Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0TVM1

Protein Details
Accession Q0TVM1    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MAPALGKRKRISRKELEQPSRSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-10RKR
224-231KRRAEAKE
238-300RPTMNKIPGKRDETRKRDKAVGLPSVGKFRGGTLSLSKKDVRSITGGGGGGAKGKGKGKKAKR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027973  DUF4602  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG pno:SNOG_16443  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF15375  DUF4602  
Amino Acid Sequences MAPALGKRKRISRKELEQPSRSPSPSPSSDSNESGEEDVQAIFRRAFEAKFKPLAVETKEAKIETPKEIAEEEADGEEDAEWAGISEGDDDVQIIDYTNTQLGRDDTSKAEMKAFMSSKPPTSTAAPKKSLTVKKSPDEADLAESNNLRNDLDLQKLLRESHLLSTSSSGTSTPTLSATGIARHKSTDLHLQSLGAKRSVFSQKKMPMAQRKHMIQKARLTDEKRRAEAKEAGIILERPTMNKIPGKRDETRKRDKAVGLPSVGKFRGGTLSLSKKDVRSITGGGGGGAKGKGKGKKAKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.87
3 0.87
4 0.83
5 0.78
6 0.75
7 0.72
8 0.63
9 0.55
10 0.49
11 0.47
12 0.45
13 0.47
14 0.45
15 0.45
16 0.49
17 0.49
18 0.46
19 0.4
20 0.37
21 0.32
22 0.27
23 0.2
24 0.16
25 0.13
26 0.13
27 0.12
28 0.12
29 0.11
30 0.11
31 0.14
32 0.15
33 0.16
34 0.23
35 0.27
36 0.32
37 0.35
38 0.35
39 0.34
40 0.35
41 0.39
42 0.35
43 0.36
44 0.33
45 0.33
46 0.36
47 0.34
48 0.32
49 0.33
50 0.32
51 0.28
52 0.28
53 0.24
54 0.23
55 0.24
56 0.23
57 0.17
58 0.15
59 0.13
60 0.1
61 0.1
62 0.08
63 0.08
64 0.07
65 0.06
66 0.05
67 0.04
68 0.04
69 0.03
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.05
77 0.04
78 0.04
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.06
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.13
91 0.14
92 0.15
93 0.14
94 0.18
95 0.2
96 0.2
97 0.2
98 0.18
99 0.17
100 0.2
101 0.2
102 0.17
103 0.2
104 0.21
105 0.23
106 0.23
107 0.24
108 0.21
109 0.23
110 0.31
111 0.35
112 0.4
113 0.41
114 0.4
115 0.42
116 0.48
117 0.51
118 0.46
119 0.46
120 0.45
121 0.45
122 0.49
123 0.47
124 0.4
125 0.35
126 0.31
127 0.26
128 0.21
129 0.18
130 0.15
131 0.14
132 0.13
133 0.12
134 0.12
135 0.08
136 0.07
137 0.1
138 0.1
139 0.11
140 0.12
141 0.12
142 0.13
143 0.14
144 0.14
145 0.11
146 0.11
147 0.1
148 0.12
149 0.15
150 0.14
151 0.13
152 0.15
153 0.15
154 0.14
155 0.13
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.09
165 0.08
166 0.12
167 0.15
168 0.16
169 0.16
170 0.16
171 0.16
172 0.16
173 0.18
174 0.23
175 0.21
176 0.23
177 0.22
178 0.23
179 0.26
180 0.3
181 0.29
182 0.21
183 0.19
184 0.17
185 0.22
186 0.32
187 0.31
188 0.29
189 0.37
190 0.4
191 0.47
192 0.52
193 0.54
194 0.54
195 0.58
196 0.63
197 0.61
198 0.62
199 0.64
200 0.65
201 0.63
202 0.59
203 0.6
204 0.59
205 0.58
206 0.59
207 0.55
208 0.59
209 0.63
210 0.63
211 0.6
212 0.57
213 0.52
214 0.52
215 0.53
216 0.46
217 0.42
218 0.35
219 0.32
220 0.3
221 0.28
222 0.23
223 0.22
224 0.19
225 0.15
226 0.19
227 0.2
228 0.23
229 0.27
230 0.31
231 0.35
232 0.43
233 0.49
234 0.53
235 0.62
236 0.69
237 0.73
238 0.8
239 0.79
240 0.75
241 0.75
242 0.71
243 0.68
244 0.65
245 0.62
246 0.54
247 0.52
248 0.49
249 0.48
250 0.44
251 0.37
252 0.29
253 0.24
254 0.25
255 0.22
256 0.23
257 0.25
258 0.34
259 0.35
260 0.39
261 0.41
262 0.38
263 0.43
264 0.42
265 0.37
266 0.32
267 0.32
268 0.3
269 0.31
270 0.3
271 0.24
272 0.23
273 0.2
274 0.18
275 0.17
276 0.16
277 0.15
278 0.22
279 0.28
280 0.35