Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0UIH0

Protein Details
Accession Q0UIH0    Localization Confidence Low Confidence Score 8.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-70FTIFRWKADRTARQKRTNICHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 11, cyto 9.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039171  Cwc2/Slt11  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034356  Slt11_RRM  
Gene Ontology GO:0071014  C:post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0071006  C:U2-type catalytic step 1 spliceosome  
GO:0071007  C:U2-type catalytic step 2 spliceosome  
GO:0036002  F:pre-mRNA binding  
GO:0017070  F:U6 snRNA binding  
KEGG pno:SNOG_08444  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12265  RRM_SLT11  
Amino Acid Sequences MPPQIKQDLNRSGWETTDFPSVCEKCLPDNPYVQMLKEDHGAECKICTRPFTIFRWKADRTARQKRTNICLTCARLKNCCQCCMLDLSFGLPIVVRDAALKMVAPGPQSDINRQYYAQEHEREIEEGRGAMEAYEKTDEKARELLKRLAQSEPYYKKQRRLEAEGEESSGQKALPAPGGSGESSGSGRAPGPIRTRDTRGTFSGRGGARPARGGRMGGPAAEPSPQDWLPPSDPNVASLFVTGVEDDLPEHELRTHFAQYGKLRSLVCSHRAHCAYVNYVNRQDAENAAETLKGKVVIKGCPMRVTWGKPKQLDSLDQNVRMQYAKEGRQAAGPRRTAAAQAAMEAAPQNNLDSMTIAPPPGADEETDYATLRGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.35
3 0.28
4 0.34
5 0.29
6 0.27
7 0.35
8 0.34
9 0.33
10 0.34
11 0.34
12 0.31
13 0.38
14 0.4
15 0.35
16 0.4
17 0.4
18 0.44
19 0.44
20 0.38
21 0.36
22 0.34
23 0.32
24 0.31
25 0.29
26 0.23
27 0.26
28 0.26
29 0.21
30 0.22
31 0.25
32 0.26
33 0.26
34 0.27
35 0.26
36 0.32
37 0.37
38 0.42
39 0.49
40 0.49
41 0.54
42 0.6
43 0.59
44 0.6
45 0.64
46 0.67
47 0.66
48 0.71
49 0.74
50 0.76
51 0.8
52 0.8
53 0.79
54 0.79
55 0.71
56 0.65
57 0.63
58 0.59
59 0.61
60 0.61
61 0.55
62 0.52
63 0.57
64 0.62
65 0.59
66 0.57
67 0.49
68 0.43
69 0.42
70 0.43
71 0.36
72 0.28
73 0.23
74 0.2
75 0.19
76 0.18
77 0.16
78 0.09
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.07
89 0.09
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.13
94 0.18
95 0.19
96 0.23
97 0.26
98 0.28
99 0.29
100 0.29
101 0.28
102 0.26
103 0.3
104 0.32
105 0.3
106 0.27
107 0.28
108 0.29
109 0.28
110 0.25
111 0.21
112 0.15
113 0.12
114 0.11
115 0.09
116 0.08
117 0.07
118 0.08
119 0.07
120 0.08
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.17
125 0.17
126 0.17
127 0.22
128 0.24
129 0.27
130 0.32
131 0.36
132 0.35
133 0.38
134 0.38
135 0.35
136 0.35
137 0.32
138 0.37
139 0.37
140 0.4
141 0.46
142 0.48
143 0.54
144 0.57
145 0.62
146 0.59
147 0.6
148 0.58
149 0.54
150 0.55
151 0.47
152 0.43
153 0.36
154 0.3
155 0.23
156 0.18
157 0.12
158 0.07
159 0.08
160 0.07
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.1
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.08
176 0.09
177 0.13
178 0.17
179 0.2
180 0.25
181 0.27
182 0.31
183 0.34
184 0.36
185 0.35
186 0.34
187 0.35
188 0.32
189 0.3
190 0.32
191 0.27
192 0.24
193 0.24
194 0.23
195 0.18
196 0.21
197 0.22
198 0.18
199 0.18
200 0.18
201 0.17
202 0.19
203 0.19
204 0.15
205 0.15
206 0.13
207 0.13
208 0.13
209 0.12
210 0.07
211 0.12
212 0.11
213 0.11
214 0.12
215 0.15
216 0.16
217 0.18
218 0.21
219 0.22
220 0.22
221 0.24
222 0.24
223 0.21
224 0.18
225 0.16
226 0.14
227 0.08
228 0.08
229 0.06
230 0.05
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.09
239 0.09
240 0.11
241 0.14
242 0.15
243 0.15
244 0.17
245 0.23
246 0.25
247 0.3
248 0.3
249 0.31
250 0.29
251 0.29
252 0.33
253 0.32
254 0.35
255 0.35
256 0.34
257 0.39
258 0.4
259 0.41
260 0.38
261 0.36
262 0.33
263 0.35
264 0.39
265 0.35
266 0.37
267 0.36
268 0.34
269 0.32
270 0.29
271 0.23
272 0.21
273 0.18
274 0.16
275 0.15
276 0.16
277 0.15
278 0.15
279 0.15
280 0.14
281 0.13
282 0.16
283 0.19
284 0.21
285 0.28
286 0.33
287 0.34
288 0.35
289 0.34
290 0.37
291 0.4
292 0.44
293 0.47
294 0.5
295 0.56
296 0.56
297 0.59
298 0.59
299 0.57
300 0.56
301 0.51
302 0.52
303 0.51
304 0.51
305 0.49
306 0.42
307 0.4
308 0.34
309 0.29
310 0.27
311 0.29
312 0.31
313 0.35
314 0.38
315 0.37
316 0.43
317 0.49
318 0.5
319 0.51
320 0.48
321 0.44
322 0.44
323 0.44
324 0.39
325 0.35
326 0.32
327 0.23
328 0.22
329 0.22
330 0.19
331 0.19
332 0.18
333 0.16
334 0.11
335 0.11
336 0.11
337 0.1
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.12
342 0.13
343 0.14
344 0.13
345 0.12
346 0.11
347 0.13
348 0.14
349 0.14
350 0.12
351 0.15
352 0.17
353 0.2
354 0.22
355 0.21