.06
770	0.07
771	0.07
772	0.08
773	0.08
774	0.1
775	0.13
776	0.13
777	0.14
778	0.17
779	0.19
780	0.19
781	0.19
782	0.2
783	0.19
784	0.21
785	0.2
786	0.2
787	0.24
788	0.29
789	0.32
790	0.37
791	0.36
792	0.38
793	0.38
794	0.36
795	0.32
796	0.25
797	0.22
798	0.15
799	0.13
800	0.09
801	0.07
802	0.06
803	0.05
804	0.06
805	0.06
806	0.07
807	0.09
808	0.11
809	0.13
810	0.14
811	0.14
812	0.15
813	0.16
814	0.18
815	0.17
816	0.2
817	0.2
818	0.2
819	0.21
820	0.2
821	0.19
822	0.17
823	0.17
824	0.14
825	0.14
826	0.14
827	0.16
828	0.16
829	0.17
830	0.18
831	0.18
832	0.16
833	0.15
834	0.17
835	0.16
836	0.17
837	0.2
838	0.19
839	0.19
840	0.23
841	0.25
842	0.21
843	0.23
844	0.23
845	0.22
846	0.3
847	0.29
848	0.27
849	0.26
850	0.26
851	0.22
852	0.21
853	0.19
854	0.12
855	0.11
856	0.1
857	0.09
858	0.08
859	0.12
860	0.16
861	0.18
862	0.2
863	0.22
864	0.26
865	0.28
866	0.28
867	0.29
868	0.29
869	0.27
870	0.24
871	0.22
872	0.19
873	0.17
874	0.17
875	0.13
876	0.09
877	0.07
878	0.08
879	0.1
880	0.09
881	0.09
882	0.14
883	0.23
884	0.29
885	0.34
886	0.36
887	0.37
888	0.42
889	0.44
890	0.46
891	0.47
892	0.5
893	0.54
894	0.59
895	0.62
896	0.6
897	0.6
898	0.56
899	0.5
900	0.44
901	0.38
902	0.31
903	0.27
904	0.24
905	0.22
906	0.2
907	0.16
908	0.12
909	0.11
910	0.09
911	0.12
912	0.12
913	0.13
914	0.17
915	0.18
916	0.18
917	0.17
918	0.18
919	0.2
920	0.2
921	0.23
922	0.23
923	0.24
924	0.24
925	0.24
926	0.23
927	0.2
928	0.21
929	0.18
930	0.15
931	0.14
932	0.16
933	0.16
934	0.15
935	0.15
936	0.15
937	0.14
938	0.13
939	0.14
940	0.16
941	0.17
942	0.19
943	0.29
944	0.34
945	0.38
946	0.45
947	0.49
948	0.5
949	0.51
950	0.57
951	0.53
952	0.47
953	0.5
954	0.46
955	0.41
956	0.36
957	0.41
958	0.34
959	0.28
960	0.29
961	0.23
962	0.22
963	0.2
964	0.21
965	0.14
966	0.15
967	0.17
968	0.14
969	0.15
970	0.12
971	0.15
972	0.16
973	0.16
974	0.16
975	0.17
976	0.21
977	0.22
978	0.23
979	0.24
980	0.29
981	0.33
982	0.38
983	0.37
984	0.34
985	0.35
986	0.41
987	0.45
988	0.46
989	0.49
990	0.52
991	0.54
992	0.56
993	0.55
994	0.5
995	0.43
996	0.36
997	0.3
998	0.22
999	0.2
1000	0.16
1001	0.17
1002	0.18
1003	0.2
1004	0.21
1005	0.2
1006	0.2
1007	0.2
1008	0.23
1009	0.21
1010	0.19
1011	0.21
1012	0.2
1013	0.19
1014	0.23
1015	0.23
1016	0.22
1017	0.29
1018	0.35
1019	0.4
1020	0.41
1021	0.42
1022	0.46
1023	0.47
1024	0.51
1025	0.53
1026	0.49
1027	0.43
1028	0.46
1029	0.44
1030	0.37
1031	0.36
1032	0.37
1033	0.37
1034	0.4
1035	0.39
1036	0.38
1037	0.39
1038	0.4
1039	0.44
1040	0.42
1041	0.34
1042	0.33
1043	0.35
1044	0.38
1045	0.42
1046	0.43
1047	0.39
1048	0.35
1049	0.34
1050	0.33
1051	0.35
1052	0.28
1053	0.27
1054	0.27
1055	0.24
1056	0.23
1057	0.27
1058	0.25
1059	0.18
1060	0.17
1061	0.16
1062	0.19
1063	0.2
1064	0.2
1065	0.17
1066	0.18
1067	0.18
1068	0.18
1069	0.18
1070	0.16
1071	0.19
1072	0.19
1073	0.21
1074	0.2
1075	0.19
1076	0.19
1077	0.19
1078	0.18
1079	0.19
1080	0.23
1081	0.22
1082	0.24
1083	0.25
1084	0.27
1085	0.27
1086	0.27
1087	0.24
1088	0.19
1089	0.23
1090	0.21
1091	0.21
1092	0.19
1093	0.17
1094	0.15
1095	0.14
1096	0.14
1097	0.1
1098	0.09
1099	0.08
1100	0.12
1101	0.13
1102	0.15
1103	0.18
1104	0.18
1105	0.22
1106	0.23
1107	0.23
1108	0.23
1109	0.25
1110	0.24
1111	0.22
1112	0.22
1113	0.17
1114	0.17
1115	0.16
1116	0.13
1117	0.11
1118	0.09
1119	0.07
1120	0.07
1121	0.07
1122	0.06
1123	0.05
1124	0.04
1125	0.04
1126	0.05
1127	0.04
1128	0.04
1129	0.05
1130	0.06
1131	0.07
1132	0.06
1133	0.06
1134	0.07
1135	0.07
1136	0.07
1137	0.07
1138	0.05
1139	0.05
1140	0.06
1141	0.06
1142	0.07
1143	0.08
1144	0.07
1145	0.1
1146	0.1
1147	0.15
1148	0.18
1149	0.19
1150	0.19
1151	0.19
1152	0.22
1153	0.21
1154	0.21
1155	0.17
1156	0.15
1157	0.15
1158	0.14
1159	0.13
1160	0.11
1161	0.09
1162	0.1
1163	0.09
1164	0.1
1165	0.1
1166	0.1
1167	0.12
1168	0.12
1169	0.14
1170	0.15
1171	0.18
1172	0.2
1173	0.24
1174	0.24
1175	0.25
1176	0.3
1177	0.31
1178	0.28
1179	0.25
1180	0.22
1181	0.18
1182	0.19
1183	0.18
1184	0.13
1185	0.11
1186	0.12
1187	0.12
1188	0.12
1189	0.13
1190	0.1
1191	0.12
1192	0.15
1193	0.17
1194	0.17
1195	0.19
1196	0.18
1197	0.19
1198	0.25
1199	0.23
1200	0.24
1201	0.23
1202	0.26
1203	0.23
1204	0.23
1205	0.22
1206	0.16
1207	0.14
1208	0.1
1209	0.11
1210	0.17
1211	0.22
1212	0.23
1213	0.26
1214	0.26
1215	0.28
1216	0.28
1217	0.28
1218	0.21
1219	0.17
1220	0.16
1221	0.13
1222	0.14
1223	0.12
1224	0.11
1225	0.12
1226	0.1
1227	0.09
1228	0.1
1229	0.1
1230	0.11
1231	0.16
1232	0.17
1233	0.19
1234	0.24
1235	0.29
1236	0.35
1237	0.38
1238	0.38
1239	0.36
1240	0.39
1241	0.43
1242	0.44
1243	0.42
1244	0.37
1245	0.35
1246	0.38
1247	0.4
1248	0.35
1249	0.27
1250	0.24
1251	0.26
1252	0.24
1253	0.22
1254	0.2
1255	0.2
1256	0.25
1257	0.26
1258	0.24
1259	0.23
1260	0.31
1261	0.37
1262	0.37
1263	0.36
1264	0.37
1265	0.37
1266	0.44
1267	0.43
1268	0.39

Q0UJ24

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer