FuNGI

G2QSM4

Protein Details

Accession

G2QSM4

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
34-60	LSLPEPPSKKARRALKKGKTLPAKPAS	Hydrophilic
73-97	GQANGAKDGKKKKKERSPHGVWIGN	Hydrophilic
323-356	DSTKTNKPKSSQPQKEPPRTRTRTRKWWVNQLLG	Hydrophilic
381-404	AAAAARQKKQQKTQQSKHSKAGPS	Hydrophilic
424-451	TTTPTTTDGKDQKKKKGKESKEISYHTD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
40-57	PSKKARRALKKGKTLPAK
79-89	KDGKKKKKERS
436-441	KKKKGK

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 9.5, cyto 5.5, mito 5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR034225 Nop13/Rnp24_RRM1 IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	ttt:THITE_2108871 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12396 RRM1_Nop13p_fungi

Amino Acid Sequences

MAAKDPEPAAPEEPVATASSKKRKSAHPEIEVDLSLPEPPSKKARRALKKGKTLPAKPASSDDETDGKAAEDGQANGAKDGKKKKKERSPHGVWIGNLPFTTTKAELRKWLVDNSGGSIADDAITRVHMPTTKPAAGAGPKKTPENRGFAYVDFASFDANVAAIALSETELNGRKLLIKDSKNFEGRPKKEEPAVAAANGSGAKAALSGAKAAASGSTKIFVGNLAFNTTEDDLHAHFEKCGKIRWIKVATFEDSGKCKGYGWVNFEQPEAAAWAVKGFVKLRETVETLEDFMDEDPKAADGEGPAQGDDALKADDNDNDDDDSTKTNKPKSSQPQKEPPRTRTRTRKWWVNQLLGRTLKIELAEDDQTRYHKRFGKGAAAAAAARQKKQQKTQQSKHSKAGPSGADGDGDGDGGALTTTSSTTTTPTTTDGKDQKKKKGKESKEISYHTDISVARLTGAAVAPAGKKITFD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.17
3	0.15
4	0.19
5	0.26
6	0.36
7	0.4
8	0.46
9	0.51
10	0.58
11	0.67
12	0.72
13	0.74
14	0.72
15	0.72
16	0.69
17	0.67
18	0.57
19	0.48
20	0.37
21	0.27
22	0.2
23	0.16
24	0.16
25	0.15
26	0.18
27	0.28
28	0.34
29	0.42
30	0.49
31	0.59
32	0.66
33	0.75
34	0.83
35	0.83
36	0.87
37	0.88
38	0.89
39	0.88
40	0.82
41	0.81
42	0.79
43	0.72
44	0.63
45	0.59
46	0.56
47	0.5
48	0.47
49	0.4
50	0.34
51	0.32
52	0.3
53	0.25
54	0.19
55	0.15
56	0.14
57	0.14
58	0.12
59	0.12
60	0.15
61	0.18
62	0.18
63	0.19
64	0.23
65	0.23
66	0.27
67	0.37
68	0.44
69	0.51
70	0.6
71	0.7
72	0.77
73	0.85
74	0.89
75	0.88
76	0.87
77	0.87
78	0.86
79	0.79
80	0.69
81	0.65
82	0.57
83	0.47
84	0.38
85	0.3
86	0.22
87	0.19
88	0.23
89	0.17
90	0.21
91	0.25
92	0.27
93	0.31
94	0.35
95	0.4
96	0.39
97	0.4
98	0.36
99	0.34
100	0.33
101	0.3
102	0.27
103	0.21
104	0.18
105	0.16
106	0.13
107	0.11
108	0.1
109	0.08
110	0.05
111	0.06
112	0.07
113	0.07
114	0.08
115	0.1
116	0.12
117	0.18
118	0.24
119	0.25
120	0.25
121	0.25
122	0.27
123	0.31
124	0.35
125	0.33
126	0.33
127	0.33
128	0.38
129	0.41
130	0.46
131	0.44
132	0.45
133	0.42
134	0.41
135	0.41
136	0.36
137	0.37
138	0.29
139	0.24
140	0.18
141	0.16
142	0.11
143	0.1
144	0.09
145	0.05
146	0.05
147	0.04
148	0.04
149	0.04
150	0.03
151	0.03
152	0.03
153	0.03
154	0.03
155	0.03
156	0.05
157	0.08
158	0.08
159	0.09
160	0.09
161	0.12
162	0.13
163	0.19
164	0.25
165	0.27
166	0.32
167	0.38
168	0.44
169	0.44
170	0.44
171	0.48
172	0.5
173	0.49
174	0.49
175	0.49
176	0.45
177	0.44
178	0.44
179	0.38
180	0.33
181	0.32
182	0.25
183	0.21
184	0.18
185	0.16
186	0.14
187	0.12
188	0.05
189	0.04
190	0.04
191	0.04
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.05
196	0.05
197	0.05
198	0.05
199	0.05
200	0.06
201	0.06
202	0.07
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.07
208	0.07
209	0.07
210	0.07
211	0.07
212	0.08
213	0.08
214	0.08
215	0.1
216	0.1
217	0.09
218	0.07
219	0.08
220	0.07
221	0.09
222	0.11
223	0.09
224	0.09
225	0.12
226	0.14
227	0.14
228	0.17
229	0.19
230	0.21
231	0.23
232	0.31
233	0.33
234	0.31
235	0.36
236	0.36
237	0.34
238	0.32
239	0.31
240	0.26
241	0.23
242	0.24
243	0.19
244	0.16
245	0.14
246	0.16
247	0.2
248	0.21
249	0.25
250	0.27
251	0.29
252	0.3
253	0.29
254	0.26
255	0.21
256	0.17
257	0.12
258	0.08
259	0.06
260	0.05
261	0.05
262	0.06
263	0.06
264	0.07
265	0.07
266	0.1
267	0.11
268	0.13
269	0.15
270	0.17
271	0.18
272	0.17
273	0.18
274	0.16
275	0.15
276	0.14
277	0.12
278	0.1
279	0.09
280	0.1
281	0.08
282	0.08
283	0.07
284	0.07
285	0.07
286	0.07
287	0.07
288	0.05
289	0.07
290	0.09
291	0.09
292	0.08
293	0.08
294	0.09
295	0.08
296	0.08
297	0.07
298	0.06
299	0.06
300	0.07
301	0.07
302	0.09
303	0.11
304	0.12
305	0.12
306	0.12
307	0.12
308	0.13
309	0.13
310	0.14
311	0.15
312	0.18
313	0.22
314	0.26
315	0.3
316	0.32
317	0.41
318	0.5
319	0.58
320	0.64
321	0.68
322	0.74
323	0.8
324	0.88
325	0.87
326	0.85
327	0.85
328	0.81
329	0.82
330	0.83
331	0.82
332	0.82
333	0.82
334	0.84
335	0.79
336	0.83
337	0.8
338	0.78
339	0.72
340	0.65
341	0.65
342	0.56
343	0.5
344	0.4
345	0.34
346	0.26
347	0.23
348	0.19
349	0.13
350	0.15
351	0.18
352	0.18
353	0.19
354	0.19
355	0.23
356	0.27
357	0.28
358	0.31
359	0.34
360	0.37
361	0.42
362	0.44
363	0.5
364	0.47
365	0.47
366	0.42
367	0.36
368	0.33
369	0.29
370	0.31
371	0.23
372	0.22
373	0.27
374	0.34
375	0.4
376	0.5
377	0.57
378	0.61
379	0.71
380	0.79
381	0.83
382	0.86
383	0.85
384	0.82
385	0.82
386	0.76
387	0.68
388	0.65
389	0.56
390	0.48
391	0.45
392	0.38
393	0.3
394	0.24
395	0.22
396	0.15
397	0.13
398	0.09
399	0.06
400	0.05
401	0.05
402	0.05
403	0.03
404	0.03
405	0.03
406	0.04
407	0.05
408	0.06
409	0.07
410	0.09
411	0.11
412	0.12
413	0.13
414	0.17
415	0.21
416	0.22
417	0.3
418	0.37
419	0.46
420	0.54
421	0.61
422	0.68
423	0.74
424	0.8
425	0.82
426	0.84
427	0.83
428	0.85
429	0.86
430	0.86
431	0.85
432	0.82
433	0.78
434	0.73
435	0.65
436	0.55
437	0.51
438	0.4
439	0.34
440	0.34
441	0.27
442	0.21
443	0.19
444	0.19
445	0.16
446	0.16
447	0.13
448	0.09
449	0.12
450	0.12
451	0.14
452	0.16

G2QSM4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer