Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G2RI85

Protein Details
Accession G2RI85    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
307-330APPPPPPPPKTRQQREPEPKGRATHydrophilic
339-362KDVAIHPPKRPLRKTTPKAATPPPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
220-240AARPRATEPRKPGASRSAKRK
312-356PPPPKTRQQREPEPKGRATAGGHAAKGKDVAIHPPKRPLRKTTPK
Subcellular Location(s) cyto_mito 8.166, mito 8, cyto 8, cyto_nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010585  DNA_repair_prot_XRCC4  
IPR014751  XRCC4-like_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
KEGG ttt:THITE_2124064  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06632  XRCC4  
Amino Acid Sequences MASSHIIRVPRTDEEGAFVLGEVIPSGSKPLNVKFVATEGEEPYVVKLRHDRIGDLRAASSPCSPEEWERILKALLLGGEQMEGIEAGAEANVGKSLTITIRRRVAGINQRLGALTLNHKADEAIQLFDWCGATALEREKFRETLATEKAKVSDLEARIAELRNQLDELTEAKKAREAELLEKFCGLLNEKKVKIREQQRLLNTAQVDPSRLAAARAAQAARPRATEPRKPGASRSAKRKALEDASGGGSSSDSDDGFEKVNAGADKMDVDPKLPEPPEERNESPESEDRQTTDEDATGSEPEDDEAPPPPPPPPKTRQQREPEPKGRATAGGHAAKGKDVAIHPPKRPLRKTTPKAATPPPAAGSETESDDEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.33
3 0.29
4 0.24
5 0.2
6 0.15
7 0.12
8 0.12
9 0.08
10 0.06
11 0.06
12 0.06
13 0.09
14 0.09
15 0.12
16 0.16
17 0.2
18 0.27
19 0.28
20 0.29
21 0.27
22 0.28
23 0.27
24 0.26
25 0.25
26 0.19
27 0.2
28 0.19
29 0.18
30 0.19
31 0.23
32 0.21
33 0.21
34 0.26
35 0.29
36 0.35
37 0.36
38 0.37
39 0.36
40 0.42
41 0.42
42 0.36
43 0.33
44 0.3
45 0.3
46 0.28
47 0.25
48 0.21
49 0.19
50 0.2
51 0.22
52 0.22
53 0.27
54 0.3
55 0.31
56 0.29
57 0.3
58 0.28
59 0.26
60 0.22
61 0.18
62 0.13
63 0.1
64 0.09
65 0.08
66 0.08
67 0.07
68 0.06
69 0.05
70 0.04
71 0.04
72 0.03
73 0.03
74 0.03
75 0.03
76 0.03
77 0.03
78 0.03
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.05
84 0.09
85 0.18
86 0.21
87 0.26
88 0.31
89 0.31
90 0.32
91 0.33
92 0.38
93 0.4
94 0.44
95 0.43
96 0.39
97 0.39
98 0.38
99 0.37
100 0.29
101 0.21
102 0.17
103 0.17
104 0.17
105 0.17
106 0.17
107 0.17
108 0.16
109 0.2
110 0.17
111 0.13
112 0.13
113 0.13
114 0.13
115 0.13
116 0.13
117 0.07
118 0.07
119 0.05
120 0.06
121 0.08
122 0.12
123 0.15
124 0.16
125 0.18
126 0.2
127 0.21
128 0.2
129 0.22
130 0.19
131 0.22
132 0.28
133 0.29
134 0.28
135 0.29
136 0.29
137 0.26
138 0.25
139 0.21
140 0.21
141 0.18
142 0.19
143 0.18
144 0.18
145 0.18
146 0.18
147 0.18
148 0.15
149 0.14
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.1
154 0.11
155 0.11
156 0.09
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.15
161 0.15
162 0.15
163 0.17
164 0.17
165 0.2
166 0.27
167 0.29
168 0.26
169 0.26
170 0.24
171 0.21
172 0.2
173 0.17
174 0.13
175 0.18
176 0.24
177 0.25
178 0.29
179 0.31
180 0.34
181 0.39
182 0.45
183 0.48
184 0.48
185 0.53
186 0.52
187 0.55
188 0.51
189 0.47
190 0.38
191 0.3
192 0.26
193 0.2
194 0.18
195 0.14
196 0.14
197 0.12
198 0.11
199 0.1
200 0.08
201 0.09
202 0.1
203 0.11
204 0.11
205 0.12
206 0.15
207 0.19
208 0.19
209 0.19
210 0.19
211 0.26
212 0.32
213 0.37
214 0.4
215 0.45
216 0.49
217 0.48
218 0.5
219 0.51
220 0.56
221 0.56
222 0.59
223 0.6
224 0.6
225 0.6
226 0.6
227 0.55
228 0.48
229 0.44
230 0.36
231 0.28
232 0.25
233 0.24
234 0.22
235 0.16
236 0.12
237 0.1
238 0.09
239 0.08
240 0.05
241 0.06
242 0.07
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.12
249 0.11
250 0.11
251 0.1
252 0.09
253 0.11
254 0.11
255 0.14
256 0.11
257 0.12
258 0.13
259 0.14
260 0.2
261 0.19
262 0.21
263 0.21
264 0.29
265 0.33
266 0.38
267 0.38
268 0.37
269 0.4
270 0.39
271 0.39
272 0.38
273 0.38
274 0.34
275 0.34
276 0.3
277 0.29
278 0.29
279 0.26
280 0.21
281 0.17
282 0.14
283 0.14
284 0.14
285 0.12
286 0.12
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.1
291 0.09
292 0.09
293 0.11
294 0.12
295 0.13
296 0.14
297 0.18
298 0.25
299 0.3
300 0.37
301 0.41
302 0.5
303 0.6
304 0.69
305 0.74
306 0.76
307 0.82
308 0.85
309 0.9
310 0.89
311 0.85
312 0.78
313 0.71
314 0.63
315 0.56
316 0.47
317 0.43
318 0.42
319 0.38
320 0.36
321 0.35
322 0.34
323 0.31
324 0.3
325 0.23
326 0.19
327 0.17
328 0.26
329 0.33
330 0.4
331 0.43
332 0.52
333 0.6
334 0.66
335 0.71
336 0.7
337 0.71
338 0.76
339 0.8
340 0.81
341 0.82
342 0.8
343 0.81
344 0.8
345 0.77
346 0.7
347 0.66
348 0.58
349 0.5
350 0.44
351 0.38
352 0.34
353 0.27
354 0.27