Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0TVT2

Protein Details
Accession Q0TVT2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-28SESGKPHANKVNAKRRWQKGVEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 6, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029012  Helix_hairpin_bin_sf  
IPR009360  Isy1  
IPR037200  Isy1_sf  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0071014  C:post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0071020  C:post-spliceosomal complex  
GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0000350  P:generation of catalytic spliceosome for second transesterification step  
GO:0000389  P:mRNA 3'-splice site recognition  
KEGG pno:SNOG_16410  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06246  Isy1  
Amino Acid Sequences MHAGKVSESGKPHANKVNAKRRWQKGVETPNFPERVGLPSAPLLNHTATAHTTPNQRRDLAQQRLHLKTTSPQHPNTTAIMARNSEKAHSMLFRFRAAQAAEAGIIDISRTRRPKLITSVTSIPVCEKWRGQVLKEISRKVTKIQDEALSDYQIRDLNDEINKLMREKHMWESQIRNQGGPNYMRGGRVLDEDGKEVPGGGKGYRYFGRAKELPGVKELFERQQRPEDDDAIKQGREKRSELRQRVDAGYYGYNLDEEDGTLLAYEKAKEKEAWDDFMQLGDDLGESKGQKEWVELPGDAGDGVRWRVPTLEEVNNELVERRRRKLLEKLGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.55
3 0.63
4 0.69
5 0.69
6 0.77
7 0.81
8 0.81
9 0.83
10 0.78
11 0.76
12 0.76
13 0.79
14 0.76
15 0.73
16 0.7
17 0.69
18 0.65
19 0.57
20 0.48
21 0.38
22 0.34
23 0.31
24 0.26
25 0.2
26 0.21
27 0.23
28 0.21
29 0.22
30 0.2
31 0.17
32 0.19
33 0.17
34 0.16
35 0.16
36 0.18
37 0.19
38 0.21
39 0.29
40 0.34
41 0.42
42 0.44
43 0.44
44 0.43
45 0.5
46 0.57
47 0.57
48 0.56
49 0.55
50 0.59
51 0.62
52 0.62
53 0.53
54 0.44
55 0.41
56 0.44
57 0.46
58 0.44
59 0.44
60 0.47
61 0.49
62 0.5
63 0.44
64 0.39
65 0.32
66 0.29
67 0.28
68 0.25
69 0.24
70 0.25
71 0.24
72 0.21
73 0.21
74 0.19
75 0.19
76 0.2
77 0.21
78 0.23
79 0.24
80 0.25
81 0.25
82 0.24
83 0.27
84 0.24
85 0.22
86 0.17
87 0.15
88 0.14
89 0.12
90 0.12
91 0.07
92 0.06
93 0.05
94 0.06
95 0.08
96 0.14
97 0.17
98 0.18
99 0.23
100 0.26
101 0.31
102 0.37
103 0.44
104 0.4
105 0.43
106 0.45
107 0.44
108 0.41
109 0.36
110 0.29
111 0.24
112 0.24
113 0.2
114 0.17
115 0.17
116 0.24
117 0.26
118 0.25
119 0.29
120 0.32
121 0.39
122 0.43
123 0.43
124 0.39
125 0.4
126 0.4
127 0.37
128 0.38
129 0.32
130 0.29
131 0.3
132 0.29
133 0.28
134 0.31
135 0.28
136 0.22
137 0.2
138 0.17
139 0.16
140 0.15
141 0.14
142 0.11
143 0.1
144 0.13
145 0.14
146 0.14
147 0.13
148 0.13
149 0.13
150 0.13
151 0.14
152 0.12
153 0.13
154 0.16
155 0.2
156 0.22
157 0.24
158 0.26
159 0.3
160 0.34
161 0.41
162 0.38
163 0.33
164 0.3
165 0.31
166 0.32
167 0.27
168 0.23
169 0.17
170 0.18
171 0.18
172 0.17
173 0.16
174 0.13
175 0.13
176 0.14
177 0.13
178 0.13
179 0.14
180 0.13
181 0.13
182 0.11
183 0.1
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.1
189 0.1
190 0.14
191 0.15
192 0.18
193 0.19
194 0.19
195 0.26
196 0.25
197 0.26
198 0.31
199 0.33
200 0.31
201 0.32
202 0.32
203 0.25
204 0.26
205 0.26
206 0.25
207 0.29
208 0.31
209 0.31
210 0.38
211 0.39
212 0.41
213 0.41
214 0.39
215 0.34
216 0.33
217 0.35
218 0.3
219 0.29
220 0.28
221 0.32
222 0.34
223 0.35
224 0.37
225 0.38
226 0.47
227 0.57
228 0.6
229 0.6
230 0.58
231 0.58
232 0.57
233 0.52
234 0.42
235 0.35
236 0.28
237 0.23
238 0.19
239 0.15
240 0.13
241 0.11
242 0.11
243 0.08
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.08
252 0.09
253 0.14
254 0.16
255 0.18
256 0.2
257 0.21
258 0.29
259 0.31
260 0.35
261 0.31
262 0.31
263 0.29
264 0.28
265 0.27
266 0.17
267 0.15
268 0.1
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.09
273 0.09
274 0.1
275 0.12
276 0.14
277 0.15
278 0.17
279 0.2
280 0.22
281 0.26
282 0.24
283 0.24
284 0.22
285 0.22
286 0.19
287 0.15
288 0.12
289 0.1
290 0.12
291 0.13
292 0.13
293 0.13
294 0.15
295 0.16
296 0.21
297 0.25
298 0.3
299 0.3
300 0.34
301 0.36
302 0.35
303 0.34
304 0.31
305 0.32
306 0.35
307 0.39
308 0.39
309 0.46
310 0.49
311 0.56
312 0.64