Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K5VXH3

Protein Details
Accession K5VXH3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-57LRLASPKLRRKSTSRPPPNKRARTSEPPSSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-49SPKLRRKSTSRPPPNKRAR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11, mito 4, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018465  Scm3/HJURP  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042393  F:histone binding  
KEGG pco:PHACADRAFT_102786  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10384  Scm3  
Amino Acid Sequences MSLSSDKQPVLPRNALITPSVSPPPSLRLASPKLRRKSTSRPPPNKRARTSEPPSSPDPSGSHTPTDTSTTSPVVNPTRDEAWRASSQRLLSVWSQLAERYNVPLDQDDIVDLRTVKLVKDRGITRRLKKGYRIGYFGDPTPDDADASSEDDRDGEDEIDSLPRPEPKVPIKLEMEKTNRVLPPFTEMNPADADDLKAFLEEEEQRRAIGGVDDDPDEDEVAENVATDFEDFVELGTDEEDEHSDWVTERVVRVDSRRTPIRRTPAPRPYATAPNSWPSDVSVRSIATANTSATDTFAKSKYHRPDNTFSSIFTRHTFVAPKIIVTSATCSSAIFLSFPTQSQYFKYIRRGRGRYLRAPFVPFQDCYTTASVPKHTVANSTFIFSQQQHARA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.44
3 0.37
4 0.32
5 0.26
6 0.27
7 0.29
8 0.25
9 0.24
10 0.24
11 0.27
12 0.29
13 0.29
14 0.27
15 0.32
16 0.38
17 0.47
18 0.55
19 0.6
20 0.64
21 0.7
22 0.73
23 0.73
24 0.76
25 0.78
26 0.79
27 0.81
28 0.83
29 0.85
30 0.91
31 0.94
32 0.93
33 0.89
34 0.87
35 0.84
36 0.83
37 0.81
38 0.8
39 0.75
40 0.7
41 0.67
42 0.62
43 0.54
44 0.48
45 0.42
46 0.37
47 0.38
48 0.36
49 0.34
50 0.3
51 0.3
52 0.28
53 0.31
54 0.26
55 0.21
56 0.21
57 0.21
58 0.21
59 0.2
60 0.25
61 0.26
62 0.27
63 0.26
64 0.27
65 0.29
66 0.29
67 0.31
68 0.27
69 0.28
70 0.33
71 0.34
72 0.33
73 0.32
74 0.32
75 0.32
76 0.3
77 0.28
78 0.22
79 0.24
80 0.22
81 0.19
82 0.19
83 0.17
84 0.19
85 0.18
86 0.18
87 0.16
88 0.17
89 0.16
90 0.17
91 0.16
92 0.16
93 0.14
94 0.14
95 0.12
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.08
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.16
105 0.19
106 0.2
107 0.26
108 0.31
109 0.35
110 0.44
111 0.52
112 0.52
113 0.59
114 0.62
115 0.61
116 0.62
117 0.65
118 0.65
119 0.6
120 0.58
121 0.51
122 0.5
123 0.47
124 0.41
125 0.35
126 0.26
127 0.23
128 0.21
129 0.18
130 0.13
131 0.11
132 0.12
133 0.09
134 0.12
135 0.11
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.1
151 0.12
152 0.13
153 0.18
154 0.22
155 0.29
156 0.3
157 0.34
158 0.36
159 0.4
160 0.42
161 0.44
162 0.44
163 0.39
164 0.39
165 0.39
166 0.37
167 0.32
168 0.29
169 0.21
170 0.22
171 0.21
172 0.2
173 0.21
174 0.2
175 0.21
176 0.2
177 0.2
178 0.16
179 0.14
180 0.14
181 0.08
182 0.08
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.07
188 0.1
189 0.12
190 0.14
191 0.15
192 0.14
193 0.15
194 0.15
195 0.12
196 0.1
197 0.09
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.06
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.03
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.05
224 0.05
225 0.04
226 0.05
227 0.06
228 0.05
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.09
238 0.11
239 0.12
240 0.15
241 0.22
242 0.26
243 0.31
244 0.39
245 0.41
246 0.46
247 0.51
248 0.57
249 0.59
250 0.61
251 0.65
252 0.66
253 0.69
254 0.64
255 0.62
256 0.58
257 0.57
258 0.53
259 0.47
260 0.4
261 0.4
262 0.4
263 0.35
264 0.31
265 0.24
266 0.26
267 0.22
268 0.22
269 0.18
270 0.16
271 0.17
272 0.18
273 0.16
274 0.14
275 0.15
276 0.13
277 0.12
278 0.12
279 0.11
280 0.12
281 0.13
282 0.12
283 0.14
284 0.17
285 0.2
286 0.22
287 0.31
288 0.39
289 0.48
290 0.53
291 0.56
292 0.61
293 0.63
294 0.68
295 0.6
296 0.52
297 0.47
298 0.43
299 0.38
300 0.33
301 0.29
302 0.23
303 0.25
304 0.27
305 0.23
306 0.28
307 0.27
308 0.25
309 0.24
310 0.23
311 0.21
312 0.19
313 0.22
314 0.15
315 0.17
316 0.16
317 0.15
318 0.15
319 0.15
320 0.15
321 0.11
322 0.1
323 0.12
324 0.12
325 0.13
326 0.16
327 0.17
328 0.18
329 0.2
330 0.26
331 0.27
332 0.32
333 0.42
334 0.47
335 0.56
336 0.65
337 0.67
338 0.71
339 0.76
340 0.79
341 0.78
342 0.77
343 0.76
344 0.69
345 0.69
346 0.63
347 0.59
348 0.55
349 0.46
350 0.42
351 0.39
352 0.36
353 0.34
354 0.34
355 0.3
356 0.3
357 0.33
358 0.33
359 0.31
360 0.32
361 0.33
362 0.3
363 0.34
364 0.32
365 0.34
366 0.31
367 0.31
368 0.3
369 0.27
370 0.31
371 0.25
372 0.32