Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K5VBW5

Protein Details
Accession K5VBW5    Localization Confidence Low Confidence Score 7.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-66AYHGKTKKWKEEPVKRSPLWHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 9.5, cyto_nucl 8.5, cyto 6.5, pero 4, extr 3, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047313  SMN_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG pco:PHACADRAFT_246301  -  
CDD cd22852  SMN_C  
cd22851  SMN_N  
Amino Acid Sequences MSYSNGASGADEYEDHAEEEEELTHEDIWDDSALIDAWNSATAEYEAYHGKTKKWKEEPVKRSPLWYNVPPSPSKLANSKGKSGKTSAAVAVSQAVDAADSKPVDFNTFVPSHDPSLARTSGTAQGAESLADHSQSYLPGPTGPIVGQDEAFEKALSAMYWSGYWTAAYHYHGHYQNQGGPSQADGEAEDEANDEVDEVDAMMDDLIETQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.12
4 0.12
5 0.11
6 0.12
7 0.11
8 0.09
9 0.1
10 0.1
11 0.1
12 0.1
13 0.1
14 0.09
15 0.09
16 0.08
17 0.07
18 0.06
19 0.07
20 0.07
21 0.07
22 0.06
23 0.05
24 0.05
25 0.06
26 0.07
27 0.06
28 0.07
29 0.07
30 0.08
31 0.08
32 0.09
33 0.1
34 0.12
35 0.19
36 0.19
37 0.22
38 0.3
39 0.36
40 0.45
41 0.5
42 0.58
43 0.62
44 0.72
45 0.77
46 0.79
47 0.82
48 0.72
49 0.7
50 0.64
51 0.6
52 0.55
53 0.51
54 0.47
55 0.41
56 0.44
57 0.4
58 0.39
59 0.36
60 0.31
61 0.28
62 0.27
63 0.31
64 0.36
65 0.38
66 0.43
67 0.44
68 0.45
69 0.45
70 0.42
71 0.39
72 0.32
73 0.31
74 0.24
75 0.2
76 0.17
77 0.15
78 0.14
79 0.11
80 0.08
81 0.06
82 0.05
83 0.04
84 0.05
85 0.05
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.07
90 0.07
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.12
95 0.12
96 0.13
97 0.14
98 0.15
99 0.15
100 0.16
101 0.16
102 0.13
103 0.16
104 0.16
105 0.14
106 0.13
107 0.15
108 0.16
109 0.17
110 0.15
111 0.11
112 0.12
113 0.12
114 0.12
115 0.1
116 0.07
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.1
133 0.11
134 0.1
135 0.1
136 0.11
137 0.12
138 0.12
139 0.1
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.07
153 0.1
154 0.11
155 0.14
156 0.16
157 0.18
158 0.25
159 0.28
160 0.29
161 0.31
162 0.32
163 0.34
164 0.33
165 0.31
166 0.26
167 0.23
168 0.22
169 0.2
170 0.17
171 0.13
172 0.11
173 0.12
174 0.12
175 0.11
176 0.1
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.08
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.05
186 0.05
187 0.04
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.04