Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0TX27

Protein Details
Accession Q0TX27    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
69-105RDIPDWEKKPHQPRDPRNWHKVYRKLKKDAEREKQEQBasic
280-302IAQVPKKRKEAPSMFHKPKRKKMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
76-96KKPHQPRDPRNWHKVYRKLKK
284-302PKKRKEAPSMFHKPKRKKM
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 10, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG pno:SNOG_15839  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MPVPSLFELARQRLIKNIDLLNDIGDIPFSFLEPVLRNIQNPDQLQELEENCPQIQGETGEIWKKFIRRDIPDWEKKPHQPRDPRNWHKVYRKLKKDAEREKQEQEYALKEQMRALQKDRAQNKTLIVDSKVGYGARSNRVFGLGAGGSSWGTSGAPAKTGKVNLDALKRGMFDYKKERPRGANMPTHLLAQRKSQIRSAPASMVRVAENNAVAPRSMVISRQAAASVASRKDALPETKRPHITHRPVPQHSGAPPRTSLPAGQQFSAPKLKPTTQEPSIAQVPKKRKEAPSMFHKPKRKKM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.41
3 0.4
4 0.39
5 0.34
6 0.34
7 0.34
8 0.28
9 0.25
10 0.21
11 0.15
12 0.12
13 0.1
14 0.09
15 0.09
16 0.08
17 0.08
18 0.08
19 0.12
20 0.13
21 0.17
22 0.22
23 0.23
24 0.24
25 0.28
26 0.33
27 0.36
28 0.35
29 0.34
30 0.3
31 0.29
32 0.29
33 0.29
34 0.25
35 0.22
36 0.23
37 0.23
38 0.19
39 0.2
40 0.18
41 0.14
42 0.14
43 0.11
44 0.12
45 0.11
46 0.14
47 0.19
48 0.19
49 0.21
50 0.22
51 0.24
52 0.26
53 0.31
54 0.37
55 0.38
56 0.44
57 0.52
58 0.59
59 0.66
60 0.68
61 0.68
62 0.66
63 0.68
64 0.73
65 0.72
66 0.71
67 0.72
68 0.77
69 0.82
70 0.86
71 0.86
72 0.86
73 0.84
74 0.83
75 0.82
76 0.82
77 0.82
78 0.81
79 0.81
80 0.8
81 0.81
82 0.81
83 0.82
84 0.83
85 0.83
86 0.81
87 0.77
88 0.73
89 0.68
90 0.6
91 0.52
92 0.43
93 0.36
94 0.29
95 0.29
96 0.25
97 0.22
98 0.22
99 0.26
100 0.3
101 0.29
102 0.29
103 0.31
104 0.34
105 0.42
106 0.46
107 0.45
108 0.42
109 0.41
110 0.4
111 0.36
112 0.34
113 0.28
114 0.24
115 0.2
116 0.18
117 0.17
118 0.17
119 0.13
120 0.12
121 0.13
122 0.15
123 0.19
124 0.2
125 0.2
126 0.19
127 0.2
128 0.19
129 0.16
130 0.15
131 0.09
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.06
142 0.06
143 0.08
144 0.09
145 0.1
146 0.11
147 0.12
148 0.13
149 0.13
150 0.16
151 0.17
152 0.2
153 0.21
154 0.2
155 0.2
156 0.19
157 0.17
158 0.2
159 0.17
160 0.18
161 0.26
162 0.34
163 0.41
164 0.44
165 0.47
166 0.45
167 0.51
168 0.54
169 0.52
170 0.49
171 0.43
172 0.45
173 0.42
174 0.41
175 0.36
176 0.31
177 0.26
178 0.24
179 0.29
180 0.29
181 0.3
182 0.32
183 0.33
184 0.35
185 0.37
186 0.35
187 0.33
188 0.3
189 0.3
190 0.27
191 0.25
192 0.21
193 0.19
194 0.18
195 0.14
196 0.12
197 0.12
198 0.12
199 0.11
200 0.1
201 0.09
202 0.08
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.12
207 0.13
208 0.14
209 0.14
210 0.14
211 0.12
212 0.13
213 0.16
214 0.17
215 0.16
216 0.17
217 0.17
218 0.17
219 0.2
220 0.24
221 0.28
222 0.29
223 0.38
224 0.43
225 0.51
226 0.57
227 0.56
228 0.6
229 0.63
230 0.65
231 0.65
232 0.69
233 0.71
234 0.68
235 0.72
236 0.66
237 0.6
238 0.56
239 0.57
240 0.5
241 0.43
242 0.41
243 0.38
244 0.38
245 0.34
246 0.3
247 0.29
248 0.35
249 0.35
250 0.34
251 0.35
252 0.34
253 0.38
254 0.45
255 0.36
256 0.32
257 0.36
258 0.39
259 0.41
260 0.45
261 0.49
262 0.44
263 0.5
264 0.46
265 0.47
266 0.5
267 0.51
268 0.49
269 0.49
270 0.55
271 0.57
272 0.63
273 0.65
274 0.64
275 0.69
276 0.74
277 0.74
278 0.76
279 0.79
280 0.81
281 0.82
282 0.86