Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R736

Protein Details
Accession C4R736    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-33SSKSAAKASKGEKKSKKQESSSSESSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-24KSAAKASKGEKKSKK
315-332GRGGRGGRGGRGGFRGGR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG ppa:PAS_chr4_0185  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12447  RRM1_gar2  
Amino Acid Sequences MAKSSKVSSKSAAKASKGEKKSKKQESSSSESSSGSSSESSGSESESEEESVKESKKEANSSESESESESESEAESDKKEEAAESGSESESESESESEKEDEKSAKRSAEESEEEPAKKAKTEEITTLFVGRLSWSIDDEWLKKEFEHIGGVVGARVMMERATGRSRGYGYVDFDNKASAEKALEEMQGKEIDGRPINVDMSNSKPAAPAARNNDRASQYGDKRSPPSDTLFLGNLSFQADRDTLFELFSKHGNVTSVRIPTHPETEQPKGFGYVQFSSVDEATGALEALNGEYVDNRPIRLDYSTPRDPSASGGRGGRGGRGGRGGFRGGRGGFSGDRSFGSGANSAPVNSGFQGQKKTFN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.63
3 0.66
4 0.65
5 0.69
6 0.71
7 0.75
8 0.83
9 0.86
10 0.86
11 0.84
12 0.86
13 0.84
14 0.82
15 0.78
16 0.72
17 0.63
18 0.54
19 0.47
20 0.38
21 0.3
22 0.23
23 0.17
24 0.12
25 0.12
26 0.12
27 0.13
28 0.12
29 0.13
30 0.12
31 0.13
32 0.14
33 0.14
34 0.15
35 0.13
36 0.13
37 0.14
38 0.18
39 0.19
40 0.18
41 0.19
42 0.24
43 0.29
44 0.34
45 0.35
46 0.37
47 0.38
48 0.43
49 0.44
50 0.39
51 0.34
52 0.3
53 0.28
54 0.23
55 0.2
56 0.15
57 0.12
58 0.11
59 0.11
60 0.1
61 0.11
62 0.1
63 0.11
64 0.11
65 0.11
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.13
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.12
77 0.1
78 0.1
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.1
83 0.11
84 0.12
85 0.13
86 0.14
87 0.15
88 0.2
89 0.21
90 0.26
91 0.28
92 0.29
93 0.29
94 0.29
95 0.29
96 0.3
97 0.31
98 0.27
99 0.28
100 0.3
101 0.29
102 0.29
103 0.29
104 0.23
105 0.21
106 0.21
107 0.21
108 0.22
109 0.24
110 0.28
111 0.29
112 0.31
113 0.3
114 0.3
115 0.25
116 0.19
117 0.17
118 0.12
119 0.09
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.09
124 0.11
125 0.13
126 0.14
127 0.15
128 0.16
129 0.16
130 0.15
131 0.17
132 0.16
133 0.15
134 0.14
135 0.12
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.09
140 0.07
141 0.06
142 0.04
143 0.04
144 0.03
145 0.03
146 0.04
147 0.04
148 0.07
149 0.09
150 0.1
151 0.1
152 0.12
153 0.13
154 0.14
155 0.16
156 0.16
157 0.16
158 0.19
159 0.21
160 0.19
161 0.18
162 0.18
163 0.15
164 0.13
165 0.11
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.13
180 0.12
181 0.13
182 0.12
183 0.13
184 0.13
185 0.12
186 0.12
187 0.1
188 0.14
189 0.16
190 0.15
191 0.15
192 0.14
193 0.15
194 0.18
195 0.18
196 0.2
197 0.25
198 0.32
199 0.37
200 0.38
201 0.43
202 0.4
203 0.4
204 0.4
205 0.39
206 0.36
207 0.39
208 0.41
209 0.39
210 0.4
211 0.4
212 0.37
213 0.32
214 0.32
215 0.26
216 0.25
217 0.24
218 0.22
219 0.2
220 0.18
221 0.15
222 0.12
223 0.11
224 0.1
225 0.08
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.11
230 0.13
231 0.11
232 0.12
233 0.13
234 0.12
235 0.13
236 0.14
237 0.14
238 0.11
239 0.12
240 0.13
241 0.14
242 0.15
243 0.18
244 0.2
245 0.2
246 0.2
247 0.24
248 0.25
249 0.29
250 0.26
251 0.28
252 0.3
253 0.36
254 0.37
255 0.34
256 0.33
257 0.31
258 0.31
259 0.28
260 0.27
261 0.21
262 0.22
263 0.21
264 0.2
265 0.19
266 0.18
267 0.16
268 0.11
269 0.09
270 0.08
271 0.07
272 0.06
273 0.04
274 0.05
275 0.04
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.07
282 0.12
283 0.13
284 0.13
285 0.14
286 0.15
287 0.17
288 0.18
289 0.22
290 0.23
291 0.31
292 0.37
293 0.38
294 0.39
295 0.38
296 0.35
297 0.36
298 0.38
299 0.32
300 0.29
301 0.29
302 0.29
303 0.32
304 0.32
305 0.29
306 0.26
307 0.25
308 0.24
309 0.28
310 0.29
311 0.27
312 0.3
313 0.32
314 0.28
315 0.28
316 0.32
317 0.26
318 0.27
319 0.25
320 0.26
321 0.23
322 0.26
323 0.27
324 0.22
325 0.22
326 0.23
327 0.22
328 0.19
329 0.21
330 0.18
331 0.16
332 0.18
333 0.18
334 0.16
335 0.17
336 0.17
337 0.16
338 0.15
339 0.2
340 0.21
341 0.25
342 0.34