Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G2RCY5

Protein Details
Accession G2RCY5    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
126-147AGAKRVTKKTEQSRCQNTRKGAHydrophilic
154-177AETNLPKKSGRKPRSKKDSAVLAQHydrophilic
325-344VSPSKPKAAKKKPRTITELAHydrophilic
386-415KTAKMGRRPAKPKPKPAKTREEKRRPLLLSBasic
687-708KQTASPSRTRGRPRKNSAMSTSHydrophilic
733-753EAPQAEKRPRGRPKKATAAAAHydrophilic
757-779SKAKAPASPKRSKSPPKPAAPAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
160-170KKSGRKPRSKK
329-338KPKAAKKKPR
385-411AKTAKMGRRPAKPKPKPAKTREEKRRP
718-723KRGRKK
738-790EKRPRGRPKKATAAAAANQSKAKAPASPKRSKSPPKPAAPAPATPKRRKAPAK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG ttt:THITE_2120630  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MAAAGPRPCSSSLSRMQPRESLLVISSSPEFPSICDLLPTKKPALRSGSNGAPIPRDAPAGFTSAAQVWQSPRVSNEHINVSSDPNALRSAAPAKPMVDTAAEVSFEPAVAAVDAGLRMEAGSKPAGAKRVTKKTEQSRCQNTRKGALTEVSAAETNLPKKSGRKPRSKKDSAVLAQSTLPQGKVTKPRAECGQPKRKAETVSRHFAPQISAPEAVPKLMADPIEDEVVILEPAMKRRLDWTPPRESLSTPRVVDTPAAKELPSSASPVRVNVFKNLQDTYGRPSETAILTEEDDSTGATTDVLGKRKLIEMVTTGGNRPETPEVSPSKPKAAKKKPRTITELATAAYRQPDEHTVLSDKPKQDTLLGYLDVTDGETAAAAKSEAKTAKMGRRPAKPKPKPAKTREEKRRPLLLSPASAMRQVARQDFVFGTASQLAAEDDPELLRALHEAMMVSNQADSDPFADSSPVKGRLALRRKPGSGLWAAGARGEDGDLIDLEVLDLTGSSPLPRDYSLPQAPSPSHKAAAQGPSTKETCIEIGSSDTSLDLSASPPFLHVRSSSPSVAPAGARISTASEGDKSSDHGQKHPPSAPREADFEPPPSNQEQHQFLLSQPKSLGQEELEPQPKPNFELYTDARLAKEVASYGFKPVKKRTAMIALLEQCWSSQHTRGLASRSAQAPMSTSSTKQTASPSRTRGRPRKNSAMSTSDVAEAPAPTKRGRKKSSSVTESEVEAPQAEKRPRGRPKKATAAAAANQSKAKAPASPKRSKSPPKPAAPAPATPKRRKAPAKEVVEIADSESDSDSDDPFASSPITSPDKQDDVFSPPAVDLSVTEDTETSLVASPTDQQVSLFRYITQAVVTAPRAKDPANPSWHEKMLMYDPIILEDLTAWLNSGQLDRVGYDGEVAPGDVKKWCESKSVCCLWRVSLNGKERKRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.56
3 0.59
4 0.58
5 0.58
6 0.54
7 0.47
8 0.38
9 0.31
10 0.28
11 0.24
12 0.23
13 0.21
14 0.18
15 0.17
16 0.17
17 0.16
18 0.14
19 0.2
20 0.19
21 0.17
22 0.2
23 0.22
24 0.26
25 0.32
26 0.36
27 0.37
28 0.37
29 0.4
30 0.44
31 0.5
32 0.49
33 0.49
34 0.51
35 0.52
36 0.54
37 0.54
38 0.49
39 0.43
40 0.39
41 0.34
42 0.28
43 0.25
44 0.2
45 0.21
46 0.2
47 0.21
48 0.2
49 0.18
50 0.19
51 0.17
52 0.19
53 0.15
54 0.17
55 0.16
56 0.22
57 0.24
58 0.23
59 0.24
60 0.28
61 0.34
62 0.37
63 0.39
64 0.4
65 0.4
66 0.41
67 0.4
68 0.38
69 0.35
70 0.32
71 0.28
72 0.21
73 0.21
74 0.19
75 0.18
76 0.18
77 0.2
78 0.2
79 0.22
80 0.23
81 0.23
82 0.23
83 0.24
84 0.21
85 0.17
86 0.16
87 0.15
88 0.15
89 0.14
90 0.13
91 0.14
92 0.12
93 0.11
94 0.1
95 0.08
96 0.06
97 0.06
98 0.05
99 0.04
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.04
105 0.04
106 0.06
107 0.07
108 0.08
109 0.09
110 0.1
111 0.13
112 0.16
113 0.22
114 0.23
115 0.31
116 0.39
117 0.49
118 0.52
119 0.56
120 0.63
121 0.69
122 0.77
123 0.77
124 0.78
125 0.78
126 0.84
127 0.86
128 0.84
129 0.78
130 0.76
131 0.72
132 0.65
133 0.57
134 0.49
135 0.42
136 0.37
137 0.33
138 0.27
139 0.21
140 0.18
141 0.17
142 0.19
143 0.2
144 0.19
145 0.2
146 0.2
147 0.26
148 0.37
149 0.45
150 0.51
151 0.6
152 0.69
153 0.78
154 0.87
155 0.88
156 0.84
157 0.8
158 0.81
159 0.74
160 0.71
161 0.61
162 0.52
163 0.45
164 0.41
165 0.36
166 0.27
167 0.23
168 0.17
169 0.17
170 0.23
171 0.31
172 0.36
173 0.41
174 0.42
175 0.46
176 0.51
177 0.57
178 0.6
179 0.61
180 0.65
181 0.65
182 0.68
183 0.69
184 0.67
185 0.64
186 0.64
187 0.64
188 0.61
189 0.62
190 0.58
191 0.55
192 0.51
193 0.46
194 0.4
195 0.34
196 0.31
197 0.25
198 0.24
199 0.22
200 0.26
201 0.25
202 0.23
203 0.18
204 0.14
205 0.12
206 0.13
207 0.13
208 0.09
209 0.1
210 0.11
211 0.12
212 0.12
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.06
218 0.07
219 0.08
220 0.11
221 0.14
222 0.14
223 0.14
224 0.18
225 0.24
226 0.31
227 0.4
228 0.43
229 0.49
230 0.52
231 0.56
232 0.53
233 0.49
234 0.47
235 0.44
236 0.43
237 0.35
238 0.33
239 0.3
240 0.3
241 0.31
242 0.26
243 0.24
244 0.21
245 0.21
246 0.19
247 0.19
248 0.19
249 0.2
250 0.18
251 0.18
252 0.15
253 0.2
254 0.21
255 0.22
256 0.23
257 0.23
258 0.24
259 0.25
260 0.29
261 0.26
262 0.28
263 0.27
264 0.27
265 0.25
266 0.25
267 0.26
268 0.26
269 0.24
270 0.21
271 0.21
272 0.22
273 0.2
274 0.2
275 0.16
276 0.13
277 0.13
278 0.14
279 0.13
280 0.1
281 0.09
282 0.08
283 0.07
284 0.06
285 0.05
286 0.04
287 0.04
288 0.1
289 0.14
290 0.17
291 0.17
292 0.17
293 0.18
294 0.2
295 0.22
296 0.16
297 0.14
298 0.13
299 0.15
300 0.18
301 0.17
302 0.16
303 0.16
304 0.16
305 0.15
306 0.16
307 0.16
308 0.15
309 0.15
310 0.2
311 0.23
312 0.27
313 0.33
314 0.32
315 0.37
316 0.42
317 0.46
318 0.52
319 0.59
320 0.65
321 0.7
322 0.79
323 0.78
324 0.8
325 0.81
326 0.75
327 0.67
328 0.61
329 0.53
330 0.43
331 0.35
332 0.29
333 0.22
334 0.19
335 0.15
336 0.11
337 0.1
338 0.13
339 0.15
340 0.15
341 0.16
342 0.17
343 0.2
344 0.24
345 0.28
346 0.26
347 0.25
348 0.26
349 0.24
350 0.23
351 0.22
352 0.2
353 0.18
354 0.17
355 0.15
356 0.14
357 0.13
358 0.12
359 0.11
360 0.07
361 0.04
362 0.03
363 0.03
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.05
369 0.05
370 0.09
371 0.1
372 0.1
373 0.14
374 0.18
375 0.26
376 0.3
377 0.38
378 0.41
379 0.5
380 0.56
381 0.63
382 0.7
383 0.7
384 0.75
385 0.78
386 0.82
387 0.83
388 0.84
389 0.85
390 0.83
391 0.87
392 0.87
393 0.87
394 0.85
395 0.8
396 0.81
397 0.71
398 0.63
399 0.6
400 0.51
401 0.42
402 0.35
403 0.31
404 0.24
405 0.23
406 0.2
407 0.13
408 0.14
409 0.15
410 0.15
411 0.14
412 0.13
413 0.15
414 0.15
415 0.16
416 0.14
417 0.11
418 0.12
419 0.1
420 0.1
421 0.08
422 0.08
423 0.07
424 0.05
425 0.06
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.05
430 0.05
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.06
441 0.05
442 0.05
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.05
448 0.05
449 0.06
450 0.06
451 0.07
452 0.07
453 0.09
454 0.13
455 0.14
456 0.13
457 0.15
458 0.19
459 0.27
460 0.35
461 0.38
462 0.42
463 0.44
464 0.45
465 0.44
466 0.42
467 0.36
468 0.29
469 0.25
470 0.18
471 0.15
472 0.14
473 0.13
474 0.12
475 0.08
476 0.07
477 0.06
478 0.05
479 0.04
480 0.04
481 0.03
482 0.03
483 0.03
484 0.03
485 0.03
486 0.03
487 0.03
488 0.02
489 0.02
490 0.02
491 0.03
492 0.03
493 0.03
494 0.04
495 0.05
496 0.06
497 0.07
498 0.09
499 0.1
500 0.18
501 0.2
502 0.22
503 0.22
504 0.23
505 0.23
506 0.26
507 0.29
508 0.24
509 0.22
510 0.21
511 0.22
512 0.24
513 0.28
514 0.27
515 0.26
516 0.26
517 0.28
518 0.28
519 0.26
520 0.22
521 0.18
522 0.16
523 0.12
524 0.11
525 0.08
526 0.08
527 0.09
528 0.08
529 0.07
530 0.07
531 0.06
532 0.06
533 0.06
534 0.05
535 0.05
536 0.05
537 0.06
538 0.06
539 0.07
540 0.08
541 0.08
542 0.09
543 0.09
544 0.12
545 0.15
546 0.19
547 0.19
548 0.18
549 0.19
550 0.18
551 0.18
552 0.15
553 0.12
554 0.1
555 0.09
556 0.09
557 0.08
558 0.09
559 0.08
560 0.09
561 0.09
562 0.09
563 0.09
564 0.1
565 0.1
566 0.12
567 0.16
568 0.2
569 0.21
570 0.24
571 0.31
572 0.35
573 0.4
574 0.42
575 0.43
576 0.42
577 0.47
578 0.46
579 0.4
580 0.4
581 0.38
582 0.37
583 0.33
584 0.32
585 0.28
586 0.25
587 0.26
588 0.24
589 0.23
590 0.2
591 0.24
592 0.24
593 0.23
594 0.23
595 0.21
596 0.2
597 0.3
598 0.27
599 0.24
600 0.21
601 0.23
602 0.24
603 0.24
604 0.24
605 0.14
606 0.18
607 0.19
608 0.25
609 0.26
610 0.24
611 0.25
612 0.26
613 0.26
614 0.25
615 0.25
616 0.2
617 0.18
618 0.24
619 0.25
620 0.28
621 0.3
622 0.28
623 0.25
624 0.24
625 0.23
626 0.17
627 0.15
628 0.1
629 0.1
630 0.12
631 0.13
632 0.18
633 0.23
634 0.25
635 0.3
636 0.35
637 0.42
638 0.41
639 0.42
640 0.41
641 0.44
642 0.44
643 0.4
644 0.41
645 0.35
646 0.33
647 0.32
648 0.27
649 0.19
650 0.17
651 0.18
652 0.13
653 0.15
654 0.17
655 0.19
656 0.22
657 0.25
658 0.28
659 0.29
660 0.28
661 0.29
662 0.27
663 0.26
664 0.24
665 0.21
666 0.19
667 0.18
668 0.21
669 0.18
670 0.17
671 0.19
672 0.2
673 0.21
674 0.2
675 0.25
676 0.29
677 0.34
678 0.4
679 0.45
680 0.51
681 0.58
682 0.67
683 0.7
684 0.73
685 0.77
686 0.79
687 0.82
688 0.82
689 0.81
690 0.76
691 0.7
692 0.61
693 0.52
694 0.45
695 0.35
696 0.28
697 0.22
698 0.17
699 0.13
700 0.12
701 0.13
702 0.14
703 0.15
704 0.24
705 0.32
706 0.42
707 0.48
708 0.54
709 0.6
710 0.69
711 0.76
712 0.73
713 0.68
714 0.63
715 0.58
716 0.52
717 0.47
718 0.37
719 0.27
720 0.21
721 0.18
722 0.17
723 0.23
724 0.24
725 0.27
726 0.33
727 0.43
728 0.53
729 0.63
730 0.7
731 0.72
732 0.78
733 0.83
734 0.82
735 0.77
736 0.71
737 0.67
738 0.6
739 0.59
740 0.52
741 0.43
742 0.38
743 0.34
744 0.31
745 0.27
746 0.24
747 0.21
748 0.27
749 0.34
750 0.43
751 0.51
752 0.55
753 0.61
754 0.71
755 0.76
756 0.78
757 0.8
758 0.81
759 0.8
760 0.81
761 0.77
762 0.77
763 0.7
764 0.66
765 0.63
766 0.64
767 0.65
768 0.65
769 0.69
770 0.65
771 0.72
772 0.74
773 0.75
774 0.76
775 0.77
776 0.77
777 0.72
778 0.67
779 0.59
780 0.52
781 0.42
782 0.33
783 0.25
784 0.17
785 0.14
786 0.13
787 0.11
788 0.11
789 0.11
790 0.1
791 0.1
792 0.1
793 0.1
794 0.1
795 0.11
796 0.1
797 0.09
798 0.1
799 0.14
800 0.2
801 0.2
802 0.23
803 0.28
804 0.3
805 0.31
806 0.33
807 0.29
808 0.3
809 0.32
810 0.29
811 0.25
812 0.21
813 0.21
814 0.18
815 0.16
816 0.1
817 0.13
818 0.15
819 0.14
820 0.15
821 0.14
822 0.15
823 0.15
824 0.14
825 0.1
826 0.09
827 0.09
828 0.09
829 0.09
830 0.11
831 0.15
832 0.16
833 0.15
834 0.14
835 0.18
836 0.22
837 0.25
838 0.23
839 0.2
840 0.21
841 0.22
842 0.22
843 0.18
844 0.15
845 0.12
846 0.16
847 0.19
848 0.23
849 0.23
850 0.25
851 0.27
852 0.27
853 0.33
854 0.35
855 0.41
856 0.43
857 0.46
858 0.51
859 0.55
860 0.56
861 0.51
862 0.44
863 0.4
864 0.37
865 0.37
866 0.32
867 0.28
868 0.26
869 0.26
870 0.27
871 0.21
872 0.16
873 0.12
874 0.12
875 0.09
876 0.09
877 0.08
878 0.07
879 0.08
880 0.09
881 0.1
882 0.1
883 0.11
884 0.12
885 0.11
886 0.12
887 0.13
888 0.12
889 0.13
890 0.12
891 0.12
892 0.11
893 0.11
894 0.12
895 0.12
896 0.13
897 0.15
898 0.17
899 0.21
900 0.25
901 0.27
902 0.34
903 0.37
904 0.44
905 0.5
906 0.57
907 0.55
908 0.54
909 0.55
910 0.5
911 0.53
912 0.5
913 0.47
914 0.46
915 0.53
916 0.59