Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K5VAT2

Protein Details
Accession K5VAT2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
206-228VEIGHRKAKQLEKELKKSRHKPYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-100RGGAGGKLAKGGKRT
210-227HRKAKQLEKELKKSRHKP
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10, pero 6, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034215  RBM42_RRM  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pco:PHACADRAFT_250802  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12383  RRM_RBM42  
Amino Acid Sequences MDSQSSQGYYQGYQGYSGYQGYQAASSSSQSDVNPYHQPYQGPMYPIPGASSSAHHAPVPANAYEYDVGILAQQSVYVPGAMIDKRGGAGGKLAKGGKRTTVLRKGAGKVWEDQTLLEWNPSWFRLFVGDLSNDVSDDVLANAFNKYTSFQKARVIRDRLSGKAKYGFVAFSDPEDFLKAWKEMDGKYVGNRPIKLKKADNSLNPVEIGHRKAKQLEKELKKSRHKPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.18
4 0.18
5 0.15
6 0.12
7 0.13
8 0.12
9 0.13
10 0.12
11 0.12
12 0.12
13 0.12
14 0.12
15 0.13
16 0.14
17 0.14
18 0.18
19 0.18
20 0.22
21 0.27
22 0.29
23 0.32
24 0.32
25 0.33
26 0.32
27 0.36
28 0.35
29 0.32
30 0.29
31 0.28
32 0.27
33 0.26
34 0.24
35 0.19
36 0.18
37 0.15
38 0.17
39 0.16
40 0.17
41 0.18
42 0.17
43 0.17
44 0.15
45 0.17
46 0.18
47 0.15
48 0.15
49 0.14
50 0.16
51 0.15
52 0.14
53 0.12
54 0.08
55 0.08
56 0.07
57 0.07
58 0.05
59 0.04
60 0.04
61 0.04
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.04
66 0.05
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.09
74 0.08
75 0.06
76 0.09
77 0.11
78 0.12
79 0.14
80 0.16
81 0.16
82 0.19
83 0.2
84 0.19
85 0.2
86 0.24
87 0.29
88 0.36
89 0.37
90 0.39
91 0.42
92 0.41
93 0.41
94 0.4
95 0.34
96 0.28
97 0.28
98 0.25
99 0.22
100 0.2
101 0.17
102 0.16
103 0.15
104 0.12
105 0.1
106 0.08
107 0.09
108 0.1
109 0.09
110 0.07
111 0.07
112 0.09
113 0.09
114 0.1
115 0.11
116 0.11
117 0.1
118 0.12
119 0.11
120 0.1
121 0.09
122 0.08
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.07
134 0.09
135 0.16
136 0.18
137 0.2
138 0.28
139 0.34
140 0.41
141 0.49
142 0.51
143 0.46
144 0.52
145 0.53
146 0.51
147 0.51
148 0.44
149 0.39
150 0.39
151 0.38
152 0.31
153 0.29
154 0.24
155 0.19
156 0.21
157 0.18
158 0.14
159 0.15
160 0.15
161 0.14
162 0.16
163 0.15
164 0.12
165 0.15
166 0.14
167 0.13
168 0.16
169 0.18
170 0.16
171 0.21
172 0.24
173 0.22
174 0.25
175 0.31
176 0.35
177 0.37
178 0.4
179 0.42
180 0.47
181 0.53
182 0.56
183 0.57
184 0.57
185 0.61
186 0.67
187 0.66
188 0.65
189 0.61
190 0.56
191 0.49
192 0.43
193 0.38
194 0.35
195 0.33
196 0.33
197 0.33
198 0.35
199 0.42
200 0.5
201 0.53
202 0.59
203 0.65
204 0.67
205 0.75
206 0.82
207 0.84
208 0.87