Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G2RDA6

Protein Details
Accession G2RDA6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MSAEANSKKKPQPNKPKGILKKPATVPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-22KKKPQPNKPKGILKK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11, cyto 7.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039693  Rtr1/RPAP2  
IPR007308  Rtr1/RPAP2_dom  
IPR038534  Rtr1/RPAP2_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0017018  F:myosin phosphatase activity  
GO:0043175  F:RNA polymerase core enzyme binding  
GO:0008420  F:RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat phosphatase activity  
KEGG ttt:THITE_134942  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04181  RPAP2_Rtr1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51479  ZF_RTR1  
Amino Acid Sequences MSAEANSKKKPQPNKPKGILKKPATVPQSPPLANPSKPNNSQPDPSTAARIRLLQKLRDTELKPPVPLSTFEQLIALPRHASPPYSAARPHPADAALFLALLRDFSPAEYLDLVEERNCVSKCGYALCGRPRRALEGAYKLRWGGGGVGKTAELNKWCSDACALRALHLKVQLDHPSYERSAEAGGKMVVKLELREEAGHKEEKEKGAGTEDKNLKEEDEEAVKSAPAATPAADAAAGPVASRGTDEDRERLARDMAQLEIDKAKRARQNASALAAERGDPAAGWLAGQSRVEVTIKEQTVDEPVQPPVPGEDAHLYIEGYKPTFGACATKRHPEEGADSEEDDDEFPTIRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.86
3 0.9
4 0.92
5 0.92
6 0.91
7 0.85
8 0.84
9 0.79
10 0.78
11 0.72
12 0.67
13 0.62
14 0.58
15 0.6
16 0.51
17 0.47
18 0.46
19 0.46
20 0.43
21 0.45
22 0.47
23 0.48
24 0.52
25 0.58
26 0.59
27 0.58
28 0.62
29 0.57
30 0.55
31 0.52
32 0.48
33 0.49
34 0.43
35 0.41
36 0.38
37 0.41
38 0.38
39 0.41
40 0.45
41 0.42
42 0.46
43 0.47
44 0.5
45 0.52
46 0.5
47 0.5
48 0.55
49 0.52
50 0.47
51 0.43
52 0.41
53 0.34
54 0.35
55 0.32
56 0.26
57 0.24
58 0.23
59 0.22
60 0.2
61 0.23
62 0.22
63 0.18
64 0.15
65 0.15
66 0.18
67 0.18
68 0.19
69 0.16
70 0.19
71 0.22
72 0.24
73 0.25
74 0.26
75 0.33
76 0.35
77 0.34
78 0.3
79 0.28
80 0.24
81 0.23
82 0.21
83 0.13
84 0.1
85 0.09
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.08
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.08
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.13
108 0.15
109 0.15
110 0.17
111 0.19
112 0.17
113 0.23
114 0.31
115 0.39
116 0.39
117 0.42
118 0.41
119 0.43
120 0.41
121 0.39
122 0.35
123 0.36
124 0.39
125 0.36
126 0.35
127 0.31
128 0.29
129 0.26
130 0.21
131 0.14
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.09
141 0.11
142 0.11
143 0.12
144 0.12
145 0.12
146 0.14
147 0.13
148 0.13
149 0.16
150 0.16
151 0.17
152 0.21
153 0.21
154 0.22
155 0.24
156 0.23
157 0.18
158 0.21
159 0.23
160 0.21
161 0.21
162 0.2
163 0.19
164 0.19
165 0.19
166 0.15
167 0.11
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.1
183 0.11
184 0.12
185 0.14
186 0.17
187 0.16
188 0.18
189 0.2
190 0.21
191 0.21
192 0.2
193 0.17
194 0.2
195 0.24
196 0.22
197 0.28
198 0.31
199 0.31
200 0.31
201 0.31
202 0.26
203 0.22
204 0.22
205 0.15
206 0.14
207 0.13
208 0.12
209 0.13
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.09
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.04
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.07
231 0.09
232 0.14
233 0.16
234 0.19
235 0.22
236 0.24
237 0.25
238 0.25
239 0.22
240 0.19
241 0.2
242 0.19
243 0.16
244 0.17
245 0.17
246 0.16
247 0.21
248 0.2
249 0.22
250 0.22
251 0.28
252 0.3
253 0.34
254 0.37
255 0.38
256 0.45
257 0.44
258 0.46
259 0.42
260 0.39
261 0.36
262 0.31
263 0.25
264 0.18
265 0.15
266 0.11
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.08
271 0.07
272 0.08
273 0.09
274 0.11
275 0.11
276 0.11
277 0.09
278 0.12
279 0.12
280 0.12
281 0.14
282 0.2
283 0.2
284 0.21
285 0.21
286 0.19
287 0.24
288 0.25
289 0.24
290 0.18
291 0.2
292 0.21
293 0.2
294 0.2
295 0.17
296 0.17
297 0.15
298 0.16
299 0.17
300 0.17
301 0.18
302 0.18
303 0.17
304 0.16
305 0.18
306 0.17
307 0.15
308 0.14
309 0.12
310 0.12
311 0.13
312 0.13
313 0.19
314 0.2
315 0.28
316 0.33
317 0.43
318 0.45
319 0.47
320 0.49
321 0.43
322 0.46
323 0.42
324 0.43
325 0.36
326 0.34
327 0.32
328 0.3
329 0.28
330 0.22
331 0.17
332 0.12