Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

K5WQ41

Protein Details
Accession K5WQ41    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
113-133SKEKAKPSTKGRGRDNKDERLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-126PAPRPNKRSRLEGPPSEGKPVKDKVSKEKAKPSTKGRGR
336-351GKKRTLKDEREAKKKA
744-753GKELPGKKRK
Subcellular Location(s) cyto 13, cyto_mito 11.833, mito 9.5, cyto_nucl 8.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034482  Mrd1_RRM3  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pco:PHACADRAFT_126290  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12565  RRM1_MRD1  
cd12568  RRM3_MRD1  
cd12316  RRM3_RBM19_RRM2_MRD1  
cd12320  RRM6_RBM19_RRM5_MRD1  
Amino Acid Sequences MSRLIVKNLPAYLTQQQLREHFESKGGPGGALTDVKVVLKPDGTSRRFGFVGYKTEVEAEKATKWFDRTFIHSSRINVSVIEGAKDAPAPRPNKRSRLEGPPSEGKPVKDKVSKEKAKPSTKGRGRDNKDERLEEFMQVMQPRKGPSWKDVDTVPSADAQGVASTSKVRMQGRSAKEDEEPSDADVSGGEPASDVDWLKRHMKPSLTLSESADMVFDQSDTEMDQLSETPAKSSPEDEAKSTILRTGRLFLRNLAFTCTEDELLGLFQPFGEVSQTHIPLDSITKTSKGLGYVTFADPEKAVIAYETLDKMSFQGRLLHVLPAINRKGKVAVEEVGKKRTLKDEREAKKKAIAGKDFNWGMLYMNSDAVVSSVADRMNISKSDILNPESDNAAVKLALAETHVIQETKSFLETNGVVLSSLSGPRVARSDTTILVKNIPYGTSADQIRELFEAHGKLRRVLVPPAGTMAVVEFVHSDEARKAFKTVAYRRMGNSITYLEKGPVGMFVDSVPVANGSVTIASAAPVKIADTDAPSPNDPPPNAGSTLFVKNLAFSTASERFVAAFRHLPDFAFARVQTKPDPKKPGDAHARLSMGYGFVGFKTAEGARKGLKAMQGYVLDGHALVVKFAGRGAEEEKEDAGKVKSRTTKMIVKNVPFEATKKDIRDLFGAHGQLKSVRLPKKFDHRSRGFAFLEFITRHEAENAYAALRHTHLLGRHLVLEWAEEDSSVDIEELRKKAGVGFGGGKELPGKKRKLEMVDERGLVDDDM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.37
3 0.4
4 0.43
5 0.48
6 0.48
7 0.45
8 0.39
9 0.4
10 0.38
11 0.34
12 0.37
13 0.3
14 0.25
15 0.22
16 0.22
17 0.21
18 0.19
19 0.18
20 0.13
21 0.13
22 0.14
23 0.15
24 0.15
25 0.15
26 0.15
27 0.16
28 0.24
29 0.33
30 0.35
31 0.4
32 0.41
33 0.43
34 0.41
35 0.41
36 0.39
37 0.34
38 0.39
39 0.36
40 0.35
41 0.3
42 0.33
43 0.33
44 0.29
45 0.27
46 0.23
47 0.23
48 0.24
49 0.26
50 0.27
51 0.3
52 0.29
53 0.3
54 0.32
55 0.35
56 0.4
57 0.42
58 0.43
59 0.43
60 0.44
61 0.43
62 0.42
63 0.35
64 0.28
65 0.25
66 0.26
67 0.23
68 0.21
69 0.17
70 0.15
71 0.15
72 0.17
73 0.17
74 0.18
75 0.25
76 0.29
77 0.37
78 0.48
79 0.55
80 0.62
81 0.65
82 0.68
83 0.67
84 0.72
85 0.73
86 0.69
87 0.68
88 0.68
89 0.65
90 0.64
91 0.61
92 0.52
93 0.5
94 0.49
95 0.5
96 0.47
97 0.5
98 0.53
99 0.61
100 0.67
101 0.67
102 0.73
103 0.74
104 0.77
105 0.8
106 0.78
107 0.78
108 0.77
109 0.78
110 0.78
111 0.79
112 0.78
113 0.81
114 0.81
115 0.8
116 0.78
117 0.73
118 0.64
119 0.61
120 0.55
121 0.45
122 0.38
123 0.29
124 0.27
125 0.27
126 0.29
127 0.24
128 0.25
129 0.27
130 0.3
131 0.35
132 0.34
133 0.36
134 0.41
135 0.41
136 0.4
137 0.39
138 0.4
139 0.36
140 0.34
141 0.29
142 0.21
143 0.19
144 0.17
145 0.15
146 0.11
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.11
154 0.17
155 0.19
156 0.21
157 0.27
158 0.36
159 0.4
160 0.47
161 0.46
162 0.42
163 0.43
164 0.43
165 0.39
166 0.34
167 0.29
168 0.23
169 0.22
170 0.19
171 0.17
172 0.13
173 0.12
174 0.09
175 0.08
176 0.06
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.11
184 0.14
185 0.2
186 0.22
187 0.25
188 0.29
189 0.32
190 0.34
191 0.38
192 0.43
193 0.41
194 0.39
195 0.38
196 0.35
197 0.32
198 0.27
199 0.21
200 0.12
201 0.1
202 0.08
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.08
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.12
218 0.14
219 0.15
220 0.16
221 0.17
222 0.22
223 0.24
224 0.24
225 0.24
226 0.24
227 0.24
228 0.23
229 0.23
230 0.17
231 0.18
232 0.17
233 0.19
234 0.23
235 0.26
236 0.26
237 0.26
238 0.28
239 0.29
240 0.28
241 0.27
242 0.23
243 0.2
244 0.22
245 0.2
246 0.17
247 0.14
248 0.13
249 0.1
250 0.09
251 0.09
252 0.06
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.05
260 0.08
261 0.13
262 0.14
263 0.14
264 0.14
265 0.14
266 0.13
267 0.15
268 0.13
269 0.11
270 0.11
271 0.12
272 0.13
273 0.14
274 0.14
275 0.13
276 0.13
277 0.11
278 0.13
279 0.15
280 0.15
281 0.16
282 0.15
283 0.14
284 0.13
285 0.12
286 0.1
287 0.07
288 0.07
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.09
299 0.1
300 0.09
301 0.14
302 0.14
303 0.17
304 0.18
305 0.18
306 0.17
307 0.17
308 0.18
309 0.19
310 0.22
311 0.21
312 0.2
313 0.2
314 0.22
315 0.21
316 0.21
317 0.18
318 0.18
319 0.19
320 0.27
321 0.28
322 0.29
323 0.3
324 0.28
325 0.27
326 0.33
327 0.36
328 0.33
329 0.39
330 0.47
331 0.53
332 0.62
333 0.64
334 0.56
335 0.54
336 0.52
337 0.49
338 0.46
339 0.43
340 0.38
341 0.37
342 0.42
343 0.37
344 0.35
345 0.29
346 0.22
347 0.18
348 0.14
349 0.13
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.07
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.04
358 0.04
359 0.06
360 0.05
361 0.06
362 0.06
363 0.07
364 0.09
365 0.09
366 0.1
367 0.11
368 0.11
369 0.15
370 0.17
371 0.17
372 0.17
373 0.17
374 0.16
375 0.14
376 0.13
377 0.1
378 0.09
379 0.07
380 0.06
381 0.05
382 0.05
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.05
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.08
396 0.07
397 0.07
398 0.09
399 0.09
400 0.09
401 0.08
402 0.08
403 0.07
404 0.07
405 0.07
406 0.06
407 0.06
408 0.05
409 0.06
410 0.06
411 0.07
412 0.09
413 0.09
414 0.09
415 0.11
416 0.13
417 0.13
418 0.16
419 0.18
420 0.17
421 0.18
422 0.18
423 0.17
424 0.16
425 0.14
426 0.12
427 0.11
428 0.12
429 0.14
430 0.15
431 0.14
432 0.15
433 0.15
434 0.15
435 0.14
436 0.13
437 0.1
438 0.11
439 0.13
440 0.12
441 0.17
442 0.17
443 0.17
444 0.19
445 0.22
446 0.22
447 0.23
448 0.26
449 0.22
450 0.21
451 0.22
452 0.2
453 0.16
454 0.13
455 0.11
456 0.08
457 0.07
458 0.07
459 0.05
460 0.05
461 0.07
462 0.07
463 0.08
464 0.08
465 0.11
466 0.12
467 0.13
468 0.13
469 0.13
470 0.16
471 0.25
472 0.29
473 0.36
474 0.39
475 0.4
476 0.4
477 0.44
478 0.42
479 0.33
480 0.29
481 0.22
482 0.2
483 0.19
484 0.19
485 0.14
486 0.13
487 0.13
488 0.11
489 0.1
490 0.09
491 0.08
492 0.08
493 0.07
494 0.08
495 0.08
496 0.08
497 0.07
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.04
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.04
508 0.06
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.07
515 0.07
516 0.09
517 0.13
518 0.16
519 0.18
520 0.19
521 0.2
522 0.23
523 0.27
524 0.23
525 0.23
526 0.22
527 0.23
528 0.24
529 0.22
530 0.21
531 0.2
532 0.23
533 0.21
534 0.2
535 0.17
536 0.16
537 0.16
538 0.15
539 0.12
540 0.09
541 0.16
542 0.18
543 0.19
544 0.19
545 0.19
546 0.18
547 0.19
548 0.2
549 0.16
550 0.17
551 0.17
552 0.21
553 0.21
554 0.2
555 0.21
556 0.21
557 0.2
558 0.19
559 0.17
560 0.17
561 0.18
562 0.2
563 0.25
564 0.33
565 0.4
566 0.45
567 0.54
568 0.53
569 0.61
570 0.62
571 0.65
572 0.65
573 0.61
574 0.58
575 0.54
576 0.53
577 0.43
578 0.41
579 0.32
580 0.21
581 0.17
582 0.13
583 0.08
584 0.07
585 0.09
586 0.08
587 0.07
588 0.1
589 0.12
590 0.16
591 0.17
592 0.19
593 0.2
594 0.21
595 0.23
596 0.23
597 0.25
598 0.22
599 0.22
600 0.25
601 0.24
602 0.23
603 0.22
604 0.2
605 0.15
606 0.13
607 0.12
608 0.1
609 0.09
610 0.08
611 0.08
612 0.08
613 0.08
614 0.09
615 0.09
616 0.06
617 0.09
618 0.12
619 0.15
620 0.16
621 0.17
622 0.17
623 0.17
624 0.17
625 0.18
626 0.17
627 0.2
628 0.2
629 0.27
630 0.34
631 0.36
632 0.42
633 0.46
634 0.52
635 0.54
636 0.63
637 0.63
638 0.59
639 0.62
640 0.58
641 0.55
642 0.47
643 0.41
644 0.37
645 0.36
646 0.37
647 0.34
648 0.38
649 0.37
650 0.38
651 0.4
652 0.36
653 0.34
654 0.34
655 0.34
656 0.3
657 0.28
658 0.26
659 0.25
660 0.25
661 0.26
662 0.29
663 0.33
664 0.37
665 0.42
666 0.49
667 0.58
668 0.67
669 0.7
670 0.73
671 0.72
672 0.76
673 0.74
674 0.74
675 0.64
676 0.54
677 0.48
678 0.38
679 0.37
680 0.29
681 0.26
682 0.25
683 0.24
684 0.24
685 0.23
686 0.23
687 0.18
688 0.21
689 0.2
690 0.15
691 0.16
692 0.15
693 0.15
694 0.16
695 0.16
696 0.14
697 0.17
698 0.19
699 0.21
700 0.24
701 0.24
702 0.24
703 0.24
704 0.24
705 0.21
706 0.2
707 0.16
708 0.15
709 0.13
710 0.11
711 0.11
712 0.11
713 0.11
714 0.1
715 0.09
716 0.08
717 0.11
718 0.18
719 0.18
720 0.19
721 0.2
722 0.2
723 0.23
724 0.26
725 0.24
726 0.22
727 0.27
728 0.26
729 0.3
730 0.29
731 0.27
732 0.28
733 0.33
734 0.37
735 0.4
736 0.44
737 0.45
738 0.53
739 0.6
740 0.62
741 0.66
742 0.68
743 0.68
744 0.7
745 0.66
746 0.58
747 0.52